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「Fluorome」(早稲田大学 園池公毅教授)のデータをver 2.01に更新しました

作成日: 2011年10月08日(土)09:00

「Fluorome」は、シアノバクテリアの変異株ごとに表現型としてクロロフィル蛍光強度の時間変化を取得したデータベース(早稲田大学 園池公毅教授)です。今回の更新(オリジナルデータver. 2.01相当)では、データが多数追加され、変異体間の類似度距離の計算方法が変更されています。

「The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis」 (日立製作所) を追加しました

作成日: 2011年10月08日(土)09:00

「The Rice Growth Monitoring for the Phenotypic Functional Analysis」はイネの発芽から開花までの生育画像を数分から数時間間隔で継続的に取得できる システムによる、表現型の網羅的解析結果のデータベース (日立製作所)です。

「INOH」 (the INOH database project) を追加しました

作成日: 2011年10月08日(土)09:00

「INOH」は専門家が文献から抽出した生体内分子機序に関する知識(パスウェイ)を、様々な機械処理が可能な形式で電子化したデータベース(the INOH database project)です。

「Medaka Full-length cDNA Database」 (基礎生物学研究所 成瀬清准教授)を追加しました。

作成日: 2011年08月29日(月)09:00

「Medaka Full-length cDNA Database」はメダカ近交系Hd-rRⅡ1の完全長cDNAライブラリー11種に由来するcDNA配列のデータベース (基礎生物学研究所 成瀬清准教授)です。

「D-HaploDB」(九州大学 林健志名誉教授)を追加しました

作成日: 2011年08月25日(木)09:00

 「D-HaploDB」は全胞状奇胎を用いて直接決定した日本人ゲノムのハプロタイ プと連鎖不平衡構造のデータベース(九州大学 林健志名誉教授)です。  

「RIKEN SSBC」(理化学研究所 横山茂之領域長)を追加しました

作成日: 2011年08月25日(木)09:00

「RIKEN SSBC」は高等動植物等タンパク質の結晶観察画像・X線回折画像・付随実験情報のデータベース(理化学研究所 横山茂之領域長)です。

「MDeR」(科学技術振興機構)を「生命科学系データベースアーカイブ」に追加しました

作成日: 2011年03月29日(火)11:22

「MDeR」(The metadata element repository in life sciences)はライフサイエンス分野のメタデータ要素のレポジトリです。文部科学省委託研究開発事業 「統合データベースプロジェクト」により作成・公開されているものです。

「Plabrain DB」(京都大学 阿形清和教授ら)を追加しました

作成日: 2011年03月29日(火)11:22

「Plabrain DB」はプラナリアの神経回路形成に関わる遺伝子群の単一細胞での発現情報と、Whole-mount in situ hybridizationおよび組織免疫染色による画像データを収録したものです。

このデータベースの作成者は阿形清和 (京都大学) ・西村周泰 (京都大学)・西村理 (京都大学)・林哲太郎 (理化学研究所)・樽井寛(理化学研究所)です。


「PGE」(ERATO土居バイオアシンメトリプロジェクト)を追加しました

作成日: 2011年03月29日(火)11:22

「PGE」は、マウス胚の初期発生における遺伝子発現パターンデータベースです。このデータベースは、ERATO土居バイオアシンメトリプロジェクトと独立行政法人科学技術振興機構により作成されました。

「Open TG-GATEs」(トキシコゲノミクスプロジェクト)を追加しました

作成日: 2011年03月29日(火)11:22

「Open TG-GATEs」は、131の化合物をラット個体およびラット・ヒト肝細胞へ曝露した際の遺伝子発現と毒性のデータベースです。このデータベースは、独立行政法人医薬基盤研究所、国立医薬品食品衛生研究所および製薬企業(15社)が参画したトキシコゲノミクスプロジェクトにより作成されました。