ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX423951 | MC3T3-E1
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◣ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672854: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672855: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Gins2 ↻ ≫
Cdc25c ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Nlgn2 ↻ ≫
Tmem256 ↻ ≫
Top2a ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Fggy ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Zmynd8 ↻ ≫
Tmem218 ↻ ≫
Dusp19 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Dicer1 ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Ptpn3 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Brwd3 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Prr11 ↻ ≫
Ska2 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Itgb3 ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Ogn ↻ ≫
Bbx ↻ ≫
Zfp383 ↻ ≫
Zfp27 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Prss22 ↻ ≫
Brwd1 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Metrnl ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Hcn3 ↻ ≫
Ppp2r1a ↻ ≫
Hoxa4 ↻ ≫
Nrbf2 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Robo3 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Il34 ↻ ≫
Ptpra ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Fgd2 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Hdac7 ↻ ≫
Cacna1h ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Ankrd13b ↻ ≫
Tifa ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Tpst1 ↻ ≫
Angpt4 ↻ ≫
Slc25a22 ↻ ≫
Pidd1 ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Ttyh3 ↻ ≫
Ltbp3 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ackr4 ↻ ≫
Trip12 ↻ ≫
Fbxo36 ↻ ≫
Agpat3 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Odf3l1 ↻ ≫
Mgp ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Ncor2 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Snta1 ↻ ≫
Zbtb5 ↻ ≫
Zfp474 ↻ ≫
Shb ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Coro7 ↻ ≫
Dnaja3 ↻ ≫
Kcnk2 ↻ ≫
Macrod1 ↻ ≫
Glt28d2 ↻ ≫
Spred2 ↻ ≫
Ifi44l ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Drg2 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Znrf3 ↻ ≫
B4galt5 ↻ ≫
Gnb2 ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Fam20a ↻ ≫
Crybb1 ↻ ≫
Cryba4 ↻ ≫
Atp5g3 ↻ ≫
Zfp386 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
C87436 ↻ ≫
Denn2b ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Panx3 ↻ ≫
Acyp1 ↻ ≫
Zc2hc1c ↻ ≫
Ankrd40 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Tmem262 ↻ ≫
Vps51 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Nkx1-1 ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Borcs6 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Agk ↻ ≫
Dmp1 ↻ ≫
Smim17 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Palld ↻ ≫
Abcd2 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Trp53rka ↻ ≫
Chd3 ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Slc6a7 ↻ ≫
Ndufs1 ↻ ≫
Eef1b2 ↻ ≫
Them6 ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
Fyb ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Mas1 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Otos ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Ppat ↻ ≫
Paics ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Arhgap19 ↻ ≫
Endou ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Rrp12 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Pmp22 ↻ ≫
Gcnt1 ↻ ≫
Wdr35 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Tmem178 ↻ ≫
Rbms1 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Gm536 ↻ ≫
Mylk3 ↻ ≫
Olfml3 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Yipf4 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Sebox ↻ ≫
Gm4861 ↻ ≫
Lpcat2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Col6a5 ↻ ≫
Bod1l ↻ ≫
Gtf2i ↻ ≫
Tirap ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Csf1 ↻ ≫
Cldn12 ↻ ≫
Rasgrf1 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Pde8a ↻ ≫
Loxl2 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Clip4 ↻ ≫
Klhl30 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Tmem100 ↻ ≫
Rad51c ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Smarca2 ↻ ≫
Bbc3 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Klhl33 ↻ ≫
Echs1 ↻ ≫
Tbc1d16 ↻ ≫
Ccdc40 ↻ ≫
Agpat1 ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Garre1 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Atp8b4 ↻ ≫
Cacna1g ↻ ≫
Limch1 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Nvl ↻ ≫
Dhx33 ↻ ≫
Mrpl21 ↻ ≫
Ighmbp2 ↻ ≫
Zfp41 ↻ ≫
Sema4d ↻ ≫
Ciao2b ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Adamtsl4 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Ephb2 ↻ ≫
Mlec ↻ ≫
Bcs1l ↻ ≫
Zfp142 ↻ ≫
Akt1s1 ↻ ≫
Tbc1d17 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Snx17 ↻ ≫
Eif2b4 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Nlrp10 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Lgals2 ↻ ≫
Gipc1 ↻ ≫
Podnl1 ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Gpr84 ↻ ≫
Stpg3 ↻ ≫
Nelfb ↻ ≫
Aars2 ↻ ≫
Kmt5c ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Dab2 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Tmem53 ↻ ≫
Armh1 ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Tmem204 ↻ ≫
Gm2102 ↻ ≫
Eif1ad ↻ ≫
Banf1 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Fmn1 ↻ ≫
Bmp2k ↻ ≫
N4bp2 ↻ ≫
Pik3r1 ↻ ≫
Cmbl ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Gxylt2 ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Gdpd5 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Vamp4 ↻ ≫
Rcc2 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Zfp408 ↻ ≫
Arhgap1 ↻ ≫
Rasgrp3 ↻ ≫
Ablim1 ↻ ≫
Fut10 ↻ ≫
Pdlim2 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Stx18 ↻ ≫
Mapt ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Bicral ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
Gabrr2 ↻ ≫
Gpd2 ↻ ≫
Ect2 ↻ ≫
Pgpep1l ↻ ≫
Atxn2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Aldh3a1 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Rpl24 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Gpat2 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Eif4g3 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Ndufa5 ↻ ≫
Asb15 ↻ ≫
Znrd1as ↻ ≫
Znrd1 ↻ ≫
Ssbp1 ↻ ≫
Mrps18c ↻ ≫
Helq ↻ ≫
Gpsm1 ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Krtap1-4 ↻ ≫
Tle2 ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Gprc5a ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Gucd1 ↻ ≫
Snrpd3 ↻ ≫
Them4 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Gtf3c3 ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Hsf4 ↻ ≫
Fbxl8 ↻ ≫
Tradd ↻ ≫
Mccc1 ↻ ≫
Mindy2 ↻ ≫
Cdh15 ↻ ≫
Bcar3 ↻ ≫
Wdr36 ↻ ≫
Mrps30 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Mtarc1 ↻ ≫
Fnbp1 ↻ ≫
Mrpl12 ↻ ≫
Plscr2 ↻ ≫
Supt7l ↻ ≫
Slc4a1ap ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Ptn ↻ ≫
Nrep ↻ ≫
Jdp2 ↻ ≫
Ccn3 ↻ ≫
Reep4 ↻ ≫
Hr ↻ ≫
Tcam1 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Tef ↻ ≫
Sfr1 ↻ ≫
Pik3ip1 ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Uchl5 ↻ ≫
Ro60 ↻ ≫
Tyw5 ↻ ≫
Maip1 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Uap1 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Zdhhc6 ↻ ≫
Vti1a ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Emp1 ↻ ≫
Fam71f1 ↻ ≫
Ppp1r11 ↻ ≫
Prpf40a ↻ ≫
Arl6ip6 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Rrp15 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Gpr146 ↻ ≫
Etfb ↻ ≫
Cldnd2 ↻ ≫
Fads6 ↻ ≫
Rad9b ↻ ≫
Ccz1 ↻ ≫
Steap4 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Tut1 ↻ ≫
Ints1 ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Sirt4 ↻ ≫
Ift46 ↻ ≫
Arcn1 ↻ ≫
Kbtbd11 ↻ ≫
Tekt3 ↻ ≫
Arrb1 ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Mdh1b ↻ ≫
Fastkd2 ↻ ≫
Nfat5 ↻ ≫
Cacng2 ↻ ≫
Sec62 ↻ ≫
Rin3 ↻ ≫
Hip1 ↻ ≫
Nupr1 ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Snai3 ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
Klhdc8b ↻ ≫
Ccdc71 ↻ ≫
Slc26a11 ↻ ≫
Sgsh ↻ ≫
Mrpl16 ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
Rpf1 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Gm13287 ↻ ≫
Gm13288 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Mettl25 ↻ ≫
Ccdc59 ↻ ≫
Ap5b1 ↻ ≫
Antxr1 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Mtg1 ↻ ≫
Got1l1 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Arl14ep ↻ ≫
Ttc26 ↻ ≫
Arhgdib ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Ndc1 ↻ ≫
Fkbpl ↻ ≫
Mtmr14 ↻ ≫
Peli3 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Rasl11b ↻ ≫
Ptcd2 ↻ ≫
Mrps27 ↻ ≫
Krtap4-7 ↻ ≫
Prr7 ↻ ≫
Fmod ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Sf3a3 ↻ ≫
Uvssa ↻ ≫
Coq3 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Pld1 ↻ ≫
Pus7 ↻ ≫
Rint1 ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Rpia ↻ ≫
Gja5 ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Tiam2 ↻ ≫
Tjap1 ↻ ≫
Decr1 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Krt81 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Gm5431 ↻ ≫
Pitpnc1 ↻ ≫
Baalc ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Prrx2 ↻ ≫
Rgl2 ↻ ≫
Rdh14 ↻ ≫
Zfp81 ↻ ≫
Usp44 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Prkce ↻ ≫
Fbxo24 ↻ ≫
Lrch4 ↻ ≫
Krtap3-2 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Zfp672 ↻ ≫
Pradc1 ↻ ≫
Cct7 ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Zfp959 ↻ ≫
Ccdc170 ↻ ≫
Cpq ↻ ≫
Tacc2 ↻ ≫
Sh3bp5l ↻ ≫
Med13 ↻ ≫
Ints12 ↻ ≫
Gstcd ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Pknox2 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Ccni ↻ ≫
2010109A12Rik ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Pappa2 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Pfkm ↻ ≫
Senp1 ↻ ≫
Adamts5 ↻ ≫
St7 ↻ ≫
Acbd6 ↻ ≫
Tnfrsf11b ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Lrp5 ↻ ≫
Rab30 ↻ ≫
Kank2 ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Sar1b ↻ ≫
Tpm4 ↻ ≫
Cdrt4 ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Jund ↻ ≫
Iqcn ↻ ≫
Mmp28 ↻ ≫
Tsc1 ↻ ≫
Tomm20 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Capn2 ↻ ≫
Tmem205 ↻ ≫
Ccdc159 ↻ ≫
Agbl5 ↻ ≫
Tmem101 ↻ ≫
Edc4 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Qtrt2 ↻ ≫
Ccdc191 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Frg2f1 ↻ ≫
Foxj3 ↻ ≫
Gspt1 ↻ ≫
Nwd1 ↻ ≫
Adm ↻ ≫
Usp32 ↻ ≫
Sf3b3 ↻ ≫
Cog4 ↻ ≫
Ints4 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Serpinh1 ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Tbcd ↻ ≫
Zfp704 ↻ ≫
Acyp2 ↻ ≫
Kmt2d ↻ ≫
Cbx7 ↻ ≫
Hus1 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Sned1 ↻ ≫
Armh3 ↻ ≫
Hps6 ↻ ≫
Anxa1 ↻ ≫
Col8a2 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Id3 ↻ ≫
Zfp335 ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Maats1 ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Las1l ↻ ≫
Cnot6 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Kmt2e ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Pdss1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Ccdc174 ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Armc1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Pcolce ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Bzw1 ↻ ≫
Rangap1 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
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