ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX020169 | Liver
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

◢ SRX003140: 3T3-L1

◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX150789: C17-2

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◢ SRX868178: ES cells

◢ SRX087266: F9

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◢ SRX467367: IDG-SW3

◢ SRX020167: Liver

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◢ SRX6658447: Liver

◢ SRX6658448: Liver

◢ SRX6658449: Liver

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Cdkn1b ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Qrich1 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Adamts1 ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Tle2 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Arhgef7 ↻ ≫
Itprip ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Foxj2 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Slc8b1 ↻ ≫
Etnppl ↻ ≫
Stt3a ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Ptch1 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Cdkn2c ↻ ≫
Sema6c ↻ ≫
Colec11 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Col24a1 ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Zfp874b ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Ost4 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Sqor ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Ldhd ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Ttbk1 ↻ ≫
Tle3 ↻ ≫
Alad ↻ ≫
Lipg ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Ifit3 ↻ ≫
Lrrc3 ↻ ≫
Omd ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Gcnt2 ↻ ≫
Cyp3a59 ↻ ≫
Igsf10 ↻ ≫
Mafg ↻ ≫
Nr0b2 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
A530016L24Rik ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Padi4 ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Ttc39c ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
Foxn4 ↻ ≫
Narf ↻ ≫
Cntfr ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Asgr2 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Adgrl1 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Gpr182 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
Serpina5 ↻ ≫
Glyctk ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Itih3 ↻ ≫
Serpina3m ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Por ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Rdh7 ↻ ≫
F12 ↻ ≫
Ifih1 ↻ ≫
Zdhhc8 ↻ ≫
Sbk1 ↻ ≫
Mospd3 ↻ ≫
Zfp141 ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Cyp2b9 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Tchhl1 ↻ ≫
Slc25a13 ↻ ≫
Cks2 ↻ ≫
Lrmda ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Serpina3k ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Nr2c2ap ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Cyp20a1 ↻ ≫
Mylip ↻ ≫
Ly6g2 ↻ ≫
Il11ra2 ↻ ≫
Gm2002 ↻ ≫
Gm13305 ↻ ≫
LOC100861969 ↻ ≫
Ccl21b ↻ ≫
Fam25c ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Lgals9 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Slc17a4 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
1110038F14Rik ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Fzd8 ↻ ≫
Mn1 ↻ ≫
Ace3 ↻ ≫
Ccser2 ↻ ≫
Car5a ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Nup153 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Gpi1 ↻ ≫
Ttc36 ↻ ≫
Tmem25 ↻ ≫
Dppa3 ↻ ≫
Hal ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Ssbp3 ↻ ≫
Ttc32 ↻ ≫
Adgrg5 ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
Gadd45a ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Rabgef1 ↻ ≫
Foxo3 ↻ ≫
Acox2 ↻ ≫
Neurl3 ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Sacm1l ↻ ≫
Zfp740 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
G6pc ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Rbm47 ↻ ≫
Rarres2 ↻ ≫
Slc9a3r2 ↻ ≫
Ces2a ↻ ≫
Epha1 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Timd2 ↻ ≫
Rgl3 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Cyp2f2 ↻ ≫
Lgals3bp ↻ ≫
Tmem171 ↻ ≫
Tmigd1 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Alb ↻ ≫
Qsox1 ↻ ≫
9530077C05Rik ↻ ≫
Anln ↻ ≫
Snrpc ↻ ≫
Stra6l ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Top2b ↻ ≫
Armc7 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Akr1b7 ↻ ≫
Otulinl ↻ ≫
Got2 ↻ ≫
Gbp11 ↻ ≫
Galk2 ↻ ≫
Cops2 ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Sult2a4 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Cyp21a1 ↻ ≫
Iyd ↻ ≫
Rps27l ↻ ≫
Lck ↻ ≫
Sec31a ↻ ≫
Acnat2 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Ndrg2 ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Esam ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Irak1bp1 ↻ ≫
Cmah ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Sardh ↻ ≫
Hsd11b1 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Bin2 ↻ ≫
Id3 ↻ ≫
Susd1 ↻ ≫
Jade1 ↻ ≫
Sirt3 ↻ ≫
Psmd13 ↻ ≫
Oit3 ↻ ≫
Wwc2 ↻ ≫
Apof ↻ ≫
Stat2 ↻ ≫
Mrps30 ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Pdcd4 ↻ ≫
Dlc1 ↻ ≫
Rsad2 ↻ ≫
Rfwd3 ↻ ≫
Cyp2c55 ↻ ≫
Lman1 ↻ ≫
Upp2 ↻ ≫
Pdss1 ↻ ≫
Atp2b2 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Slc17a2 ↻ ≫
Ing4 ↻ ≫
Slc30a10 ↻ ≫
Wfdc21 ↻ ≫
Sgms2 ↻ ≫
Eif1 ↻ ≫
Acap1 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
P4hb ↻ ≫
Arhgdia ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
Stk40 ↻ ≫
Surf6 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Itih1 ↻ ≫
Rassf4 ↻ ≫
Cyp3a25 ↻ ≫
Tnks1bp1 ↻ ≫
Knl1 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Tmtc3 ↻ ≫
Cep290 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Txndc5 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Tmprss6 ↻ ≫
Unc93a ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Mup2 ↻ ≫
Mup22 ↻ ≫
Mup11 ↻ ≫
Slc25a42 ↻ ≫
Fmc1 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Ugt1a1 ↻ ≫
Igfbp1 ↻ ≫
Slc26a1 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Anxa6 ↻ ≫
Ric8a ↻ ≫
Bet1l ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Fgg ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Uba7 ↻ ≫
Ing1 ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Ttc7b ↻ ≫
Ptpn3 ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Zfr ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Tymp ↻ ≫
Sco2 ↻ ≫
Odf3b ↻ ≫
Cacybp ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Ireb2 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Igf2bp3 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Tbcb ↻ ≫
Polr2i ↻ ≫
Ovol3 ↻ ≫
Hgs ↻ ≫
Arl16 ↻ ≫
Atf6 ↻ ≫
Lyst ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Plk3 ↻ ≫
Albfm1 ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Dhx58 ↻ ≫
H2-Q9 ↻ ≫
H2-Q7 ↻ ≫
H2-Q8 ↻ ≫
H2-Q6 ↻ ≫
Rpl24 ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Pkp4 ↻ ≫
Ccdc148 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Spns2 ↻ ≫
Tmbim6 ↻ ≫
Afp ↻ ≫
Zbtb44 ↻ ≫
Nat1 ↻ ≫
Nat2 ↻ ≫
Prkag3 ↻ ≫
Urad ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Abcb11 ↻ ≫
Ccdc174 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Shtn1 ↻ ≫
Hlx ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Aifm1 ↻ ≫
Gcsam ↻ ≫
Gdf2 ↻ ≫
Rnf4 ↻ ≫
Comt ↻ ≫
Tpr ↻ ≫
Odr4 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Hbs1l ↻ ≫
Nodal ↻ ≫
Hikeshi ↻ ≫
Dhx33 ↻ ≫
Zfp395 ↻ ≫
Ackr4 ↻ ≫
Usf2 ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Dennd4a ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Rpl9 ↻ ≫
Lias ↻ ≫
Plcg1 ↻ ≫
Slc40a1 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Mpc2 ↻ ≫
Dcaf6 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Nlrp10 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Ndufa10 ↻ ≫
Cryga ↻ ≫
Ndufs3 ↻ ≫
Kbtbd4 ↻ ≫
Gm4951 ↻ ≫
Mup9 ↻ ≫
Mup13 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
Ogt ↻ ≫
Sult2a8 ↻ ≫
Tcirg1 ↻ ≫
Rabggta ↻ ≫
Smg7 ↻ ≫
Ube2l6 ↻ ≫
She ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Abcd2 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Arsg ↻ ≫
Prmt5 ↻ ≫
Hsd17b13 ↻ ≫
Lyl1 ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Mroh2a ↻ ≫
Pcdh12 ↻ ≫
Kynu ↻ ≫
Sp100 ↻ ≫
Aass ↻ ≫
Vamp8 ↻ ≫
Psmb2 ↻ ≫
Slc4a2 ↻ ≫
Cdk5 ↻ ≫
Ephx1 ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Them5 ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Cenpa ↻ ≫
Clec9a ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Park7 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Cadm3 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Col18a1 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Mtmr6 ↻ ≫
Dlat ↻ ≫
Acadm ↻ ≫
Naprt ↻ ≫
Mroh6 ↻ ≫
Zap70 ↻ ≫
Tmc7 ↻ ≫
Ndfip2 ↻ ≫
Celf2 ↻ ≫
Hdhd3 ↻ ≫
Psmb10 ↻ ≫
Lcat ↻ ≫
Mettl7b ↻ ≫
Crip2 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Pcm1 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Zfp874a ↻ ≫
Pde6h ↻ ≫
Nktr ↻ ≫
Rdh16f2 ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Mtrex ↻ ≫
Dhx29 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Miga2 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
Snx17 ↻ ≫
Eif2b4 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Mocs2 ↻ ≫
Ctnna3 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Uroc1 ↻ ≫
C1rl ↻ ≫
Hmgb2 ↻ ≫
Percc1 ↻ ≫
Unkl ↻ ≫
BC003965 ↻ ≫
Pus7 ↻ ≫
Ly6a ↻ ≫
Rint1 ↻ ≫
Haus6 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Trak1 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Mup16 ↻ ≫
Gast ↻ ≫
Gdi2 ↻ ≫
Sult2a2 ↻ ≫
Gemin2 ↻ ≫
Catsperz ↻ ≫
Esrra ↻ ≫
Rrp8 ↻ ≫
Ilk ↻ ≫
Lgals8 ↻ ≫
Hjv ↻ ≫
Sbf2 ↻ ≫
Erf ↻ ≫
Trp63 ↻ ≫
Zscan26 ↻ ≫
Nfe2 ↻ ≫
Hmgn1 ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
Gm5820 ↻ ≫
Mup18 ↻ ≫
Ppp6r1 ↻ ≫
Zfp707 ↻ ≫
Lrrk2 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
Ints4 ↻ ≫
Stard5 ↻ ≫
Gpd1l ↻ ≫
Lalba ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Acot12 ↻ ≫
Cdcp1 ↻ ≫
Rpl5 ↻ ≫
Bhmt ↻ ≫
Ambra1 ↻ ≫
Pcyt2 ↻ ≫
Ttyh1 ↻ ≫
Cdc42ep1 ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Reck ↻ ≫
Clcc1 ↻ ≫
Anks4b ↻ ≫
Sec23ip ↻ ≫
Mcmbp ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Sf3a3 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Nfx1 ↻ ≫
Bicral ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Stom ↻ ≫
Gbp6 ↻ ≫
Nfix ↻ ≫
Gbp4 ↻ ≫
Pbld1 ↻ ≫
Wdr7 ↻ ≫
Tubb5 ↻ ≫
Mdc1 ↻ ≫
Pipox ↻ ≫
Bmp1 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Cyp2c70 ↻ ≫
4933411K16Rik ↻ ≫
Grn ↻ ≫
Serpinf2 ↻ ≫
Anxa9 ↻ ≫
Cers2 ↻ ≫
Ndufa12 ↻ ≫
Atp6v0d2 ↻ ≫
Hoga1 ↻ ≫
Gm45521 ↻ ≫
Bmp10 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Hyi ↻ ≫
Rfc1 ↻ ≫
Tram1 ↻ ≫
C2 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Sec16b ↻ ≫
Inpp5e ↻ ≫
Dixdc1 ↻ ≫
Zbtb48 ↻ ≫
Zfp444 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Pitpna ↻ ≫
Garre1 ↻ ≫
Aspscr1 ↻ ≫
Sult2a1 ↻ ≫
Nudt12 ↻ ≫
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