ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX020167 | Liver
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◣ SRX020167: Liver

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Cdkn1b ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Qrich1 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Adamts1 ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Tle2 ↻ ≫
Arhgef7 ↻ ≫
Foxj2 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Slc8b1 ↻ ≫
Ttbk1 ↻ ≫
Cdkn2c ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Tle3 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Ldhd ↻ ≫
Nr0b2 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Stt3a ↻ ≫
Narf ↻ ≫
Itprip ↻ ≫
Zfp874b ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
Sqor ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Ptch1 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Cyrib ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Colec11 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Lipg ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Il11ra2 ↻ ≫
Gm2002 ↻ ≫
Gm13305 ↻ ≫
LOC100861969 ↻ ≫
Ccl21b ↻ ≫
A530016L24Rik ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Zdhhc8 ↻ ≫
Rarres2 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
1700067K01Rik ↻ ≫
Samd1 ↻ ≫
Mn1 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Igsf10 ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Ost4 ↻ ≫
Etnppl ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Mylip ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Col24a1 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
Sema6c ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Otulinl ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Epha1 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Ttc32 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Nr4a2 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Sec31a ↻ ≫
Caprin1 ↻ ≫
Slc17a4 ↻ ≫
Zfp141 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Mpc2 ↻ ≫
Dcaf6 ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Mafg ↻ ≫
Rassf4 ↻ ≫
F12 ↻ ≫
Ndufa10 ↻ ≫
Car5a ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Atf6 ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Crip2 ↻ ≫
Fnbp1 ↻ ≫
Padi4 ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Lrrc3 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ptpn3 ↻ ≫
1110038F14Rik ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Cfl2 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Irak1bp1 ↻ ≫
Neurl3 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Ifit3 ↻ ≫
Celf2 ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Gbp11 ↻ ≫
Socs5 ↻ ≫
Agtrap ↻ ≫
Gcnt2 ↻ ≫
Sec23ip ↻ ≫
Mcmbp ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Rnf4 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Gbp6 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Wwc2 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Serpina3k ↻ ≫
Nup153 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Gbp10 ↻ ≫
Rrp8 ↻ ≫
Ilk ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Por ↻ ≫
Dlat ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Mospd3 ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Gtf2ird2 ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Ttc36 ↻ ≫
Tmem25 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Akr1b7 ↻ ≫
Tbl3 ↻ ≫
Cyp3a59 ↻ ≫
Prpf40b ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Pck1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Rmnd5a ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Tas2r134 ↻ ≫
Ackr4 ↻ ≫
Gdi2 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Sult2a8 ↻ ≫
Rfwd3 ↻ ≫
Slc9a5 ↻ ≫
Fhod1 ↻ ≫
Cdc42bpb ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Lmbr1l ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Slc25a13 ↻ ≫
Serpina3m ↻ ≫
Tchhl1 ↻ ≫
Grm7 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Gm13279 ↻ ≫
Gm13278 ↻ ≫
Hoxb3 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Reck ↻ ≫
Creb3l3 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Nodal ↻ ≫
Abcb11 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Id3 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Mrps30 ↻ ≫
Hpn ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Ttc39b ↻ ≫
Tmigd1 ↻ ≫
Asgr2 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Ppip5k2 ↻ ≫
Gin1 ↻ ≫
Serpina5 ↻ ≫
Gm867 ↻ ≫
Vpreb3 ↻ ≫
Dgka ↻ ≫
Pym1 ↻ ≫
Coq9 ↻ ≫
Ciapin1 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Ace3 ↻ ≫
Gadd45a ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Slc25a39 ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Rangap1 ↻ ≫
Cenpa ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Dlc1 ↻ ≫
Akap7 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Cbs ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Cyp2b9 ↻ ≫
Ppp6c ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Slc30a10 ↻ ≫
Tmem101 ↻ ≫
Ctnna3 ↻ ≫
Scrib ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Ifih1 ↻ ≫
Atp8b1 ↻ ≫
Ikzf5 ↻ ≫
Acadsb ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Tceanc ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Xpc ↻ ≫
Lsm3 ↻ ≫
Tnks1bp1 ↻ ≫
Alad ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Ssbp3 ↻ ≫
Utp25 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Gm13287 ↻ ≫
Gm13288 ↻ ≫
1190007I07Rik ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Hdhd3 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Ccser2 ↻ ≫
Top2b ↻ ≫
Fzd8 ↻ ≫
Ephb4 ↻ ≫
Slc6a12 ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Cyp3a25 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Med6 ↻ ≫
Rps27l ↻ ≫
Fbxw7 ↻ ≫
Aars2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Cyp20a1 ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
Dpy19l4 ↻ ≫
Phf20 ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Tmprss4 ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Rbm25 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Serpina16 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Chaf1a ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
Sox7 ↻ ≫
Gpr182 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Snx17 ↻ ≫
Eif2b4 ↻ ≫
Nr2c2ap ↻ ≫
Maz ↻ ≫
Serpinf2 ↻ ≫
Rabgef1 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Asah1 ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Gm13272 ↻ ≫
Ifnz ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Sbk1 ↻ ≫
Proser1 ↻ ≫
Nhlrc3 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Tns2 ↻ ≫
Kcnip3 ↻ ≫
Phf21b ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Rab5if ↻ ≫
Yipf2 ↻ ≫
Timm29 ↻ ≫
9530077C05Rik ↻ ≫
Anln ↻ ≫
Ppp1r11 ↻ ≫
Leng8 ↻ ≫
Frg1 ↻ ≫
Rpl5 ↻ ≫
Tbc1d10a ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Glyctk ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Ttc39c ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Upp2 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Pet117 ↻ ≫
Kat14 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Omd ↻ ≫
N4bp3 ↻ ≫
Ttll11 ↻ ≫
Cyp4a10 ↻ ≫
Sfxn1 ↻ ≫
Uchl5 ↻ ≫
Ro60 ↻ ≫
Usp19 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Sult2a2 ↻ ≫
Ugt1a1 ↻ ≫
Polq ↻ ≫
Kmt2c ↻ ≫
Ttyh1 ↻ ≫
Dio2 ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Dhdh ↻ ≫
Tulp2 ↻ ≫
Cyp21a1 ↻ ≫
Ubap2l ↻ ≫
4933434E20Rik ↻ ≫
Cks2 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Inhbe ↻ ≫
Thrsp ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Zfp770 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
Mycbp2 ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Afp ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Vnn1 ↻ ≫
Foxn4 ↻ ≫
Hlx ↻ ≫
She ↻ ≫
Leap2 ↻ ≫
Dbn1 ↻ ≫
Ccdc57 ↻ ≫
Apoe ↻ ≫
Nr2f2 ↻ ≫
Zbtb44 ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Ly6a ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Ms4a6b ↻ ≫
Gck ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Lpin2 ↻ ≫
Mfsd4b5 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Fam47e ↻ ≫
Hbp1 ↻ ≫
Zfp712 ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Gpi1 ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Spred2 ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Chkb ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Spata25 ↻ ≫
Erf ↻ ≫
Macf1 ↻ ≫
Chic2 ↻ ≫
Nudt18 ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Bod1l ↻ ≫
Fam219a ↻ ≫
Dnaic1 ↻ ≫
Ppib ↻ ≫
Pcm1 ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Abhd4 ↻ ≫
Dad1 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Tsen15 ↻ ≫
Xrn1 ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Gfod1 ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Dhcr24 ↻ ≫
Cep104 ↻ ≫
Dffb ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Rskr ↻ ≫
Lsm12 ↻ ≫
G6pc3 ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Atp5g3 ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Nup93 ↻ ≫
Nelfa ↻ ≫
Mapkbp1 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
Ttc7b ↻ ≫
Api5 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Stab1 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Dnajc19 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Akr1c14 ↻ ≫
Tram1 ↻ ≫
Gosr1 ↻ ≫
Adamts9 ↻ ≫
Phf10 ↻ ≫
Mlxipl ↻ ≫
Sult2a1 ↻ ≫
Arl8b ↻ ≫
Tmed2 ↻ ≫
Dnttip2 ↻ ≫
Tfpt ↻ ≫
Prpf31 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Nt5dc3 ↻ ≫
Ndufb6 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Tmprss6 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Gtf2b ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Ctcfl ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Gcgr ↻ ≫
Mup18 ↻ ≫
A1cf ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Slfn14 ↻ ≫
Ephx1 ↻ ≫
Pag1 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Rpl29 ↻ ≫
Mad2l2 ↻ ≫
Kdm1a ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Trim7 ↻ ≫
Gpaa1 ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Cdiptos ↻ ≫
Cdipt ↻ ≫
Fam181a ↻ ≫
Fam220a ↻ ≫
Slc25a51 ↻ ≫
Sema4b ↻ ≫
Qsox1 ↻ ≫
Kbtbd3 ↻ ≫
Sult2a4 ↻ ≫
Bmp10 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Zfp768 ↻ ≫
Tor1aip2 ↻ ≫
Tor1aip1 ↻ ≫
Nfix ↻ ≫
Krtap3-2 ↻ ≫
Napg ↻ ≫
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Oxsr1 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Tagln ↻ ≫
Ambra1 ↻ ≫
Tut7 ↻ ≫
Cntfr ↻ ≫
Cfl1 ↻ ≫
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Nlrp10 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
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Ces2a ↻ ≫
Scara3 ↻ ≫
Uap1 ↻ ≫
Aacs ↻ ≫
Prmt5 ↻ ≫
Acsm1 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Atxn7 ↻ ≫
Atp2b2 ↻ ≫
Tns3 ↻ ≫
Dhh ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Ssbp1 ↻ ≫
Ccdc88a ↻ ≫
Cdc6 ↻ ≫
Lrmda ↻ ≫
Rdh14 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Slc4a2 ↻ ≫
Cdk5 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Arsg ↻ ≫
Saa1 ↻ ≫
Atxn7l1 ↻ ≫
Mtus1 ↻ ≫
Hal ↻ ≫
Dohh ↻ ≫
Nfe2l1 ↻ ≫
Serpina1c ↻ ≫
Oit3 ↻ ≫
Mup19 ↻ ≫
Acap1 ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Snrnp27 ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Armc7 ↻ ≫
Rps20 ↻ ≫
Ddb2 ↻ ≫
Spdye4b ↻ ≫
Rbak ↻ ≫
Adamts2 ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Cnnm3 ↻ ≫
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