ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1672854 | Mesenchymal stem cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

◢ SRX003140: 3T3-L1

◢ SRX003152: 3T3-L1

◢ SRX003153: 3T3-L1

◢ SRX003154: 3T3-L1

◢ SRX047648: 3T3-L1

◢ SRX520202: 3T3-L1

◢ SRX150789: C17-2

◢ SRX868175: ES cells

◢ SRX868178: ES cells

◢ SRX087266: F9

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◢ SRX467364: IDG-SW3

◢ SRX467365: IDG-SW3

◢ SRX467366: IDG-SW3

◢ SRX467367: IDG-SW3

◢ SRX020167: Liver

◢ SRX020169: Liver

◢ SRX020170: Liver

◢ SRX020173: Liver

◢ SRX020175: Liver

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◢ SRX020180: Liver

◢ SRX118175: Liver

◢ SRX118176: Liver

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◢ SRX118179: Liver

◢ SRX118180: Liver

◢ SRX4949978: Liver

◢ SRX4949979: Liver

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◢ SRX6658446: Liver

◢ SRX6658447: Liver

◢ SRX6658448: Liver

◢ SRX6658449: Liver

◢ SRX6658450: Liver

◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

◣ SRX1672854: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672855: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Gins2 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Cdc25c ↻ ≫
Top2a ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Fggy ↻ ≫
Dusp19 ↻ ≫
Tmem256 ↻ ≫
Nlgn2 ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Ska2 ↻ ≫
Prr11 ↻ ≫
Tmem218 ↻ ≫
4933411K16Rik ↻ ≫
Zmynd8 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Bbx ↻ ≫
Dicer1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Ppp2r1a ↻ ≫
Etfb ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Slc25a51 ↻ ≫
Ect2 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Nr2c1 ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Tradd ↻ ≫
Fbxl8 ↻ ≫
Zfp383 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Ndufs1 ↻ ≫
Eef1b2 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Ptpra ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Mast2 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Atxn2 ↻ ≫
Coq3 ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Trip12 ↻ ≫
Fbxo36 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Ogn ↻ ≫
Gsk3a ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Ciao2b ↻ ≫
Gpr39 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Pik3cd ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Zbtb5 ↻ ≫
Sulf1 ↻ ≫
Brwd1 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Tyw5 ↻ ≫
Maip1 ↻ ≫
Crtc2 ↻ ≫
Yipf4 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Mustn1 ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Ptpn22 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Mlec ↻ ≫
Zfp81 ↻ ≫
Etfdh ↻ ≫
4930579G24Rik ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Agk ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Rangap1 ↻ ≫
Pigt ↻ ≫
Dnaja3 ↻ ≫
Phf5a ↻ ≫
Aco2 ↻ ≫
C87436 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Tpst1 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Atp5g3 ↻ ≫
Runx1 ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Mrpl16 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Wdr36 ↻ ≫
Zfp386 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Pmpcb ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Cycs ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Hagh ↻ ≫
Fahd1 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Rbbp5 ↻ ≫
Cox5b ↻ ≫
Fcrlb ↻ ≫
Cpped1 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Kdm3a ↻ ≫
Cnot2 ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Pfkm ↻ ≫
Senp1 ↻ ≫
Kmt2d ↻ ≫
Abcd2 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Rspry1 ↻ ≫
Psme3ip1 ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Loxl2 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Wtap ↻ ≫
Tmem242 ↻ ≫
Dennd6a ↻ ≫
Pcbp2 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Rhobtb2 ↻ ≫
Srrm2 ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Hsd17b4 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Enpp4 ↻ ≫
Shb ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Vamp4 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Pdcl3 ↻ ≫
Gtpbp1 ↻ ≫
Adamtsl5 ↻ ≫
Pex16 ↻ ≫
Nabp2 ↻ ≫
Srxn1 ↻ ≫
Zdhhc6 ↻ ≫
Vti1a ↻ ≫
Mrpl21 ↻ ≫
Ighmbp2 ↻ ≫
Mmadhc ↻ ≫
Rhbdl2 ↻ ≫
Wdr7 ↻ ≫
Gnb2 ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Oxa1l ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Gipc1 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Nrep ↻ ≫
Hadh ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Tmod3 ↻ ≫
Pus7l ↻ ≫
Irak4 ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Cpq ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Ccni ↻ ≫
2010109A12Rik ↻ ≫
Tnfrsf12a ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Sdha ↻ ≫
Ccdc127 ↻ ≫
Znrd1as ↻ ≫
Znrd1 ↻ ≫
Supt7l ↻ ≫
Slc4a1ap ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
Rgl2 ↻ ≫
Pitpnc1 ↻ ≫
Nvl ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Eps8 ↻ ≫
Pik3r1 ↻ ≫
Dmp1 ↻ ≫
Eif4a2 ↻ ≫
Ppat ↻ ≫
Paics ↻ ≫
Arhgap11a ↻ ≫
Myh9 ↻ ≫
Mbd3 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Zfp335 ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Orai1 ↻ ≫
Acadvl ↻ ≫
Hif1an ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Enpp3 ↻ ≫
Glt28d2 ↻ ≫
Rps14 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Mmd ↻ ≫
Aurkaip1 ↻ ≫
Itgb7 ↻ ≫
Zfp438 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Clasp1 ↻ ≫
Zfp770 ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Ifi211 ↻ ≫
Zfp142 ↻ ≫
Bcs1l ↻ ≫
Slc35d1 ↻ ≫
Lsm8 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Sipa1 ↻ ≫
Acp2 ↻ ≫
Cflar ↻ ≫
Zfp319 ↻ ≫
Usb1 ↻ ≫
Chchd1 ↻ ≫
Mrps28 ↻ ≫
Them6 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Dcaf10 ↻ ≫
Prr7 ↻ ≫
Tsc1 ↻ ≫
Ddost ↻ ≫
Col6a5 ↻ ≫
Cdcp3 ↻ ≫
Rnf6 ↻ ≫
Ncln ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Sh3gl1 ↻ ≫
Akr1b3 ↻ ≫
Gpd2 ↻ ≫
Tcf3 ↻ ≫
Lrtm1 ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Eif1ad ↻ ≫
Banf1 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Nudcd2 ↻ ≫
Hmmr ↻ ≫
Hspa5 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Pde8a ↻ ≫
Tfcp2 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Nwd1 ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Ctsl ↻ ≫
Armh3 ↻ ≫
Vps51 ↻ ≫
Kank2 ↻ ≫
Mdc1 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Oacyl ↻ ≫
Akap11 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
Fmn1 ↻ ≫
Aig1 ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Atox1 ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Polr3b ↻ ≫
Arl4c ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Chd8 ↻ ≫
Rcan1 ↻ ≫
Tctex1d2 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Actr3 ↻ ≫
Fbxo8 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Aaas ↻ ≫
Cep44 ↻ ≫
Kmt2e ↻ ≫
Ankmy1 ↻ ≫
Chordc1 ↻ ≫
Fra10ac1 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
Ptcd3 ↻ ≫
Polr1a ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Josd1 ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Rpl24 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Rad51ap1 ↻ ≫
D6Wsu163e ↻ ≫
Agbl5 ↻ ≫
Fap ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Prpf40a ↻ ≫
Arl6ip6 ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Hrh1 ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Ndufs8 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Tpr ↻ ≫
Odr4 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Cutc ↻ ≫
Cox15 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Ccdc57 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Rtn4ip1 ↻ ≫
Qrsl1 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Gzme ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Lrrc10b ↻ ≫
Ndufc2 ↻ ≫
Dhx35 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Armc1 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Nudcd1 ↻ ≫
Eny2 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Stam ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Wapl ↻ ≫
Chst2 ↻ ≫
Pdgfra ↻ ≫
Tgif1 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Osmr ↻ ≫
Rrp15 ↻ ≫
Tent2 ↻ ≫
Zfp408 ↻ ≫
Vps52 ↻ ≫
Rps18 ↻ ≫
Gtf3c3 ↻ ≫
Cfap298 ↻ ≫
Creb5 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Apol9a ↻ ≫
Mtg1 ↻ ≫
Ankrd13c ↻ ≫
Tmbim4 ↻ ≫
Podnl1 ↻ ≫
Ubac2 ↻ ≫
Srsf1 ↻ ≫
Ccdc30 ↻ ≫
Pyurf ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Smad6 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Thrap3 ↻ ≫
Sf3b3 ↻ ≫
Cog4 ↻ ≫
Habp2 ↻ ≫
Oxnad1 ↻ ≫
Dph3 ↻ ≫
Afg1l ↻ ≫
Ap4e1 ↻ ≫
Rpl5 ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Gatd3a ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Ctbp2 ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Usp37 ↻ ≫
Cnot9 ↻ ≫
Krr1 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Get1 ↻ ≫
Timm13 ↻ ≫
Loxl1 ↻ ≫
Tmem186 ↻ ≫
Pmm2 ↻ ≫
Cstf2t ↻ ≫
Egr3 ↻ ≫
Ptgr2 ↻ ≫
Nudt16 ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Trp53rka ↻ ≫
Lrp11 ↻ ≫
Rtraf ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Gucd1 ↻ ≫
Wdr75 ↻ ≫
Snrpd3 ↻ ≫
Apol9b ↻ ≫
Tmem129 ↻ ≫
Tacc3 ↻ ≫
Slc25a32 ↻ ≫
Dcaf13 ↻ ≫
Banp ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Pdss1 ↻ ≫
Exosc4 ↻ ≫
Mdh1b ↻ ≫
Fastkd2 ↻ ≫
Arfgap2 ↻ ≫
Dnajc19 ↻ ≫
Rab33b ↻ ≫
Snrnp200 ↻ ≫
1810024B03Rik ↻ ≫
Slc45a4 ↻ ≫
4930583I09Rik ↻ ≫
Zfp41 ↻ ≫
Neurl2 ↻ ≫
Ctsa ↻ ≫
Mpp4 ↻ ≫
Slc7a2 ↻ ≫
Gls ↻ ≫
Lrpprc ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Cnot10 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Cdiptos ↻ ≫
Cdipt ↻ ≫
Cast ↻ ≫
Ndufb3 ↻ ≫
Fam126b ↻ ≫
Zfp444 ↻ ≫
Panx3 ↻ ≫
Dcp1a ↻ ≫
Kctd5 ↻ ≫
Exoc2 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Rb1cc1 ↻ ≫
Rdh14 ↻ ≫
Ibtk ↻ ≫
Gas2 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Gtf2h4 ↻ ≫
Cdk13 ↻ ≫
Fads2 ↻ ≫
Abhd1 ↻ ≫
Rin1 ↻ ≫
Rhoq ↻ ≫
Klhl33 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Bmt2 ↻ ≫
Ptp4a1 ↻ ≫
Vapa ↻ ≫
Baz1b ↻ ≫
Mcm7 ↻ ≫
Ap4m1 ↻ ≫
Slc9a1 ↻ ≫
Tbc1d17 ↻ ≫
Akt1s1 ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Csf1 ↻ ≫
Atxn1l ↻ ≫
Rock2 ↻ ≫
Tmco4 ↻ ≫
Nop14 ↻ ≫
Grk4 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Vps13b ↻ ≫
4930558K02Rik ↻ ≫
Pigc ↻ ≫
Tmed5 ↻ ≫
Ccdc18 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Kremen1 ↻ ≫
Pate1 ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Tomm70a ↻ ≫
Ccdc71 ↻ ≫
Klhdc8b ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Slc25a23 ↻ ≫
Cnpy3 ↻ ≫
Ttc32 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Pcbp1 ↻ ≫
Crebl2 ↻ ≫
Ranbp2 ↻ ≫
Thoc1 ↻ ≫
Alkbh3 ↻ ≫
Lmbrd1 ↻ ≫
1810055G02Rik ↻ ≫
Rpl21 ↻ ≫
Emc7 ↻ ≫
Atp5l ↻ ≫
Slc35e4 ↻ ≫
Zfp768 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Tbpl1 ↻ ≫
Nat10 ↻ ≫
Pigq ↻ ≫
Abhd16a ↻ ≫
1110038F14Rik ↻ ≫
Rps26 ↻ ≫
Stx18 ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Abhd12 ↻ ≫
Tmtc3 ↻ ≫
Cep290 ↻ ≫
Rcor2 ↻ ≫
Isy1 ↻ ≫
Angpt1 ↻ ≫
Dbi ↻ ≫
3110009E18Rik ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Tcf4 ↻ ≫
Cacybp ↻ ≫
Vmac ↻ ≫
Ndufa11 ↻ ≫
Glt8d2 ↻ ≫
Pkm ↻ ≫
Zyx ↻ ≫
Uckl1 ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Plec ↻ ≫
Stard6 ↻ ≫
4930503L19Rik ↻ ≫
Atg2a ↻ ≫
Mrps10 ↻ ≫
Gm4861 ↻ ≫
Pip5k1c ↻ ≫
Ifi47 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Mideas ↻ ≫
Rwdd1 ↻ ≫
Ttc14 ↻ ≫
Ctu1 ↻ ≫
Api5 ↻ ≫
Nupr1 ↻ ≫
Snap25 ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Ppp1r11 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Ppil3 ↻ ≫
Nif3l1 ↻ ≫
Wdfy1 ↻ ≫
Itgb3bp ↻ ≫
Efcab7 ↻ ≫
Smpd2 ↻ ≫
Ppil6 ↻ ≫
Rexo4 ↻ ≫
Ufl1 ↻ ≫
Tbc1d7 ↻ ≫
Fblim1 ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
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