ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX087269 | F9
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Kat6a ↻ ≫
Ing1 ↻ ≫
Lemd2 ↻ ≫
Uqcrh ↻ ≫
Lrrc41 ↻ ≫
Spink10 ↻ ≫
Fbxo38 ↻ ≫
Mbtps1 ↻ ≫
Atp1b2 ↻ ≫
Sema4b ↻ ≫
Pnpla6 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Pik3r3 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Ccdc174 ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
Arrdc2 ↻ ≫
Insig1 ↻ ≫
Fgf4 ↻ ≫
Slc9a1 ↻ ≫
Ier2 ↻ ≫
Junb ↻ ≫
Arrdc3 ↻ ≫
Tnrc6c ↻ ≫
Wbp1l ↻ ≫
Ndufa13 ↻ ≫
Tssk6 ↻ ≫
Hnrnpab ↻ ≫
Klf5 ↻ ≫
Supt5 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Prdx1 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Jpt1 ↻ ≫
Pcif1 ↻ ≫
Cep350 ↻ ≫
Rsrp1 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Calm2 ↻ ≫
Caprin2 ↻ ≫
Rab11fip3 ↻ ≫
H2bc4 ↻ ≫
H2ac6 ↻ ≫
Zbtb37 ↻ ≫
H2ax ↻ ≫
Slc2a1 ↻ ≫
Cited2 ↻ ≫
Taf4 ↻ ≫
Kmt5b ↻ ≫
Herpud1 ↻ ≫
Tti2 ↻ ≫
Csrnp2 ↻ ≫
Tbrg1 ↻ ≫
Med21 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Npm1 ↻ ≫
Cdkn1a ↻ ≫
Raver1 ↻ ≫
Rpl3 ↻ ≫
Ptms ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
Wiz ↻ ≫
Rhob ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Cited4 ↻ ≫
Rln1 ↻ ≫
Fam53c ↻ ≫
Gtf2a1 ↻ ≫
Calr ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Nxt1 ↻ ≫
Odc1 ↻ ≫
Znfx1 ↻ ≫
H1f5 ↻ ≫
Arl4d ↻ ≫
Appl2 ↻ ≫
Ube2g1 ↻ ≫
Arl6ip1 ↻ ≫
Dnajb1 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Ercc6l ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Calm1 ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Crk ↻ ≫
Trim6 ↻ ≫
Amt ↻ ≫
Ppp1r3c ↻ ≫
Btg1 ↻ ≫
Rps2 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
Crlf2 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Ddit4 ↻ ≫
Hsp90ab1 ↻ ≫
Frg2f1 ↻ ≫
Foxj3 ↻ ≫
Map1lc3b ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Gtf2f1 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
Nppc ↻ ≫
Cdh1 ↻ ≫
Sirt1 ↻ ≫
Gls ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Taf13 ↻ ≫
Tob1 ↻ ≫
Nasp ↻ ≫
Fos ↻ ≫
Gadd45g ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
Rab13 ↻ ≫
Rps27rt ↻ ≫
Rps27 ↻ ≫
Actb ↻ ≫
Acly ↻ ≫
Acy3 ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
H3c2 ↻ ≫
Pabpc4 ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Grasp ↻ ≫
H2az1 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Klf6 ↻ ≫
Degs1 ↻ ≫
H2bc15 ↻ ≫
H2ac15 ↻ ≫
Tjp2 ↻ ≫
Chac1 ↻ ≫
Tfap2e ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Uchl1 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Chd2 ↻ ≫
Dcaf15 ↻ ≫
Kbtbd3 ↻ ≫
H4c8 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
Btg2 ↻ ≫
Msh2 ↻ ≫
Supt3 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
Ccnb1 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
H2ac19 ↻ ≫
H2ac18 ↻ ≫
H3c14 ↻ ≫
H3c15 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Pnp ↻ ≫
Ddx11 ↻ ≫
Nxf1 ↻ ≫
Fth1 ↻ ≫
Jak1 ↻ ≫
Lfng ↻ ≫
Acot8 ↻ ≫
Zswim3 ↻ ≫
Amd2 ↻ ≫
Amd1 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Ppih ↻ ≫
Zfp532 ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Ints6 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Fam43a ↻ ≫
Rps20 ↻ ≫
Tsc22d1 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
Hspa2 ↻ ≫
Triml2 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Ubxn6 ↻ ≫
Hdgfl2 ↻ ≫
Slc1a5 ↻ ≫
Tuba4a ↻ ≫
Rbm3 ↻ ≫
Kdm5b ↻ ≫
Gcsh ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Klf2 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
Uhrf2 ↻ ≫
Smndc1 ↻ ≫
Nqo1 ↻ ≫
Unk ↻ ≫
Lmna ↻ ≫
Prpf38a ↻ ≫
Orc1 ↻ ≫
Ppp1r10 ↻ ≫
Mrps18b ↻ ≫
Cpm ↻ ≫
Brd3 ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Aplp2 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Atf2 ↻ ≫
Ncoa4 ↻ ≫
Maml1 ↻ ≫
Srgap2 ↻ ≫
Fam72a ↻ ≫
Tuba1a ↻ ≫
Ahctf1 ↻ ≫
Mphosph9 ↻ ≫
2810006K23Rik ↻ ≫
H2ac21 ↻ ≫
Btaf1 ↻ ≫
H2bc21 ↻ ≫
H2ac20 ↻ ≫
Rgs9bp ↻ ≫
Ankrd27 ↻ ≫
Hspb1 ↻ ≫
Slc2a3 ↻ ≫
Smc3 ↻ ≫
Polr3d ↻ ≫
Fbxl18 ↻ ≫
Tcf15 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Nectin3 ↻ ≫
H2bc1 ↻ ≫
H2ac1 ↻ ≫
H2bu2 ↻ ≫
Hbegf ↻ ≫
Hexim1 ↻ ≫
Hspa1b ↻ ≫
Zswim6 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Pef1 ↻ ≫
Tpi1 ↻ ≫
Gpx4 ↻ ≫
Rtn4 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
Fkbp5 ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Mettl23 ↻ ≫
Jmjd6 ↻ ≫
Errfi1 ↻ ≫
Zfp948 ↻ ≫
Vdac3 ↻ ≫
Impdh2 ↻ ≫
Arid4b ↻ ≫
H3c10 ↻ ≫
Gpr160 ↻ ≫
Mybl1 ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
Gapdh ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
Snx11 ↻ ≫
Srsf3 ↻ ≫
Egln3 ↻ ≫
Tex19.1 ↻ ≫
Ctnnbl1 ↻ ≫
Itga6 ↻ ≫
Nop14 ↻ ≫
Grk4 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Rpl36a ↻ ≫
Taf4b ↻ ≫
Rbfox2 ↻ ≫
Hsp90aa1 ↻ ≫
Hspb6 ↻ ≫
Proser3 ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
B4galt3 ↻ ≫
B4galnt3 ↻ ≫
Ywhaq ↻ ≫
Rps9 ↻ ≫
Rps12 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
Arc ↻ ≫
Zbed3 ↻ ≫
Ndufs1 ↻ ≫
Eef1b2 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Ndufaf3 ↻ ≫
Kctd12 ↻ ≫
Marchf3 ↻ ≫
Dlc1 ↻ ≫
Rtn3 ↻ ≫
Cdk12 ↻ ≫
Stra8 ↻ ≫
Ubb ↻ ≫
Slc3a2 ↻ ≫
Dusp1 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
H2-L ↻ ≫
H2-D1 ↻ ≫
Clp1 ↻ ≫
Eif4g2 ↻ ≫
Sertad1 ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Uros ↻ ≫
Bccip ↻ ≫
Gfpt2 ↻ ≫
H2bc22 ↻ ≫
H2ac22 ↻ ≫
Sned1 ↻ ≫
Slc31a1 ↻ ≫
Fkbp15 ↻ ≫
Cdk1 ↻ ≫
Dnajb9 ↻ ≫
Irs2 ↻ ≫
Gm10130 ↻ ≫
Rab6a ↻ ≫
Rcl1 ↻ ≫
Carhsp1 ↻ ≫
Rcor1 ↻ ≫
Ier5l ↻ ≫
G3bp1 ↻ ≫
Hhex ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Atp7b ↻ ≫
Alg11 ↻ ≫
Shisa2 ↻ ≫
Hspa5 ↻ ≫
Trim41 ↻ ≫
Rnd3 ↻ ≫
Setdb2 ↻ ≫
Gm45935 ↻ ≫
Cab39l ↻ ≫
Ppie ↻ ≫
Nptx2 ↻ ≫
Zfp36l1 ↻ ≫
Fbxo5 ↻ ≫
Adssl1 ↻ ≫
Cabyr ↻ ≫
Pwwp3b ↻ ≫
Got1 ↻ ≫
Eif1ax ↻ ≫
Snx5 ↻ ≫
Mgme1 ↻ ≫
Snrpa ↻ ≫
BC024978 ↻ ≫
H2aw ↻ ≫
Maged1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Zfp143 ↻ ≫
Slc5a3 ↻ ≫
Mrps6 ↻ ≫
Xpo1 ↻ ≫
Rsbn1l ↻ ≫
Nars ↻ ≫
BC005537 ↻ ≫
Traf7 ↻ ≫
Dnajc3 ↻ ≫
Tubgcp5 ↻ ≫
Kntc1 ↻ ≫
Slc41a1 ↻ ≫
Slc9a3r1 ↻ ≫
Mtr ↻ ≫
Hmgb2 ↻ ≫
Gm52429 ↻ ≫
Sf3b1 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
H4c1 ↻ ≫
Aldh3a2 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Rnd1 ↻ ≫
Ap1b1 ↻ ≫
Spin4 ↻ ≫
Nefh ↻ ≫
Sfxn4 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Dram2 ↻ ≫
Cept1 ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Vgll4 ↻ ≫
Morc2a ↻ ≫
Ctnnb1 ↻ ≫
Fam117a ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Tubb2a ↻ ≫
Spg11 ↻ ≫
Bcat1 ↻ ≫
Slc25a4 ↻ ≫
Gan ↻ ≫
Gch1 ↻ ≫
Ppif ↻ ≫
Plpp1 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Gjb3 ↻ ≫
Pdk3 ↻ ≫
B4galnt2 ↻ ≫
Adam17 ↻ ≫
Zfp869 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Chchd7 ↻ ≫
Tmx3 ↻ ≫
Id1 ↻ ≫
Kmt2e ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Jun ↻ ≫
Tcta ↻ ≫
Rhoa ↻ ≫
Coq3 ↻ ≫
Ergic2 ↻ ≫
Ncl ↻ ≫
Atp9b ↻ ≫
Ss18 ↻ ≫
H1f1 ↻ ≫
Cdkn1c ↻ ≫
Mpc2 ↻ ≫
Dcaf6 ↻ ≫
G0s2 ↻ ≫
Jade1 ↻ ≫
Appl1 ↻ ≫
Chst8 ↻ ≫
Exoc6b ↻ ≫
Rpl41 ↻ ≫
H1f10 ↻ ≫
Mapk14 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Glce ↻ ≫
P2rx4 ↻ ≫
Slc39a10 ↻ ≫
Enox2 ↻ ≫
Kcnk5 ↻ ≫
Add3 ↻ ≫
H2-Bl ↻ ≫
Hspa14 ↻ ≫
Cdnf ↻ ≫
Hectd4 ↻ ≫
Fnbp1 ↻ ≫
Luc7l ↻ ≫
Ddx3x ↻ ≫
Cdkl5 ↻ ≫
Sec61a2 ↻ ≫
Exoc7 ↻ ≫
Ier3 ↻ ≫
Ksr1 ↻ ≫
Trim72 ↻ ≫
P4hb ↻ ≫
Dynll2 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Ddx5 ↻ ≫
Cep95 ↻ ≫
Slc38a2 ↻ ≫
Tuft1 ↻ ≫
Zdhhc17 ↻ ≫
Epha7 ↻ ≫
Calhm5 ↻ ≫
Mthfd1 ↻ ≫
Mpzl1 ↻ ≫
Cyp4f17 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
4833420G17Rik ↻ ≫
Tubb4b ↻ ≫
Cd9 ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Tle4 ↻ ≫
Cx3cl1 ↻ ≫
Ddhd2 ↻ ≫
Map2k1 ↻ ≫
Ppm1b ↻ ≫
Trim23 ↻ ≫
Trappc13 ↻ ≫
Shld3 ↻ ≫
Wipf2 ↻ ≫
Ldhb ↻ ≫
Sub1 ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Tmed1 ↻ ≫
Rnf169 ↻ ≫
Zfyve16 ↻ ≫
Crebrf ↻ ≫
Mat2a ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Herc2 ↻ ≫
Ube2w ↻ ≫
Ctsl ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
2610044O15Rik8 ↻ ≫
Luc7l2 ↻ ≫
Camk2d ↻ ≫
Clcc1 ↻ ≫
Hspa8 ↻ ≫
Tollip ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
Tubb3 ↻ ≫
Nptx1 ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Smoc1 ↻ ≫
Mtif2 ↻ ≫
Ctdsp2 ↻ ≫
Rps4x ↻ ≫
P4ha1 ↻ ≫
Ddx17 ↻ ≫
Tra2b ↻ ≫
Shroom2 ↻ ≫
Sgce ↻ ≫
Peg10 ↻ ≫
Snrpn ↻ ≫
Snurf ↻ ≫
Plscr1 ↻ ≫
Epb41l2 ↻ ≫
Csrp2 ↻ ≫
Mad2l1bp ↻ ≫
Ncaph2 ↻ ≫
Lmf2 ↻ ≫
Haus1 ↻ ≫
Atp5a1 ↻ ≫
Mt1 ↻ ≫
Dynlt1b ↻ ≫
Ncoa5 ↻ ≫
Selenot ↻ ≫
Aldoa ↻ ≫
Dync1h1 ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Srsf1 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
Hebp1 ↻ ≫
Map3k7 ↻ ≫
Ube2s ↻ ≫
Zwilch ↻ ≫
Rpl4 ↻ ≫
Tango6 ↻ ≫
Simc1 ↻ ≫
H3f3a ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Blcap ↻ ≫
Hmgb1 ↻ ≫
Nr3c2 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Ppp1r8 ↻ ≫
Sod1 ↻ ≫
Epc1 ↻ ≫
Ubl7 ↻ ≫
Mcl1 ↻ ≫
Phkb ↻ ≫
Itfg1 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Cat ↻ ≫
Srp54a ↻ ≫
2700097O09Rik ↻ ≫
Ppp1r12b ↻ ≫
Atp5g1 ↻ ≫
Naa50 ↻ ≫
Atp6v1a ↻ ≫
Suv39h1 ↻ ≫
Elp3 ↻ ≫
Fnta ↻ ≫
L1td1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Porcn ↻ ≫
Dgat2 ↻ ≫
Eif5 ↻ ≫
Hnrnph1 ↻ ≫
Irf8 ↻ ≫
Sox21 ↻ ≫
Rps26 ↻ ≫
Cdk13 ↻ ≫
Phf14 ↻ ≫
Ndufa4 ↻ ≫
Pdia3 ↻ ≫
Catsper2 ↻ ≫
Wdr89 ↻ ≫
Dach2 ↻ ≫
Hmcn1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Paxip1 ↻ ≫
Rnf34 ↻ ≫
Tigar ↻ ≫
Mgat4a ↻ ≫
Btf3l4 ↻ ≫
Txndc12 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Crlf3 ↻ ≫
Rbm39 ↻ ≫
Whamm ↻ ≫
Fus ↻ ≫
Wsb1 ↻ ≫
Tubb2b ↻ ≫
Tubb5 ↻ ≫
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Atp1b1 ↻ ≫
Slc25a3 ↻ ≫
Arf2 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Taf6 ↻ ≫
Cnpy4 ↻ ≫
Acp6 ↻ ≫
Dusp10 ↻ ≫
1700056E22Rik ↻ ≫
Fzd7 ↻ ≫
Wipi2 ↻ ≫
Cox6b2 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Hibch ↻ ≫
Acap2 ↻ ≫
Amn1 ↻ ≫
Rab5b ↻ ≫
Tmpo ↻ ≫
Lgr4 ↻ ≫
Ift74 ↻ ≫
Plod1 ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Mpp7 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Ugdh ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Stk38l ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
Ahcyl2 ↻ ≫
Eda2r ↻ ≫
Srp54c ↻ ≫
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