ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for HDAC4

Query protein: HDAC4
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX6054277 | SK-UT-1
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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HDAC4's Target genes

◢ HDAC4: Average

◢ SRX2140208: MM.1S

◣ SRX6054277: SK-UT-1

◢ HDAC4: STRING
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MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
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FRG2C ↻ ≫
ADAMTSL1 ↻ ≫
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VPS50 ↻ ≫
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THRAP3 ↻ ≫
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BANP ↻ ≫
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DFFA ↻ ≫
PRCC ↻ ≫
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PPRC1 ↻ ≫
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ARID2 ↻ ≫
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ID3 ↻ ≫
TEPSIN ↻ ≫
NDUFAF8 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
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NCLN ↻ ≫
CALR3 ↻ ≫
C19orf44 ↻ ≫
SUCLG1 ↻ ≫
NEBL ↻ ≫
ST3GAL2 ↻ ≫
HIKESHI ↻ ≫
ZFYVE1 ↻ ≫
CCDC90B ↻ ≫
TOM1L2 ↻ ≫
OR4M1 ↻ ≫
DRC3 ↻ ≫
PAK1IP1 ↻ ≫
C6orf52 ↻ ≫
TSC2 ↻ ≫
NTHL1 ↻ ≫
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ANKHD1 ↻ ≫
ORMDL3 ↻ ≫
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NAIF1 ↻ ≫
TMEM208 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
RAB5B ↻ ≫
PANK4 ↻ ≫
OR4Q3 ↻ ≫
HES5 ↻ ≫
BMF ↻ ≫
SPSB3 ↻ ≫
LRCH4 ↻ ≫
FBXO24 ↻ ≫
INVS ↻ ≫
ERP44 ↻ ≫
GSPT1 ↻ ≫
PPP1R12B ↻ ≫
ZNF17 ↻ ≫
SMPD3 ↻ ≫
COX16 ↻ ≫
CCDC146 ↻ ≫
UCKL1 ↻ ≫
RAG2 ↻ ≫
IFTAP ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
VIPAS39 ↻ ≫
AHSA1 ↻ ≫
NDC80 ↻ ≫
METTL4 ↻ ≫
HNRNPC ↻ ≫
ZNF417 ↻ ≫
SNX16 ↻ ≫
RPS3 ↻ ≫
PEMT ↻ ≫
SLX1B ↻ ≫
SLX1A ↻ ≫
BOLA2-SMG1P6 ↻ ≫
BOLA2B ↻ ≫
BOLA2 ↻ ≫
PIGL ↻ ≫
NCOR1 ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
HRCT1 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
PES1 ↻ ≫
ID1 ↻ ≫
SP5 ↻ ≫
ING4 ↻ ≫
PRR14 ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
GBA ↻ ≫
PNKD ↻ ≫
AAMP ↻ ≫
STIP1 ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
BUB1B ↻ ≫
PIN4 ↻ ≫
GATB ↻ ≫
INTS1 ↻ ≫
EMILIN1 ↻ ≫
GPR137 ↻ ≫
ZNF268 ↻ ≫
NOP16 ↻ ≫
HIGD2A ↻ ≫
ZNF608 ↻ ≫
SRSF11 ↻ ≫
LRRC40 ↻ ≫
KHDC4 ↻ ≫
CNIH4 ↻ ≫
SNX17 ↻ ≫
EIF2B4 ↻ ≫
SF3B6 ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
ZFPL1 ↻ ≫
TMEM262 ↻ ≫
CDCA5 ↻ ≫
TACO1 ↻ ≫
ZNF140 ↻ ≫
SYMPK ↻ ≫
FOXA3 ↻ ≫
DDX41 ↻ ≫
C19orf53 ↻ ≫
LARS1 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
TMEM70 ↻ ≫
ELOC ↻ ≫
TMEM242 ↻ ≫
CP ↻ ≫
OSBP ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
SF3A3 ↻ ≫
RPS7 ↻ ≫
GSK3A ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
MED27 ↻ ≫
INTS9 ↻ ≫
HMBOX1 ↻ ≫
EXOC3L1 ↻ ≫
E2F4 ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
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RPL32 ↻ ≫
CYCS ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
NEDD8-MDP1 ↻ ≫
NEDD8 ↻ ≫
GMPR2 ↻ ≫
DYNC1I2 ↻ ≫
SLC39A1 ↻ ≫
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NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
CRTC2 ↻ ≫
TBL1XR1 ↻ ≫
DMAC1 ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
ZNF547 ↻ ≫
ZCCHC4 ↻ ≫
TRAPPC2B ↻ ≫
MTRF1 ↻ ≫
SCAF1 ↻ ≫
RRAS ↻ ≫
ZNF225 ↻ ≫
SSBP3 ↻ ≫
RABL2A ↻ ≫
GTF2H4 ↻ ≫
ZSWIM3 ↻ ≫
TMTC3 ↻ ≫
SEC11C ↻ ≫
CEP290 ↻ ≫
ACOT8 ↻ ≫
ZNF687 ↻ ≫
STK25 ↻ ≫
COX7C ↻ ≫
ZC3H12A ↻ ≫
SPHK2 ↻ ≫
RPL18 ↻ ≫
RANBP2 ↻ ≫
FAM83E ↻ ≫
NUDT13 ↻ ≫
NDUFB5 ↻ ≫
MRPL47 ↻ ≫
GUF1 ↻ ≫
TULP2 ↻ ≫
SMARCAL1 ↻ ≫
NUCB1 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
UBQLN4 ↻ ≫
STAM ↻ ≫
LAMTOR2 ↻ ≫
CAND1 ↻ ≫
TBP ↻ ≫
PSMB6 ↻ ≫
PSMB1 ↻ ≫
NDUFAF5 ↻ ≫
ESF1 ↻ ≫
WDR46 ↻ ≫
PFDN6 ↻ ≫
BUB3 ↻ ≫
ZCCHC8 ↻ ≫
VARS1 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
H4C5 ↻ ≫
H2BC7 ↻ ≫
TMEM107 ↻ ≫
TRIP10 ↻ ≫
GPR108 ↻ ≫
MEIS1 ↻ ≫
ZMAT2 ↻ ≫
VRK1 ↻ ≫
SMG8 ↻ ≫
RPS6KB2 ↻ ≫
METTL3 ↻ ≫
KMT2B ↻ ≫
FCF1 ↻ ≫
AREL1 ↻ ≫
COMMD1 ↻ ≫
CCT4 ↻ ≫
TOR1AIP2 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
OAZ3 ↻ ≫
NUP205 ↻ ≫
MRPL9 ↻ ≫
KBTBD6 ↻ ≫
TIMM21 ↻ ≫
SHPK ↻ ≫
PPP1R12C ↻ ≫
PNPLA6 ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
FBXO15 ↻ ≫
EMC4 ↻ ≫
CTNS ↻ ≫
SLC35E2B ↻ ≫
GTF3C3 ↻ ≫
HDAC9 ↻ ≫
PSENEN ↻ ≫
LIN37 ↻ ≫
GSTO2 ↻ ≫
ANAPC5 ↻ ≫
ZNF628 ↻ ≫
TRDMT1 ↻ ≫
TNFRSF12A ↻ ≫
THOC6 ↻ ≫
PHB2 ↻ ≫
HEMK1 ↻ ≫
HCFC1R1 ↻ ≫
C3orf18 ↻ ≫
RHOT2 ↻ ≫
SIRT4 ↻ ≫
ZFYVE19 ↻ ≫
VWA5A ↻ ≫
NPRL2 ↻ ≫
MRPL28 ↻ ≫
DNAJC17 ↻ ≫
CYB561D2 ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
ZNF605 ↻ ≫
KRT15 ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
NUF2 ↻ ≫
TM4SF18 ↻ ≫
MITD1 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
KBTBD4 ↻ ≫
AK2 ↻ ≫
MRPL53 ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
MICOS13 ↻ ≫
HSD11B1L ↻ ≫
SSBP2 ↻ ≫
ZNF286A ↻ ≫
UFD1 ↻ ≫
NFIB ↻ ≫
CDC45 ↻ ≫
AHCYL2 ↻ ≫
VPS25 ↻ ≫
UBR2 ↻ ≫
RPL37 ↻ ≫
CTU1 ↻ ≫
CDK5RAP2 ↻ ≫
POLDIP3 ↻ ≫
ATP5F1B ↻ ≫
ATP5MG ↻ ≫
ZNF383 ↻ ≫
ZNF337 ↻ ≫
PSMD11 ↻ ≫
NFKBIL1 ↻ ≫
EIF4A3 ↻ ≫
DDX39B ↻ ≫
ATP6V1G2 ↻ ≫
PSPN ↻ ≫
ALKBH7 ↻ ≫
ZSCAN32 ↻ ≫
ZNF174 ↻ ≫
SEL1L ↻ ≫
HEXIM2 ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
ATP6V1G1 ↻ ≫
UBAC1 ↻ ≫
TATDN3 ↻ ≫
PEX3 ↻ ≫
NSL1 ↻ ≫
GOSR2 ↻ ≫
FARSB ↻ ≫
ADAT2 ↻ ≫
CA11 ↻ ≫
ARHGEF1 ↻ ≫
UFSP2 ↻ ≫
TMEM94 ↻ ≫
C4orf47 ↻ ≫
RPL14 ↻ ≫
PTDSS2 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
LSG1 ↻ ≫
UTP11 ↻ ≫
RARB ↻ ≫
C1orf159 ↻ ≫
ZC3H10 ↻ ≫
RPL41 ↻ ≫
RAB5C ↻ ≫
FAM187A ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CRADD ↻ ≫
CD2BP2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
BAHCC1 ↻ ≫
ZNF500 ↻ ≫
SUFU ↻ ≫
NMT1 ↻ ≫
FASTKD1 ↻ ≫
DCAKD ↻ ≫
ACTR1A ↻ ≫
ZNF776 ↻ ≫
TIMMDC1 ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
DCAF7 ↻ ≫
TLE3 ↻ ≫
ZNF444 ↻ ≫
SIRT2 ↻ ≫
NFKBIB ↻ ≫
CLN3 ↻ ≫
APOBR ↻ ≫
SSR3 ↻ ≫
NLK ↻ ≫
STT3A ↻ ≫
SART3 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
ISCU ↻ ≫
DSTYK ↻ ≫
DLGAP1 ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
STX16 ↻ ≫
VCPIP1 ↻ ≫
C8orf44-SGK3 ↻ ≫
SELENOH ↻ ≫
SLX4IP ↻ ≫
MKKS ↻ ≫
SMARCD2 ↻ ≫
PDE6D ↻ ≫
NME1-NME2 ↻ ≫
NME1 ↻ ≫
HEXB ↻ ≫
COPS7B ↻ ≫
TRMT10C ↻ ≫
TRAPPC6B ↻ ≫
TRAPPC3 ↻ ≫
TMEM60 ↻ ≫
SMAD3 ↻ ≫
PNN ↻ ≫
PHTF2 ↻ ≫
KRT23 ↻ ≫
EXD2 ↻ ≫
COX7A2L ↻ ≫
USHBP1 ↻ ≫
BABAM1 ↻ ≫
TBC1D10B ↻ ≫
MYLPF ↻ ≫
TSNAX ↻ ≫
MT2A ↻ ≫
RPL18A ↻ ≫
HEXA ↻ ≫
ZNF143 ↻ ≫
LMAN2 ↻ ≫
FBXW11 ↻ ≫
C19orf67 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
C8orf58 ↻ ≫
FLAD1 ↻ ≫
TRAF7 ↻ ≫
SUPT7L ↻ ≫
SLC4A1AP ↻ ≫
API5 ↻ ≫
TPGS1 ↻ ≫
EXOC4 ↻ ≫
VEZT ↻ ≫
SNX15 ↻ ≫
MTMR9 ↻ ≫
FGD6 ↻ ≫
COPS7A ↻ ≫
SUPV3L1 ↻ ≫
SUGP1 ↻ ≫
SNX1 ↻ ≫
RPIA ↻ ≫
MAU2 ↻ ≫
H4C8 ↻ ≫
CIAO2A ↻ ≫
LTN1 ↻ ≫
ZNF235 ↻ ≫
CTDP1 ↻ ≫
EMCN ↻ ≫
ZNF26 ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
MRPL20 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
ZNF420 ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
ZNF384 ↻ ≫
THAP1 ↻ ≫
RBM25 ↻ ≫
SSBP1 ↻ ≫
PWWP2A ↻ ≫
TMX2 ↻ ≫
TAOK3 ↻ ≫
SUDS3 ↻ ≫
RNF121 ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
MED19 ↻ ≫
LOC100133315 ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
SCYL3 ↻ ≫
ZNF688 ↻ ≫
CDCA8 ↻ ≫
C1orf109 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
ZNF226 ↻ ≫
SRD5A1 ↻ ≫
SCRIB ↻ ≫
RPL27 ↻ ≫
EIF2AK3 ↻ ≫
TPRKB ↻ ≫
ZBTB45 ↻ ≫
MARS1 ↻ ≫
ARHGAP9 ↻ ≫
TMEM63C ↻ ≫
DHX8 ↻ ≫
PABPN1 ↻ ≫
GET3 ↻ ≫
DYNC2I2 ↻ ≫
USP48 ↻ ≫
TXNL4B ↻ ≫
DHX38 ↻ ≫
DUS3L ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
ZKSCAN8 ↻ ≫
ING3 ↻ ≫
RPL21 ↻ ≫
NTMT1 ↻ ≫
C9orf50 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
FRMPD4 ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
ZBTB38 ↻ ≫
PCM1 ↻ ≫
EMILIN2 ↻ ≫
MTRNR2L10 ↻ ≫
SLC25A20 ↻ ≫
PPP5D1 ↻ ≫
CALM3 ↻ ≫
FNDC3A ↻ ≫
TOP2A ↻ ≫
RPAIN ↻ ≫
NUP88 ↻ ≫
IARS2 ↻ ≫
BPNT1 ↻ ≫
EPS15 ↻ ≫
UBE2J1 ↻ ≫
INO80C ↻ ≫
SYT7 ↻ ≫
GLIPR1L1 ↻ ≫
CAPS2 ↻ ≫
PTEN ↻ ≫
KLLN ↻ ≫
CCL3 ↻ ≫
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HNRNPUL1 ↻ ≫
ARHGAP17 ↻ ≫
MYOM2 ↻ ≫
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PHF19 ↻ ≫
TOMM40L ↻ ≫
APOA2 ↻ ≫
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BRWD1 ↻ ≫
TRAPPC9 ↻ ≫
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ENPP4 ↻ ≫
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KLF2 ↻ ≫
GCLC ↻ ≫
LNPEP ↻ ≫
ATP2C1 ↻ ≫
KLF6 ↻ ≫
TMEM256 ↻ ≫
NLGN2 ↻ ≫
FUT10 ↻ ≫
SCT ↻ ≫
CDHR5 ↻ ≫
RAP2B ↻ ≫
PRDM15 ↻ ≫
CCL5 ↻ ≫
TRIP4 ↻ ≫
GTPBP6 ↻ ≫
SMCO1 ↻ ≫
CXCR5 ↻ ≫
MRPS18C ↻ ≫
HELQ ↻ ≫
HCAR3 ↻ ≫
RAB11B ↻ ≫
DPP9 ↻ ≫
CCDC39 ↻ ≫
MDM4 ↻ ≫
ILF2 ↻ ≫
CCM2 ↻ ≫
XAB2 ↻ ≫
UBE2H ↻ ≫
PCP2 ↻ ≫
NCOA7 ↻ ≫
KANSL3 ↻ ≫
FER1L5 ↻ ≫
TJP1 ↻ ≫
RUFY3 ↻ ≫
C1orf198 ↻ ≫
H4C4 ↻ ≫
ZPBP2 ↻ ≫
USP3 ↻ ≫
RGS8 ↻ ≫
IKZF3 ↻ ≫
SKA2 ↻ ≫
PRR11 ↻ ≫
DRAP1 ↻ ≫
C11orf68 ↻ ≫
CSNK1G3 ↻ ≫
WHAMM ↻ ≫
FSD2 ↻ ≫
CHST12 ↻ ≫
BBX ↻ ≫
KMT2C ↻ ≫
HOOK1 ↻ ≫
MED23 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
NGB ↻ ≫
NAT16 ↻ ≫
SLC33A1 ↻ ≫
CMSS1 ↻ ≫
BIN2 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
EML2 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
LRRC14B ↻ ≫
FMO4 ↻ ≫
AQR ↻ ≫
MNT ↻ ≫
FGG ↻ ≫
USP30 ↻ ≫
POLG ↻ ≫
C2orf42 ↻ ≫
HSD11B1 ↻ ≫
LIME1 ↻ ≫
INSR ↻ ≫
ANP32C ↻ ≫
SATB1 ↻ ≫
LEFTY2 ↻ ≫
FAAP24 ↻ ≫
CEP89 ↻ ≫
TPST1 ↻ ≫
IFIT1 ↻ ≫
TP63 ↻ ≫
CCDC77 ↻ ≫
WBP1L ↻ ≫
LUC7L2 ↻ ≫
FMC1-LUC7L2 ↻ ≫
FMC1 ↻ ≫
CDC20 ↻ ≫
ZNF451 ↻ ≫
WAPL ↻ ≫
GALK2 ↻ ≫
COPS2 ↻ ≫
TYK2 ↻ ≫
PSMD4 ↻ ≫
KDSR ↻ ≫
TMEM109 ↻ ≫
TLR5 ↻ ≫
TIMM22 ↻ ≫
STAP2 ↻ ≫
SMARCE1 ↻ ≫
RAD51AP1 ↻ ≫
PRPF19 ↻ ≫
NR1H2 ↻ ≫
MPND ↻ ≫
EPYC ↻ ≫
C12orf4 ↻ ≫
RPL35A ↻ ≫
PRPF18 ↻ ≫
IQCG ↻ ≫
TUT1 ↻ ≫
SPTLC3 ↻ ≫
KIF16B ↻ ≫
ZNF609 ↻ ≫
EPRS1 ↻ ≫
RAP2A ↻ ≫
CRB1 ↻ ≫
C16orf72 ↻ ≫
KIF22 ↻ ≫
COPZ1 ↻ ≫
CCR2 ↻ ≫
ARNTL ↻ ≫
ZMYND8 ↻ ≫
SCAMP4 ↻ ≫
RAD51AP2 ↻ ≫
ADAT3 ↻ ≫
PPP6R1 ↻ ≫
OCSTAMP ↻ ≫
MYCBP2 ↻ ≫
LTA4H ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
MFAP3L ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
TSC1 ↻ ≫
TDRKH ↻ ≫
RAB40B ↻ ≫
GFI1B ↻ ≫
DHX16 ↻ ≫
NPIPB5 ↻ ≫
KLHL20 ↻ ≫
CLEC7A ↻ ≫
PLCD3 ↻ ≫
DPEP3 ↻ ≫
ACBD4 ↻ ≫
UNC93B1 ↻ ≫
STOML2 ↻ ≫
HAX1 ↻ ≫
ERVMER34-1 ↻ ≫
P2RY10 ↻ ≫
OXCT2 ↻ ≫
GORAB ↻ ≫
CYP2R1 ↻ ≫
CRYAA ↻ ≫
CRYAA2 ↻ ≫
TLDC2 ↻ ≫
SH3GL1 ↻ ≫
METTL26 ↻ ≫
CHAF1A ↻ ≫
PSAP ↻ ≫
EMX1 ↻ ≫
ECT2 ↻ ≫
UBE2I ↻ ≫
TOMM40 ↻ ≫
TFB2M ↻ ≫
RGS3 ↻ ≫
KCNN3 ↻ ≫
DDI2 ↻ ≫
CNST ↻ ≫
ZSWIM1 ↻ ≫
ZNF668 ↻ ≫
ZNF646 ↻ ≫
CHD6 ↻ ≫
CLPTM1L ↻ ≫
STBD1 ↻ ≫
PPP1R37 ↻ ≫
GPR89A ↻ ≫
GOLPH3L ↻ ≫
FAM207A ↻ ≫
ADRM1 ↻ ≫
NSMCE3 ↻ ≫
ITGB1BP1 ↻ ≫
IFT27 ↻ ≫
CPSF3 ↻ ≫
ZBTB5 ↻ ≫
TMEM218 ↻ ≫
LCOR ↻ ≫
CDC23 ↻ ≫
ARL1 ↻ ≫
TTC21A ↻ ≫
TNFRSF17 ↻ ≫
NPIPB2 ↻ ≫
GORASP1 ↻ ≫
GABPB2 ↻ ≫
AP3S2 ↻ ≫
SMARCA4 ↻ ≫
MYNN ↻ ≫
GSR ↻ ≫
CRYBB1 ↻ ≫
ACTRT3 ↻ ≫
STK17B ↻ ≫
SOD1 ↻ ≫
SACM1L ↻ ≫
SLC26A8 ↻ ≫
MAPK14 ↻ ≫
UTP3 ↻ ≫
NCBP2AS2 ↻ ≫
NCBP2 ↻ ≫
WDR36 ↻ ≫
SNAP47 ↻ ≫
OSBPL2 ↻ ≫
NBEAL2 ↻ ≫
NAA35 ↻ ≫
LYZL2 ↻ ≫
JMJD4 ↻ ≫
FMO1 ↻ ≫
RNF43 ↻ ≫
LOC102723996 ↻ ≫
ICOSLG ↻ ≫
WIPF1 ↻ ≫
MRPS15 ↻ ≫
DMAP1 ↻ ≫
ZMPSTE24 ↻ ≫
THADA ↻ ≫
NUCKS1 ↻ ≫
MAPKAPK2 ↻ ≫
ISOC2 ↻ ≫
FRYL ↻ ≫
CCDC61 ↻ ≫
BTN3A2 ↻ ≫
TAS2R38 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
NR1D1 ↻ ≫
FBXO8 ↻ ≫
FAM184A ↻ ≫
CEP44 ↻ ≫
UBE2T ↻ ≫
TAF3 ↻ ≫
PCDH1 ↻ ≫
NDUFAF1 ↻ ≫
GTF2H2C ↻ ≫
GTF2H2C_2 ↻ ≫
DNAJC14 ↻ ≫
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