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このデータベースについて

Gene

データ説明
データ名
Gene
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00681-004
データ内容の説明
SEVENSで解析した遺伝子に関するアノテーション情報を格納しています。
データファイル
データファイル名 :
sevens_gene.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
22.8MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/sevens_gene
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

97,351件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ID

 遺伝子名

 Pseudo

 pseudogeneか否か(空欄:gene pseudo:pseudogene)

 Novel

 新規であるか否か

 Chromosome

 染色体番号

 Level

 レベル(A~D)※下表参照

 Family

 ファミリー(分からない場合 "UNKNOWN")

 Alternativeproducts

 Swiss-protにalternative productsの記載がない場合は空欄、ある場合はシノニム(シノニムがなければNONEと表記)

 Swiss-Prot BLAST top hit

 対Swiss-Protのトップヒット

 Swiss-Prot BLAST top hit (E-value)

 対Swiss-ProtのトップヒットのE-value

 Swiss-Prot BLAST top hit (Identity)

 対Swiss-ProtのトップヒットのIdentity

 NCBI nr-aa BLAST top hit

 対nrのトップヒット

 NCBI nr-aa BLAST top hit (E-value)

 対nrのトップヒットのE-value

 NCBI nr-aa BLAST top hit (Identity)

 対nrのトップヒットのIdentity

 NCBI Unigene BLAST top hit

 対Unigeneのトップヒット

 NCBI Unigene BLAST top hit (E-value)

 対UnigeneのトップヒットのE-value

 NCBI Unigene BLAST top hit (Identity)

 対UnigeneのトップヒットのIdentity

 Expression

 Unigene ID

 Ligand

 リガンド(複数知られている場合は1種のみ表示)

 G-protein coupling

 G蛋白質とのカップリング(0がカップリングしない、1がカップリングする) 左から順に、Gi/o、Gq/11、Gs、G12/13

 Sequence

 アミノ酸配列

 Leftend

 遺伝子の左末端

 Rightend

 遺伝子の右末端