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このデータベースについて

スポット情報

データ説明
データ名
スポット情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00191-002
データ内容の説明
2次元ゲル電気泳動を行って得たスポットの一覧です。各スポットについて、分子量・等電点・発現量等の情報、および決定したアミノ酸配列に対する相同検索結果情報等をまとめました。
データファイル
データファイル名 :
rpd_spot.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
326 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rpd_spot
データ取得方法

実験

解析方法

2次元電気泳動画像に基づいてそれぞれのタンパク質を精製し、気相プロティンシーケンサーあるいは質量分析計でアミノ酸配列を決定しました。
気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列については、Blast検索によって相同検索結果を得ました。
質量分析計で決定したアミノ酸配列については、Mascot解析によって相同検索結果を得ました。

データ件数

14,724 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Spot ID

スポットID

Spot No.

スポット番号

tissue ID

2次元ゲル電気泳動のID

pI

タンパク質の等電点

MW

タンパク質の分子量

organism

材料の生物種名

tissue

採取した組織、または細胞小器官名

expression

発現量

spot gel image

当該スポットのゲル拡大画像

Mass Spectrometry Accession No.

Mascot解析による相同なタンパク質のアクセション番号

Mass Spectrometry Homologous Protein

Mascot解析による相同なタンパク質のdefinition

Mass Spectrometry Score (%)

Mascotスコア

Protein Sequencer Accession No.

プロテインシーケンサによる相同なタンパク質のアクセション番号(複数件)

Protein Sequencer Homologous Protein

プロテインシーケンサによる相同なタンパク質のdefinition(複数件)

cDNA Accession No.

相同なcDNAのアクセション番号(複数件)