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このデータベースについて

Entire Sequence

データ説明
データ名
Entire Sequence
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00193-002
データ内容の説明
イネミトコンドリアゲノムの全配列のデータです。全長490520bpです。この配列は、アクセッション番号AB076665, AB076666として国際塩基配列データベースに登録され、後に1つのアクセッション番号<a href="http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/BA000029/?filetype=html">BA000029</a>にまとめられています。<a href="http://rapdb.dna.affrc.go.jp/">RAP-DB</a>の旧ゲノムブラウザにも<a href="http://rapdblegacy.dna.affrc.go.jp/viewer/gbrowse/build4/?start=1;stop=490520;ref=Mt;width=800;version=100;cache=on;drag_and_drop=on;show_tooltips=on;grid=on;id=3907a478e7814676ae31f9d46797d0a8;label=organelle_predicted_gene-organelle_tRNA-organelle_rRNA-organelle_RNA_editing-DNA_GC_Content">収録</a>されています。
データファイル
データファイル名 :
rmg_seq.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
142 KB
簡易検索URL
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データ取得方法

Kadowaki et al. (1996) に示す方法でミトコンドリアDNAを調製し、SauAIもしくはTspEIで断片化したショットガンライブラリのプラスミドクローンを、dideoxy法で配列決定しています。

解析方法

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データ件数

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データ詳細
データ詳細はありません。
項目名 項目の説明