このデータベースについて
アイソザイムの遺伝子座リスト
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データ名
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アイソザイムの遺伝子座リスト | ||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00318-02-003 |
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データ内容の説明
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アイソザイム遺伝子として推定され、本高密度連鎖地図にマッピングされた、cDNAクローンについての情報リスト | ||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
rgp_gmap98_isozyme_loci.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
611 B
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rgp_gmap98_isozyme_loci | ||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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タンパク質データベースを用いたcDNAの類似性解析より。 |
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解析方法
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5'末端の300-400bpからcDNAインサートの配列を決定し、PIR (Rel.48.0)とSWISS PROT (Rel.33)で類似配列の探索を行いました。類似性スコアリングにはBLOSUM50マトリックスを使用しました。類似性検索で期待値が0.0001より小さく、スコアが最高値を示すクローンを機能的に同定されたクローンとしました。また、マップされたcDNAの塩基配列がアイソザイム遺伝子に類似性検索にてHitしたものを選抜しました。 |
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データ件数
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15 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||
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