このデータベースについて
組織特異的発現データ
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データ名
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組織特異的発現データ | ||||||||
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DOI
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データ内容の説明
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ROKU法によって計算した、組織特異的発現のデータ。 | ||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
refex_tissue_specific01_genechip_human_gse7307.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
560 KB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix | ||||||||
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データ取得方法
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EST, GeneChip, CAGE, RNA-seqの4種類の手法で測定された遺伝子発現データを用いて組織特異性を計算した。 |
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解析方法
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遺伝子発現データに対し、BioconductorのTCCライブラリのROKU関数を使って組織特異性を算出した。ROKU法について詳細はhttp://bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/TCC/man/TCC.pdf pp.22-24 を参照。 |
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データ件数
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| データ詳細 | |||||||||
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