- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
[ Japanese | English ]
このデータベースについて

遺伝子発現データ

データ説明
データ名
遺伝子発現データ
DOI

データ内容の説明
EST, GeneChip, CAGE, RNA-seqの4種類の手法で測定された遺伝子発現データ。データ名は、原則として実験手法と組織分類等により以下のように決められている。 RefEx_expression_(実験手法)(組織分類数)_(生物種) 例:RefEx_expression_EST10_human など ただし、CAGE法によるデータの一部は、以下のような名前になっている。 RefEx_expression_CAGE_all_(生物種) 例:RefEx_expression_CAGE_all_human など
データファイル
データファイル名 :
refex_expression01_cage10_human_prjdb1099.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
908 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/refex_data_relationship_matrix
データ取得方法

EST: NCBI UniGene
GeneChip
ヒト: GSE7307(Human body index - transcriptional profiling)
マウス: GSE10246(GNF Mouse GeneAtlas V3)
ラット: GSE952(Transcriptome analysis in rat)
CAGE
ヒト: PRJDB1099 (FANTOM5 Human CAGE)
マウス: PRJDB1100 (FANTOM5 Mouse CAGE)
RNA-seq
ヒト: PRJEB2445 (RNA-Seq of human individual tissues and mixture of 16 tissues (Illumina Body Map))
マウス: PRJNA30467(Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-Seq; brain, liver, muscle)

解析方法

https://github.com/dbcls/RefEx/tree/master/Rawdata_Processing

データ件数

-

データ詳細
データ詳細はありません。
項目名 項目の説明