このデータベースについて
クラスター一覧
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データ名
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クラスター一覧 | ||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00147-002 |
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データ内容の説明
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クラスター情報の一覧。全データをマージして作成したクラスター (Merge cluster)と由来組織及び発生段階ライブラリごとに作成したクラスター (Tissue cluster)の2種類のクラスタが存在する。ここではMerge clusterごとにTissue cluster（ライブラリ）別のクローン数の内訳とクローン情報一覧へのリンクを示している。Tissue clusterのクローン数は由来組織ごとの擬似的な発現量として把握することに利用可能である。 さらにMerge clusterごとに代表クローンを１つ選定しBlast検索の結果を示している。代表クローンの一部は完全長配列を決定している (<span style="color: #0000ff;"><a href="jp/medaka-full-length-cdna-db/data-3.html" target="_blank">完全長配列を決定した代表クローン一覧</a></span>を参照)。 | ||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
medaka_full_length_cdna_merge_cluster.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
813KB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/medaka_full_length_cdna_merge_cluster | ||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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なし |
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解析方法
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全データをマージし、FASTAによってクラスタリング。 |
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データ件数
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47,902件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||
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