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KNApSAcK Core
生物種-代謝物関係データ
データ説明
データ名
生物種-代謝物関係データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V003
バージョン
V3
10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V003
更新履歴
V2
10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V002
更新履歴
V1
10.18908/lsdba.nbdc00545-001.V001
-
データ内容の説明
生物種とその生物における代謝物の関係について、研究者が多くの論文を読んで整理し、データベース化して収録した。
データファイル
データファイル名:
knapsack_core.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/knapsack-core/LATEST/knapsack_core.zip
ファイルサイズ:
2.3 MB
データファイル名:
SD.zip (構造式画像ファイル)
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/knapsack-core/LATEST/SD.zip
ファイルサイズ:
191 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/knapsack_core
データ取得方法
-
解析方法
-
データ件数
50,110種の代謝物と116,316対の生物種
データ詳細
項目名
項目の説明
C_ID
代謝物と生物種の対毎に付与されたID
CAS RN
CAS登録番号
Metabolite
代謝物の名称
Molecular Formula
代謝物の組成式
Organism
生物種名
Kingdom
生物種の界名
Family
生物種の科名
Genus
生物種の属名
SMILES
代謝物の組成式をSMILESで表したもの
InChI
代謝物の組成式をInChIKeyで表したもの
InChIKey
代謝物の組成式をInChIKeyで表したもの
Reference
参考
Structural formula
代謝物の組成式画像ファイル名(簡易検索ではサムネイルを表示)
このデータベースについて
データベースの説明
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利用許諾
このデータベースの更新履歴