このデータベースについて
トランスクリプトームアノテーション情報（ヒト、ショウジョウバエ）
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データ名
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トランスクリプトームアノテーション情報（ヒト、ショウジョウバエ） | ||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc02443-003 |
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バージョン
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データ内容の説明
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各転写産物をヒトおよびショウジョウバエの遺伝子セットをsubjectにしてBLAST検索し、トップヒットした遺伝子シンボルを割当てることでアノテーション情報を付与した。 | ||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
kaiko_annotation_human_drosophila_data.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
391 KB
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簡易検索URL
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https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kaiko_annotation_human_drosophila_data | ||||||||
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データ取得方法
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Referece trasnscriptomic data に対して、Ensemble内のhuman (version GRCh38)とDrosophila melanogaster (version BDGP6.22)のprotein データセットに対して blastをしてトップヒットした遺伝子をBiomartを用いてシンボル表記に変換した。 |
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解析方法
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Blast検索 |
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データ件数
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51,926 件 |
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| データ詳細 | |||||||||
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