このデータベースについて
Mapping Information
| データ説明 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
データ名
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Mapping Information | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00114-004 |
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データ内容の説明
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多型をゲノムにマッピングした結果。 「Dump JSNP」 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/map/cgi-bin/Dump/snp_region_filter.cgi より提供されていた。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
jsnp_dump.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
24 MB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/jsnp_dump | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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データ「Screening Information」「Allele Frequency」より |
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解析方法
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多型前後配列をRefSeq（GRCh37）のゲノムコンティグ配列（NT）（MaskerAidで反復配列をマスキング済）にBLASTでマッピング。
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データ件数
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980,939 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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