Screening Information
| データ説明 | |||||||||||||||||||||||||||||||
データ名
|
Screening Information | ||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
DOI
|
10.18908/lsdba.nbdc00114-003 |
||||||||||||||||||||||||||||||
|
データ内容の説明
|
多型探索実験における各種情報。 「データ提供」 http://snp.ims.u-tokyo.ac.jp/data_roots.html の「各遺伝子構造中の塩基置換型の頻度別」より提供されていた。 | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
データファイル
|
データファイル名 :
jsnp_screen.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
15.6 MB
|
||||||||||||||||||||||||||||||
|
簡易検索URL
|
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/jsnp_screen | ||||||||||||||||||||||||||||||
|
データ取得方法
|
GenBankやRefSeqのヒトゲノム配列より選択したエクソン、プロモーター領域、イントロンを、24人（東大・JST）、48人（理研）または40人（女子医大）の日本人ボランティアより得たDNAサンプルを鋳型としてPCR増幅し、キャピラリーシークエンサーでシークエンス。 |
||||||||||||||||||||||||||||||
|
解析方法
|
PolyPhredで候補SNPsを検出し、シークエンス結果を目視で検証。 |
||||||||||||||||||||||||||||||
|
データ件数
|
197,195 件 |
||||||||||||||||||||||||||||||
| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||