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このデータベースについて

同定タンパク質データ

データ説明
データ名
同定タンパク質データ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01594-02-001
データ内容の説明
jPOSTリポジトリ上のプロテオームデータを再解析し、UniProt上のタンパク質データと同定した結果のサマリデータ。
データファイル
データファイル名 :
jpostdb_protein.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
11.8MB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/jpostdb_protein
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

530455

データ詳細
項目名 項目の説明
protein_id

jPOST内部のタンパク質ID

accession

UniProt ID

symbol

UniProt タンパク質シンボル

name

タンパク質名

protein_type

タンパク質の種類(Leading protein, Spectrum same-set protein Spectrum sub-set protein, Spectrum subsumable protein)

pep_count

同定されたペプチドの総数

psm_count

peptide specrum match(マススペクトルでマッチしたペプチド)の総数

uniq_pep_count

ユニークなペプチドの総数