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このデータベースについて

PPI実験情報

データ説明
データ名
PPI実験情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00077-008
データ内容の説明
ASKA Cloneを使って行ったタンパク質間相互作用の実験情報
データファイル
データファイル名 :
genobase_v6_ppi.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
388KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_ppi
データ取得方法

タンパク質相互作用実験

解析方法

-

データ件数

21,175件

データ詳細
項目名 項目の説明
Gel No

ゲルの番号

HIS Tag

HISタグの付いたベイトタンパク質を発現する遺伝子のID

Gene

上記の遺伝子の名前

MW

ベイトタンパク質の分子量(計算値)

Protein

ベイトタンパク質の名前

Sample ID

実験サンプルのID

Coverage

実験で得られたペプチドがアミノ酸配列に占める割合

JW

ベイトタンパク質に結合するプレイタンパク質を発現する遺伝子のID

Sharp ID

上記遺伝子のID(JWとは別系統)

Target Gene

上記遺伝子の名前

MW(exp)

結合したペプチドの分子量(実験値)

PI

結合したペプチドの等電点

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