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このデータベースについて

ORF配列情報

データ説明
データ名
ORF配列情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00077-007
データ内容の説明
本データベースに収録したORF及びその上流・下流の配列等
データファイル
データファイル名 :
genobase_v6_seq.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2.78MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/genobase_v6_seq
データ取得方法

-

解析方法

-

データ件数

4,550件

データ詳細
項目名 項目の説明
Gene ID

遺伝子のID

Left Point

ORFのゲノム上の開始位置

Right Point

ORFのゲノム上の終了位置

Direction

ORFの向き(5'->3'なら1、3'->5'なら-1、不明なら0)

Map min

ゲノム長を100とした場合の、このORFの位置

NT Seq Length

ORF配列長

AA Seq Length

ORF配列を翻訳したアミノ酸配列長

Start Codon

開始コドン

Stop Codon

終止コドン

Upstream Sequence

ORFの上流500bpの配列

Sequence

ORF配列

Amino Acid Sequence

ORF配列を翻訳したアミノ酸配列

Downstream Sequence

ORFの下流200bpの配列