このデータベースについて
９５生物種のタンパク質アミノ酸配列間の類似度比較に基づくクラスター
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データ名
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９５生物種のタンパク質アミノ酸配列間の類似度比較に基づくクラスター | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00464-002 |
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データ内容の説明
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本データベース中のアミノ酸配列データを総当たりでBLASTP検索し、E-valueとオーバーラップスコア（相同な領域の割合）をクラスタリングの条件として用い、 クラスター毎に最適なE-valueとオーバーラップスコアの領域を求める方法 （<a href="http://gclust.c.u-tokyo.ac.jp/" rel="external">Bioinformatics 2009 Mar 1;25(5):599-605.</a>） でクラスタリングを行った。 CSV形式のテキストファイル。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
gclust_cluster.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
8.72MB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/gclust_cluster | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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本データベース中の配列データ |
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解析方法
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- |
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データ件数
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206,764件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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