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このデータベースについて

Results of de-novo and Motif activity analyses

データ説明
データ名
Results of de-novo and Motif activity analyses
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01389-005.V003
バージョン
V3 10.18908/lsdba.nbdc01389-005.V003 -
V2 10.18908/lsdba.nbdc01389-005.V002 -
V1 10.18908/lsdba.nbdc01389-005.V001 -
データ内容の説明
転写開始点領域近傍における転写因子結合部位モチーフの解析結果。 <ul> <li>HOMER等による de novoモチーフ解析</li> <li>de novo モチーフや既知転写因子結合モチーフ(JASPARに登録されているもの)と、CAGEで測定された転写開始活性との相関に関する有意性</li> </ul>
データファイル
データファイル名 :
Motifs
データのURL :
ファイルサイズ :
6.2 GB
簡易検索URL
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データ取得方法

-

解析方法

JASPER モチーフ探索
HOMER モチーフ解析

データ件数

400 ファイル

データ詳細
データ詳細はありません。
項目名 項目の説明