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生命科学系データベースアーカイブ

Atlas (ISH Data Base)

データベースの説明

データベース全般

info 名称 Atlas (ISH Data Base)
info 名称の読み方 -
info 別名 -
info DOI 
info 作成者 
作成者氏名:
前田 ミネ子
作成者英名:
Mineko Maeda
作成者所属:
大阪大学（作成時）
作成者氏名:
漆原 秀子*
作成者英名:
Hideko Urushihara
作成者所属:
筑波大学
info 連絡先 

〒305-8572 茨城県つくば市天王台1-1-1
筑波大学大学院生命環境科学研究科
TEL: 029-853-4664
FAX: 029-853-6614
E-mail:

info データベース分類 マイクロアレイデータ、その他の発現データのデータベース
info 生物種 
生物種名:
Dictyostelium discoideum
Taxonomy ID:
info データベースの説明 

Dictyostelium discoideum cDNAクローンについて、 Whole-mount in situ hybridization に基づく空間的遺伝子発現情報を収録したもの。

info データベースの特長・有用性・活用方法 

シンプルな発生・分化をすることでモデル生物として利用されているDictyostelium discoideumの発生期に発現する遺伝子について局在データを示すことにより、それらの遺伝子機能について推察することができる。 また、部位特異的な遺伝子についてDicty_cDBへのリンクから遺伝子の構造とアノテーション情報を得ることができる。

info データベースの利用許諾 CC 表示-継承 詳細
info 予算的背景・プロジェクト 
名称:
文部科学省特定領域研究　ゲノム研究
https://www.genome-sci.jp/tokutei2005/modules/g4_paper2/paperinfo.php?paperid=3803
info 論文等 
文献名:
Changing patterns of gene expression in dictyostelium prestalk cell subtypes recognized by in situ hybridization with genes from microarray analyses.
著者名:
Maeda M, Sakamoto H, Iranfar N, Fuller D, Maruo T, Ogihara S, Morio T, Urushihara H, Tanaka Y, Loomis WF.
雑誌名/掲載年月/号:
Eukaryot Cell. 2003 Jun;2(3):627-37.
外部リンク:
 
文献名:
Control of cell type proportioning in Dictyostelium discoideum by differentiation-inducing factor as determined by in situ hybridization.
著者名:
Maruo T, Sakamoto H, Iranfar N, Fuller D, Morio T, Urushihara H, Tanaka Y, Maeda M, Loomis WF.
雑誌名/掲載年月/号:
Eukaryot Cell. 2004 Oct;3(5):1241-8.
外部リンク:
 

データベースのオリジナルサイト情報

info データベース運用場所 

筑波大学 大学院生命環境科学研究科 遺伝情報学 発生・ゲノム情報

info オリジナルサイト 運用終了
info 運用開始年月日 2003/10
info 最終更新年月日 2004/04/02
info 統括サイト -
info データの一括ダウンロードサイト -
info 参照先データベース -
info 一覧表示 無し
info クエリ検索 有り
info Webサービス 無し
info WebサービスURL -
info ユーザ登録 無し