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このデータベースについて

BLOCKS情報

データ説明
データ名
BLOCKS情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00411-005
データ内容の説明
BLOCKSリストに対応するBLOCKSエントリ情報とPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況のデータです。
データファイル
データファイル名 :
dbspire_blocks_info.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
305 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbspire_blocks_info
データ取得方法

BLOCKS

解析方法

ワード検索、モチーフ検索

データ件数

29,068 件

データ詳細
項目名 項目の説明
blocksAC

BLOCKSデータベースのAC番号

PDB SEQRES

BLOCKS ACに対応するBLOCKS - PDB SEQRESマッチングデータへのリンク(簡易検索のみ)

PDB ATOM

BLOCKS ACに対応するBLOCKS - PDB ATOMマッチングデータへのリンク(簡易検索のみ)

blocksACFamily

本エントリのファミリーAC番号

Family VS PDB

ファミリーAC番号に対応するBLOCKS - PDBマッチングデータへのリンク(簡易検索のみ)

blocksID

BLOCKS ID

blocksDE

本エントリの説明

blocks3dIdSize

MASTによりアノテーション付けされたPDBの個数

blocks3dChainSize

MASTによりアノテーション付けされたPDBチェインの個数

blocks3dSeqIdSize

本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数

blocks3dSeqChainSize

本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数

blocks3dAtomIdSize

本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBの個数

blocks3dAtomChainSize

本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数