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このデータベースについて

BLOCKSリスト

データ説明
データ名
BLOCKSリスト
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00411-004
データ内容の説明
BLOCKSのエントリとPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況を示したリストです。
データファイル
データファイル名 :
dbspire_blocks_list.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
113 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbspire_blocks_list
データ取得方法

BLOCKS

解析方法

ワード検索、モチーフ検索

データ件数

5,900 件

データ詳細
項目名 項目の説明
blocksFamilyAC

BLOCKSデータベースのファミリーAC番号

BLOCKS Info

blocksFamilyACに対応するBLOCKS情報のエントリにリンク(簡易検索のみ)

blocksType

このACの由来(PRINTSまたはPROTOMAT)

blocksFamilySize

同じファミリーAC番号を持つBLOCKSエントリの個数

blocksPrints

PRINTSデータベースのAC番号(blocksTypeがPRINTSの場合のみ)

blocksName

BLOCKSデータベースの当該エントリの説明

blocks3dIdFamilySize

MASTによりアノテーション付けされたPDBの個数

blocks3dChainFamilySize

MASTによりアノテーション付けされたPDBチェインの個数

blocks3dSeqIdFamilySize

本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数

blocks3dSeqChainFamilySize

本データベースでSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数

blocks3dAtomIdFamilySize

本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBの個数

blocks3dAtomChainFamilySize

本データベースでATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数