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このデータベースについて

PROSITE情報

データ説明
データ名
PROSITE情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00411-002
データ内容の説明
PROSITEリストに対応するPROSITEエントリ情報とPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況のデータです。
データファイル
データファイル名 :
dbspire_prosite_info.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
54.8 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbspire_prosite_info
データ取得方法

PROSITE

解析方法

ワード検索、モチーフ検索

データ件数

2,178 件

データ詳細
項目名 項目の説明
prositeAC

PROSITE AC番号

PDB SEQRES

prositeACに対応するPROSITE - PDB SEQRESマッチングデータへのリンク(簡易検索のみ)

prositeID

PROSITE ID

prositeIDType

ACのタイプ

prositeDE

当該PROSITEエントリの説明

prositeDO

PROSITE DO番号

prosite3dSize

PROSITEデータベースで、本エントリにアノテーション付けされたPDBの個数

prosite3dSeqIdSize

本データベースでPROSITE AC番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数

prosite3dSeqChainSize

本データベースでPROSITE AC番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数

prosite3dAtomIdSize

本データベースでPROSITE AC番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBの個数

prosite3dAtomChainSize

本データベースでPROSITE AC番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数