PROSITE情報

データ名

PROSITE情報

DOI

データ内容の説明

PROSITEリストに対応するPROSITEエントリ情報とPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況のデータです。

データファイル

データファイル名:

dbspire_prosite_info.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

54.8 KB

簡易検索URL

データ取得方法

PROSITE

解析方法

ワード検索、モチーフ検索

データ件数

2,178 件

項目名	項目の説明
prositeAC	PROSITE AC番号
PDB SEQRES	prositeACに対応するPROSITE - PDB SEQRESマッチングデータへのリンク（簡易検索のみ）
prositeID	PROSITE ID
prositeIDType	ACのタイプ
prositeDE	当該PROSITEエントリの説明
prositeDO	PROSITE DO番号
prosite3dSize	PROSITEデータベースで、本エントリにアノテーション付けされたPDBの個数
prosite3dSeqIdSize	本データベースでPROSITE AC番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数
prosite3dSeqChainSize	本データベースでPROSITE AC番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数
prosite3dAtomIdSize	本データベースでPROSITE AC番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBの個数
prosite3dAtomChainSize	本データベースでPROSITE AC番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数

このデータベースについて