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このデータベースについて

PROSITEリスト

データ説明
データ名
PROSITEリスト
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00411-001
データ内容の説明
PROSITEのエントリとPDBのエントリおよびチェインへのマッチング状況を示したリストです。
データファイル
データファイル名 :
dbspire_prosite_list.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
29.1 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dbspire_prosite_list
データ取得方法

PROSITE

解析方法

ワード検索、モチーフ検索

データ件数

1,565 件

データ詳細
項目名 項目の説明
prositeLisAC

PROSITE DO番号

PROSITE Info

prositeLisACに対応するPROSITE情報のエントリにリンク(簡易検索のみ)

prositeLisFamilySize

PROSITE DO番号に対応するACの個数

prositeLisDE

PROSITE DO番号に対応するdescription

prositeLisPatternSize

PROSITE DO番号に対応するパターンACの個数

prositeLisRuleSize

PROSITE DO番号に対応するルールACの個数

prositeLisRuleWithPASize

PROSITE DO番号に対応するパターン・ルールACの個数

prositeLisRuleWithMASize

PROSITE DO番号に対応するマトリクス・ルールACの個数

prositeLisMatrixSize

PROSITE DO番号に対応するマトリクスACの個数

prosite3dLisIdSize

PROSITEのデータベースにアノテーションされているPROSITE DO番号に対応するPDBの個数

prosite3dSeqIdLisSize

本データベースでPROSITE DO番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBの個数

prosite3dSeqChainLisSize

本データベースでPROSITE DO番号に対応するSEQRES配列とマッチングしたPDBチェインの個数

prosite3dAtomIdLisSize

本データベースでPROSITE DO番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBの個数

prosite3dAtomChainLisSize

本データベースでPROSITE DO番号に対応するATOM配列とマッチングしたPDBチェインの個数