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このデータベースについて

クラスター

データ説明
データ名
クラスター
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01137-002
データ内容の説明
Blastx相同性検索やGOアノテーションを含むクラスター情報
データファイル
データファイル名 :
clest_cluster.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
525 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/clest_cluster
データ取得方法

「Clone」データ

解析方法

Phred/phrapによるクラスタリング、NCBIのNon-redundantタンパク質データベースに対するBlastx相同性検索、Blast2GOを用いたGOアノテーションとDescriptionの記載

データ件数

3,161 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Cluster ID

クラスターID

Description

予測された遺伝子機能

Category

配列の分類

Length

コンセンサス配列長

Sequence

コンセンサス配列

Source

由来クローン

No. of clones

由来クローンの数

Top Blastx hit (E value < 1e-6)

Blastx検索トップヒットの遺伝子名

ACC No.

Blastx検索トップヒットのアクセッションナンバー

E-value

Blastx検索トップヒットのE-value

GO

GOアノテーション