このデータベースについて
表現型の変異
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データ名
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表現型の変異 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01509-005 |
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データ内容の説明
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文献から収集された表現型には、形態的特徴、環境への応答性など様々なものがある。ここでは、それらの表現型がすべてオントロジータームとプロパティとの組み合わせで表現され、標準化されてリストされている。 形態に関する表現型は、原則的にPlant Ontology (PO)あるいはTrait Ontology (TO)の語彙とPhenotype Ontology (PATO)の語彙の組み合わせで表現される。PATOが「大きい」・「長い」などの性質、POがそれが現れる部位（器官名・組織名）および発育段階などをそれぞれ表す。生化学的な性質・ストレス耐性などの表現型はGene Ontology (GO), ChEBIなどのオントロジーも利用して表現する。 「長日条件」など、ある特定の環境条件で観察される表現型もある。その場合の環境条件は別のクラスにまとめられており、表現型情報からリンクされている。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
cpp_abnormality.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
12 KB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/cpp_abnormality#ja | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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Plant Ontology, Phenotype Ontology |
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解析方法
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- |
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データ件数
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488 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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