Experiment list
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Data name
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Experiment list | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01558-001.V020 |
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Description of data contents
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A list of metadata of the reanalysed ChIP-Seq data archived in Sequence Read Archive (SRA), grouped by SRA Experiment ID, providing the information of reference genome data, antigen, or cell type. See details here: <a href="https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#downloads_doc" target="_blank">https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#downloads_doc</a> | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Data file
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File name :
chip_atlas_experiment_list.zip
File URL :
File size :
29 MB
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Simple search URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/chip_atlas_experiment_list#en | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Data acquisition method
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We have processed data downloaded from SRA by using a standard ChIP-Seq data analysis pipeline, then we curated metadata of archived data manually. |
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Data analysis method
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See details of data processing here: https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki |
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Number of data entries
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439,593 entries |
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| Data detail | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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