NBDC Nikkaji RDF

360万件以上の化学物質の日化辞番号、分子式、分子量、和名、英名など基本情報のRDFデータです。

日化辞番号（日化辞の化学物質のID）とInChIおよびInChIKeyの関係のRDFデータ。日化辞のコアデータのRDFデータと組み合わせて使うことをお薦めします。

日化辞番号（日化辞の化学物質のID）とCanonical SMILESの関係のRDFデータ。Chemical Information Ontology（CHEMINF）やSemanticscience Integrated Ontology（SIO）などのオントロジーを使用。日化辞のコアデータのRDFデータと組み合わせて使うことをお薦めします。

日化辞の化学物質と、研究者、文献、特許、遺伝子など科学技術情報を関連づけて提供するJ-GLOBAL(http://jglobal.jst.go.jp/)のリンク情報のRDFデータ。

PubChemやChEMBLなど世界の主要な化合物DBのRDFで採用しているSemanticscience Integrated Ontology（SIO）およびChemical Information Ontology（CHEMINF）などを用いて記述した分子式と分子量とRDFデータ。

InChIKeyの情報に基づき化合物データベース間の化合物IDのマッピング情報を提供しているUniChem(https://www.ebi.ac.uk/unichem/)のデータを活用し、日化辞化合物と他のデータベース*で収録されている化合物との対応関係をskos:closeMatchを用いて記述したRDFデータ。

*: ChEMBL, DrugBank, PDB, Guide to Pharmacology, KEGG, ChEBI, ZINC, Gene Expression Atlas, PharmGKB, Human Metabolome Database (HMDB), PubChem, NMRShiftDB, Aggregated Computational Toxicology Resource (ACToR), BindingDB, KNApSAcK.

日化辞の個々の化合物とPubChemのSubstance、CompoundおよびGlyTouCan (https://glytoucan.org/)の化合物の対応関係をskos:exactMatchやskos:closeMatchを用いて記述したRDFデータ。このデータはBioHackathon 2015 (http://2015.biohackathon.org/hackathon)の成果の1つです。

化学物質の日化辞番号（dcterms:identifier）、日英のラベル名（rdfs:label）、タイプ（rdf:type）、化学構造図（foaf:depiction）、同一のオブジェクト（owl:sameAs）など日化辞の本体のRDFデータから抽出したデータです。日化辞のInChIのRDFデータなどと組み合わせて使うことをお薦めします。

日化辞番号（日化辞の化学物質のID）とMOL/SDF情報（MOL/SDFファイルの内容をURLエンコードした文字列）の関係のRDFデータ。Chemical Information Ontology（CHEMINF）やSemanticscience Integrated Ontology（SIO）などのオントロジーを使用。日化辞のコアデータのRDFデータと組み合わせて使うことをお薦めします。