ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Smc1a

Query protein: Smc1a
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX5436004 | ES cells
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Smc1a's Target genes

◢ Smc1a: Average

◢ SRX2599821: 3T3-L1

◢ SRX2599822: 3T3-L1

◢ SRX2599823: 3T3-L1

◢ SRX2599824: 3T3-L1

◢ SRX2599825: 3T3-L1

◢ SRX2599826: 3T3-L1

◢ SRX2599827: 3T3-L1

◢ SRX2599828: 3T3-L1

◢ SRX2599829: 3T3-L1

◢ SRX2599830: 3T3-L1

◢ SRX2957352: AtT-20

◢ SRX218284: B cells

◢ SRX218288: B cells

◢ SRX700951: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX700952: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348143: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348144: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348145: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX7348146: CD4 CD8 double positive cells

◢ SRX6988645: Cerebellum

◢ SRX6988646: Cerebellum

◢ SRX6988647: Cerebellum

◢ SRX6988648: Cerebellum

◢ SRX204343: Embryonic brains

◢ SRX4395347: Embryonic brains

◢ SRX4395356: Embryonic brains

◢ DRX021197: Embryonic head

◢ DRX021198: Embryonic limb

◢ SRX204337: Embryonic limb

◢ SRX204338: Embryonic limb

◢ SRX3024490: Embryonic limb

◢ SRX2440040: EpiSC

◢ SRX2440041: EpiSC

◢ SRX2440050: EpiSC

◢ SRX2440051: EpiSC

◢ SRX2440060: EpiSC

◢ SRX2440061: EpiSC

◢ SRX022688: ES cells

◢ SRX022689: ES cells

◢ SRX085109: ES cells

◢ SRX085110: ES cells

◢ SRX2440036: ES cells

◢ SRX2440037: ES cells

◢ SRX2440070: ES cells

◢ SRX2440071: ES cells

◢ SRX2440080: ES cells

◢ SRX2440081: ES cells

◢ SRX4167137: ES cells

◢ SRX5125620: ES cells

◢ SRX5125624: ES cells

◢ SRX5401524: ES cells

◢ SRX5401525: ES cells

◢ SRX5401526: ES cells

◢ SRX5401527: ES cells

◢ SRX5401528: ES cells

◢ SRX5401529: ES cells

◣ SRX5436004: ES cells

◢ SRX5858855: ES cells

◢ SRX5858856: ES cells

◢ SRX5858857: ES cells

◢ SRX5858858: ES cells

◢ SRX6831866: ES cells

◢ SRX6831867: ES cells

◢ SRX7786279: ES cells

◢ SRX7786280: ES cells

◢ SRX7786281: ES cells

◢ SRX7786282: ES cells

◢ SRX6903169: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903170: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903174: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX6903175: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX2436121: Mammary glands

◢ SRX2564298: Mammary glands

◢ SRX2564307: Mammary glands

◢ SRX2564312: Mammary glands

◢ SRX2564313: Mammary glands

◢ SRX022702: MEF

◢ SRX022703: MEF

◢ SRX120168: MEF

◢ SRX120169: MEF

◢ SRX120170: MEF

◢ SRX976733: MEF

◢ SRX976734: MEF

◢ SRX5358275: mESCs, differentiated

◢ SRX5358276: mESCs, differentiated

◢ SRX5358277: mESCs, differentiated

◢ SRX5358278: mESCs, differentiated

◢ SRX5358279: mESCs, differentiated

◢ SRX5358280: mESCs, differentiated

◢ SRX125273: mESC derived neural cells

◢ SRX1631901: Sperm

◢ SRX2370885: Sperm

◢ SRX7348141: Thymocytes

◢ SRX7348142: Thymocytes

◢ SRX4546348: Trophoblast stem cells

◢ SRX4546349: Trophoblast stem cells

◢ SRX1306535: T cells

◢ SRX5318290: Uterus

◢ SRX5318291: Uterus

◢ SRX5318292: Uterus

◢ Smc1a: STRING
Ccdc110 ↻ ≫
Tmem270 ↻ ≫
Radil ↻ ≫
Slc39a10 ↻ ≫
Col1a1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Kcnh1 ↻ ≫
Gins4 ↻ ≫
Mgat5b ↻ ≫
Mtnr1a ↻ ≫
Vps18 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Pear1 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
6820408C15Rik ↻ ≫
Cstdc2 ↻ ≫
Tmem14a ↻ ≫
Fdxacb1 ↻ ≫
1110032A03Rik ↻ ≫
Nat8f4 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
Abca14 ↻ ≫
Ptpre ↻ ≫
Mterf1a ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Dhx8 ↻ ≫
Ahcyl1 ↻ ≫
Snx18 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Pde2a ↻ ≫
Ankrd39 ↻ ≫
Alpl ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Pxn ↻ ≫
Zfp638 ↻ ≫
Dmtn ↻ ≫
Hcrtr1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Faap20 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Slc36a1 ↻ ≫
Spns1 ↻ ≫
Pou2f2 ↻ ≫
Spata20 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Megf10 ↻ ≫
Cdk9 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Wnt7a ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Nipsnap2 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Cdc73 ↻ ≫
Adam19 ↻ ≫
Igfbp7 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Alox12e ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Atmin ↻ ≫
Lgi4 ↻ ≫
Slc48a1 ↻ ≫
Scnn1g ↻ ≫
Slc25a45 ↻ ≫
Palm ↻ ≫
Cep164 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Grik4 ↻ ≫
Cilk1 ↻ ≫
Ddx20 ↻ ≫
Rae1 ↻ ≫
Ap1m2 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Selenom ↻ ≫
Rab27a ↻ ≫
Lrfn2 ↻ ≫
Col23a1 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Tinf2 ↻ ≫
Dagla ↻ ≫
Cfap299 ↻ ≫
Gm3667 ↻ ≫
Map7 ↻ ≫
Trex1 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Disp3 ↻ ≫
Rhof ↻ ≫
Hook2 ↻ ≫
Epb41l4b ↻ ≫
Pdzd9 ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Cebpb ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Comtd1 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Cbfa2t3 ↻ ≫
Tcf7l1 ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Vav2 ↻ ≫
Rac3 ↻ ≫
Timm22 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Copg1 ↻ ≫
Igf1r ↻ ≫
2410004P03Rik ↻ ≫
Mterf1b ↻ ≫
Tspan18 ↻ ≫
Kcnj11 ↻ ≫
Cdk20 ↻ ≫
Ror2 ↻ ≫
Dact3 ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Gnpda1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Steap1 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Sik2 ↻ ≫
Parm1 ↻ ≫
Dip2b ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
A630001G21Rik ↻ ≫
Gprc5b ↻ ≫
Dusp23 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Sema6b ↻ ≫
Tnfrsf21 ↻ ≫
Myrf ↻ ≫
Islr2 ↻ ≫
Ccin ↻ ≫
Basp1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Slc6a19 ↻ ≫
Dock5 ↻ ≫
Limk2 ↻ ≫
Bptf ↻ ≫
Pds5b ↻ ≫
Gstm1 ↻ ≫
Spock1 ↻ ≫
Cd300lg ↻ ≫
Slc35f1 ↻ ≫
Epb41l4a ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
4930451I11Rik ↻ ≫
Fcor ↻ ≫
Man2b2 ↻ ≫
Adrm1 ↻ ≫
Rab37 ↻ ≫
Meltf ↻ ≫
Ddx24 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Pcp4 ↻ ≫
Rai1 ↻ ≫
Mettl21a ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Apba2 ↻ ≫
Synm ↻ ≫
Nog ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Nes ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Rnf43 ↻ ≫
Ryr2 ↻ ≫
Pex7 ↻ ≫
Itgbl1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Dpep2 ↻ ≫
Aadat ↻ ≫
Cluap1 ↻ ≫
1700037C18Rik ↻ ≫
Snrpe ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Fam171a1 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Gtf2h2 ↻ ≫
Tgfb3 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Tsen54 ↻ ≫
Caskin2 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Vps36 ↻ ≫
Tonsl ↻ ≫
Scara5 ↻ ≫
Ehmt1 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Neto2 ↻ ≫
Rasal1 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Crybg1 ↻ ≫
Tmem200a ↻ ≫
Cemip ↻ ≫
Rab32 ↻ ≫
Deptor ↻ ≫
Gm7932 ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Dnmbp ↻ ≫
2610042L04Rik ↻ ≫
Socs3 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Diaph1 ↻ ≫
Bcl2l1 ↻ ≫
Ubr4 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Ctxn1 ↻ ≫
Meak7 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Man2a2 ↻ ≫
Arhgef17 ↻ ≫
Atp7a ↻ ≫
Pfn4 ↻ ≫
Fam228b ↻ ≫
Tfap2c ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Thbs3 ↻ ≫
Rilp ↻ ≫
Mmgt2 ↻ ≫
Lrrc75a ↻ ≫
Carmil2 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Ntrk1 ↻ ≫
Insrr ↻ ≫
Lingo1 ↻ ≫
Flvcr2 ↻ ≫
Rimbp3 ↻ ≫
Upf1 ↻ ≫
Sik1 ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Pink1 ↻ ≫
Fuca1 ↻ ≫
Dapk1 ↻ ≫
Txnl4a ↻ ≫
Gm16286 ↻ ≫
Ccny ↻ ≫
Nudt17 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Depdc1b ↻ ≫
Nme8 ↻ ≫
Lsr ↻ ≫
Fam187b ↻ ≫
Sgsm1 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Calb2 ↻ ≫
Crls1 ↻ ≫
B3gat2 ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Dsel ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Dpp6 ↻ ≫
Drd1 ↻ ≫
Trpm5 ↻ ≫
Tpbgl ↻ ≫
Gpr135 ↻ ≫
Dlk2 ↻ ≫
Mc3r ↻ ≫
Scgb1c1 ↻ ≫
Clu ↻ ≫
Apob ↻ ≫
Aldh1a2 ↻ ≫
Crh ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Plcb1 ↻ ≫
Apba1 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Syt17 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Prlhr ↻ ≫
Trip10 ↻ ≫
Gpr108 ↻ ≫
Tmem158 ↻ ≫
Ephb1 ↻ ≫
Ccdc126 ↻ ≫
Elovl2 ↻ ≫
Zcwpw2 ↻ ≫
Azi2 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Endov ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Smarcc2 ↻ ≫
Rgs9 ↻ ≫
Cdkn2aipnl ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Acss2 ↻ ≫
Cdk5rap3 ↻ ≫
Cdh22 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Ablim3 ↻ ≫
Tctn3 ↻ ≫
Entpd1 ↻ ≫
Slco2b1 ↻ ≫
Rrp9 ↻ ≫
Parp3 ↻ ≫
Rasgrp1 ↻ ≫
Tph2 ↻ ≫
Mlf2 ↻ ≫
Srcin1 ↻ ≫
Nhlrc1 ↻ ≫
Fam83h ↻ ≫
Afap1l2 ↻ ≫
Hcn1 ↻ ≫
App ↻ ≫
Tedc1 ↻ ≫
Dgcr6 ↻ ≫
Ephb3 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Kcnj6 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Gm5544 ↻ ≫
Apbb2 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Ints7 ↻ ≫
Dtl ↻ ≫
Casp2 ↻ ≫
Fam222a ↻ ≫
Cenpc1 ↻ ≫
Rasd1 ↻ ≫
Kif26a ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
B3glct ↻ ≫
Ltbp2 ↻ ≫
Astl ↻ ≫
Gnptab ↻ ≫
Tent5b ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Mafa ↻ ≫
Msantd1 ↻ ≫
Myo5b ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Pkn3 ↻ ≫
Mcm5 ↻ ≫
Hsd3b7 ↻ ≫
Fbxo34 ↻ ≫
Pomk ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Lgr6 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Slc22a23 ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Gm11100 ↻ ≫
Tesk1 ↻ ≫
Ddx41 ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Gm6569 ↻ ≫
Barx2 ↻ ≫
Slc43a2 ↻ ≫
Dop1a ↻ ≫
Slc2a4 ↻ ≫
BC004004 ↻ ≫
Dazl ↻ ≫
Rbm17 ↻ ≫
Bend3 ↻ ≫
Samd9l ↻ ≫
Csf3 ↻ ≫
Nceh1 ↻ ≫
Pts ↻ ≫
Rcan2 ↻ ≫
Plin3 ↻ ≫
Sorl1 ↻ ≫
Cpne8 ↻ ≫
Amigo3 ↻ ≫
Igsf11 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Tmcc2 ↻ ≫
8030462N17Rik ↻ ≫
Pcdhac1 ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
AI413582 ↻ ≫
Inka1 ↻ ≫
Adra2b ↻ ≫
Cd276 ↻ ≫
Traf5 ↻ ≫
Zpbp ↻ ≫
Vps37d ↻ ≫
Sncb ↻ ≫
Col6a2 ↻ ≫
Nectin2 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Upk2 ↻ ≫
Sorcs2 ↻ ≫
Fam151b ↻ ≫
Lrrc8c ↻ ≫
Rhou ↻ ≫
Amz2 ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
Ankle1 ↻ ≫
Adprhl1 ↻ ≫
Dusp13 ↻ ≫
Trpv2 ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Rpl10a ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Cux1 ↻ ≫
Mnd1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Apc2 ↻ ≫
Dner ↻ ≫
Cbl ↻ ≫
Pik3cd ↻ ≫
Zfp398 ↻ ≫
Gm3500 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Dcdc5 ↻ ≫
Ppp1r14a ↻ ≫
Catip ↻ ≫
Nagpa ↻ ≫
Crhr1 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Mrpl17 ↻ ≫
Mcidas ↻ ≫
Efnb1 ↻ ≫
Znrf1 ↻ ≫
Phldb2 ↻ ≫
Creg2 ↻ ≫
Adamts17 ↻ ≫
Patz1 ↻ ≫
Rnf150 ↻ ≫
Ap5b1 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Erap1 ↻ ≫
Slc6a4 ↻ ≫
Cyp1a1 ↻ ≫
Lrig2 ↻ ≫
Ntrk2 ↻ ≫
Arl4a ↻ ≫
Neurog2 ↻ ≫
Slc7a7 ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Atp2c1 ↻ ≫
Gm10406 ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Gcnt1 ↻ ≫
Ptprm ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Stat6 ↻ ≫
Csk ↻ ≫
Tiparp ↻ ≫
Rprm ↻ ≫
LOC114841036 ↻ ≫
Fkbp2 ↻ ≫
Gfi1b ↻ ≫
Mecom ↻ ≫
Kmt2b ↻ ≫
Fbl ↻ ≫
Rdh10 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Ninj2 ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Gad1 ↻ ≫
Cyren ↻ ≫
Bicdl2 ↻ ≫
Sugp2 ↻ ≫
Armc6 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Stum ↻ ≫
Itga10 ↻ ≫
Nectin1 ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Tnfaip8l2 ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
F3 ↻ ≫
Ppm1j ↻ ≫
Lactbl1 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Adgrb2 ↻ ≫
Spag1 ↻ ≫
Chd1l ↻ ≫
Boll ↻ ≫
Fgf18 ↻ ≫
Wdr38 ↻ ≫
Cdkn2b ↻ ≫
Olfml2a ↻ ≫
Ovca2 ↻ ≫
Parp11 ↻ ≫
Lsmem1 ↻ ≫
Srgap1 ↻ ≫
Abt1 ↻ ≫
Man2c1 ↻ ≫
Dtwd2 ↻ ≫
Rpl37rt ↻ ≫
Tcerg1l ↻ ≫
Slc2a1 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
Pafah1b2 ↻ ≫
Sik3 ↻ ≫
Best1 ↻ ≫
Klhdc9 ↻ ≫
Rab3il1 ↻ ≫
Tgm2 ↻ ≫
Kifc2 ↻ ≫
Farp1 ↻ ≫
Cyhr1 ↻ ≫
1700018F24Rik ↻ ≫
Vegfa ↻ ≫
Kctd15 ↻ ≫
Fhod3 ↻ ≫
Fmnl3 ↻ ≫
Tap2 ↻ ≫
Gdnf ↻ ≫
Pcdhga12 ↻ ≫
Fbxo32 ↻ ≫
Tnfaip3 ↻ ≫
Sympk ↻ ≫
Foxa3 ↻ ≫
Dapk2 ↻ ≫
Slc12a9 ↻ ≫
Elmo1 ↻ ≫
Ankrd52 ↻ ≫
Rab35 ↻ ≫
Apoa2 ↻ ≫
Egr2 ↻ ≫
Ndufaf6 ↻ ≫
Ntn5 ↻ ≫
Zfp345 ↻ ≫
Cog1 ↻ ≫
Scn3a ↻ ≫
Mrpl38 ↻ ≫
E130311K13Rik ↻ ≫
Ndufaf4 ↻ ≫
Hbq1a ↻ ≫
Wdr41 ↻ ≫
Tmem92 ↻ ≫
Myo7a ↻ ≫
Rasgef1c ↻ ≫
Car13 ↻ ≫
Zfp746 ↻ ≫
Gtsf1l ↻ ≫
Car2 ↻ ≫
Clpb ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Wnt9a ↻ ≫
Abcc5 ↻ ≫
Crbn ↻ ≫
Coil ↻ ≫
Tpd52l1 ↻ ≫
Rbpjl ↻ ≫
Ect2l ↻ ≫
Myo1b ↻ ≫
Nkain2 ↻ ≫
Mafb ↻ ≫
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Nxph3 ↻ ≫
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Dnah7a ↻ ≫
Atg101 ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
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Megf8 ↻ ≫
Pdrg1 ↻ ≫
Peak1 ↻ ≫
Hmg20a ↻ ≫
Npepl1 ↻ ≫
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Npff ↻ ≫
Fam136a ↻ ≫
Stk11 ↻ ≫
Efna2 ↻ ≫
Pex10 ↻ ≫
Atad2b ↻ ≫
Tbc1d9b ↻ ≫
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Spin1 ↻ ≫
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Cdk6 ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
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Pigo ↻ ≫
Grk2 ↻ ≫
Syt8 ↻ ≫
Socs1 ↻ ≫
Erbb3 ↻ ≫
Tmem106c ↻ ≫
Lrrc71 ↻ ≫
Fbxo7 ↻ ≫
Carmil1 ↻ ≫
Adra2a ↻ ≫
Tlr2 ↻ ≫
1700125H20Rik ↻ ≫
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