ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1017451 | P19
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

◢ SRX003140: 3T3-L1

◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX467367: IDG-SW3

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◢ SRX6658448: Liver

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◣ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Greb1 ↻ ≫
Nkx2-6 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Lemd2 ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Spink10 ↻ ≫
Fbxo38 ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Appl2 ↻ ≫
Crk ↻ ≫
Uqcrh ↻ ≫
Lrrc41 ↻ ≫
Cep350 ↻ ≫
Yjefn3 ↻ ≫
Tssk6 ↻ ≫
Ndufa13 ↻ ≫
Calr ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Pnpla6 ↻ ≫
Map1lc3b ↻ ≫
Gzf1 ↻ ≫
Nxt1 ↻ ≫
Pcif1 ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Wiz ↻ ≫
Ctnnbl1 ↻ ≫
Pknox1 ↻ ≫
Wbp1l ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Supt5 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Rab13 ↻ ≫
Rps27rt ↻ ≫
Rps27 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Ccdc174 ↻ ≫
Crlf2 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Exoc7 ↻ ≫
Cd209a ↻ ≫
Fbxl18 ↻ ≫
Cox8c ↻ ≫
Supt3 ↻ ≫
F11r ↻ ≫
Olfr1274 ↻ ≫
Zfp143 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Gm10710 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Zfp819 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Adam17 ↻ ≫
Psmc5 ↻ ≫
Ftsj3 ↻ ≫
Pald1 ↻ ≫
Iscu ↻ ≫
Sart3 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Ube2g1 ↻ ≫
Stra6 ↻ ≫
Cerk ↻ ≫
Mettl23 ↻ ≫
Jmjd6 ↻ ≫
Srsf2 ↻ ≫
Fzd8 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Rsph3b ↻ ≫
Pramel32 ↻ ≫
Dnah7b ↻ ≫
Pcdh20 ↻ ≫
Ercc6l ↻ ≫
Nedd9 ↻ ≫
Tent5c ↻ ≫
Zfp949 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Lrr1 ↻ ≫
Csf2ra ↻ ≫
Nrtn ↻ ≫
Dus3l ↻ ≫
Prr22 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Gltpd2 ↻ ≫
Psmb6 ↻ ≫
Gm40193 ↻ ≫
Hoxc4 ↻ ≫
Setd4 ↻ ≫
Cbr1 ↻ ≫
Wasf3 ↻ ≫
Acacb ↻ ≫
Speer4f1 ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Srbd1 ↻ ≫
Plekho2 ↻ ≫
Pif1 ↻ ≫
Col6a6 ↻ ≫
Wnt1 ↻ ≫
Ddn ↻ ≫
Ell3 ↻ ≫
Copz1 ↻ ≫
Gsdma2 ↻ ≫
Meox1 ↻ ≫
Cpa5 ↻ ≫
Proser1 ↻ ≫
Nhlrc3 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Eed ↻ ≫
Pax6 ↻ ≫
Cdh12 ↻ ≫
Smug1 ↻ ≫
Gse1 ↻ ≫
Prtg ↻ ≫
Mis18bp1 ↻ ≫
Olfm1 ↻ ≫
Tmem211 ↻ ≫
Hpf1 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Cdca7 ↻ ≫
Lypd11 ↻ ≫
Rad51ap2 ↻ ≫
Slc37a3 ↻ ≫
Rab19 ↻ ≫
Gm11595 ↻ ≫
Krtap4-9 ↻ ≫
Krtap4-8 ↻ ≫
Mllt10 ↻ ≫
Skida1 ↻ ≫
Tmem18 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Evi5l ↻ ≫
BC048679 ↻ ≫
Ap3b2 ↻ ≫
Atp5g1 ↻ ≫
Cirbp ↻ ≫
H1f2 ↻ ≫
Fam174c ↻ ≫
H3c3 ↻ ≫
H2bc3 ↻ ≫
Sdhaf3 ↻ ≫
Vmn1r2 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
Plekhn1 ↻ ≫
Speer4e ↻ ≫
Ubap1l ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Phc2 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Mup2 ↻ ≫
Mup15 ↻ ≫
Gucy1b2 ↻ ≫
Jhy ↻ ≫
H3f3b ↻ ≫
Unk ↻ ≫
1700010B08Rik ↻ ≫
Esr1 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Tal2 ↻ ≫
Gtf3c6 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Gtf2a1 ↻ ≫
Jund ↻ ≫
Iqcn ↻ ≫
Csrnp2 ↻ ≫
Tsc2 ↻ ≫
Nthl1 ↻ ≫
Sp2 ↻ ≫
Kremen1 ↻ ≫
Gnas ↻ ≫
Tob1 ↻ ≫
Mup17 ↻ ≫
Rab6a ↻ ≫
Tox3 ↻ ≫
Dnajc12 ↻ ≫
Vit ↻ ≫
Hoxa4 ↻ ≫
Hoxa5 ↻ ≫
Dcdc2a ↻ ≫
Arl4d ↻ ≫
Nr1h4 ↻ ≫
H3c8 ↻ ≫
Mad2l2 ↻ ≫
H3c7 ↻ ≫
H2bc9 ↻ ≫
H4c6 ↻ ≫
Draxin ↻ ≫
Rplp2 ↻ ≫
Slc25a22 ↻ ≫
Pidd1 ↻ ≫
Wipf2 ↻ ≫
Dux ↻ ≫
Gm4981 ↻ ≫
Hoxd4 ↻ ≫
Zfp668 ↻ ≫
Zfp646 ↻ ≫
Ptges ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
St3gal2 ↻ ≫
Spag9 ↻ ≫
Hk3 ↻ ≫
Rassf4 ↻ ≫
Tbl1xr1 ↻ ≫
Marcksl1 ↻ ≫
Speer4f2 ↻ ≫
Fcgr3 ↻ ≫
Foxp1 ↻ ≫
Zbtb4 ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Poldip3 ↻ ≫
Adgra2 ↻ ≫
Hes3 ↻ ≫
Baz2a ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Col4a2 ↻ ≫
Rnf220 ↻ ≫
4931408C20Rik ↻ ≫
Hoxa1 ↻ ≫
Nkd1 ↻ ≫
Magi1 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Sirt4 ↻ ≫
Fam53c ↻ ≫
Cdc25c ↻ ≫
Ndufa4l2 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Zbtb37 ↻ ≫
Stac3 ↻ ≫
Cryzl2 ↻ ≫
Olfr1388 ↻ ≫
Olfr1387 ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
2410137M14Rik ↻ ≫
H2-M5 ↻ ≫
Prdm13 ↻ ≫
Metrn ↻ ≫
Ccdc78 ↻ ≫
Antkmt ↻ ≫
Maml2 ↻ ≫
Rap2b ↻ ≫
Odc1 ↻ ≫
Rassf8 ↻ ≫
Pip4p2 ↻ ≫
Tlk2 ↻ ≫
Rrp15 ↻ ≫
Mid1 ↻ ≫
Pgghg ↻ ≫
Gmppa ↻ ≫
Asic4 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Ttc39d ↻ ≫
Mink1 ↻ ≫
Casq1 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Skil ↻ ≫
Lrrc74a ↻ ≫
Angel1 ↻ ≫
Iqgap1 ↻ ≫
Pramel12 ↻ ≫
Cdhr2 ↻ ≫
Rnf44 ↻ ≫
BC107364 ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Hoxa3 ↻ ≫
Ric8b ↻ ≫
Hoxa6 ↻ ≫
Abhd2 ↻ ≫
Cfl2 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Zfp609 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Rbx1 ↻ ≫
Snx5 ↻ ≫
Mgme1 ↻ ≫
Marchf2 ↻ ≫
Lenep ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Hoxb3 ↻ ≫
Trim50 ↻ ≫
Fkbp6 ↻ ≫
Ppih ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Ssbp2 ↻ ≫
Brpf1 ↻ ≫
Mycl ↻ ≫
Gm10354 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Bloc1s5 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Chchd7 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Zfpm1 ↻ ≫
Kif2c ↻ ≫
Sh3glb1 ↻ ≫
Glul ↻ ≫
Teddm1a ↻ ≫
Dph6 ↻ ≫
Cacnb2 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Zfp503 ↻ ≫
Hoxb4 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Id2 ↻ ≫
Pik3r3 ↻ ≫
Fads1 ↻ ≫
Epb41 ↻ ≫
Rad23a ↻ ≫
Isg15 ↻ ≫
Agrn ↻ ≫
Llgl2 ↻ ≫
Klhdc8a ↻ ≫
H2bc8 ↻ ≫
H1f3 ↻ ≫
H2ac8 ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Nuak2 ↻ ≫
Zdbf2 ↻ ≫
Setd5 ↻ ≫
Gpr1 ↻ ≫
Sall2 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
Ppp2r3a ↻ ≫
H1f4 ↻ ≫
Mkrn2os ↻ ≫
Mkrn2 ↻ ≫
Ebag9 ↻ ≫
Tmprss11g ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Rab5b ↻ ≫
Cdk2 ↻ ≫
Pmel ↻ ≫
Mrpl23 ↻ ≫
Abraxas2 ↻ ≫
N4bp3 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Gpr84 ↻ ≫
Wfikkn1 ↻ ≫
Mettl26 ↻ ≫
H4c9 ↻ ≫
H2bc11 ↻ ≫
H2ac11 ↻ ≫
H2bc12 ↻ ≫
H2ac12 ↻ ≫
Gm7361 ↻ ≫
Rara ↻ ≫
Adtrp ↻ ≫
Hnrnpab ↻ ≫
Wwc2 ↻ ≫
Otud7b ↻ ≫
Prr14l ↻ ≫
Depdc5 ↻ ≫
Klf7 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
Usp25 ↻ ≫
E2f6 ↻ ≫
Mcl1 ↻ ≫
Insr ↻ ≫
Tmem268 ↻ ≫
Atp6v1g1 ↻ ≫
Mfsd11 ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Ctnnb1 ↻ ≫
Frmd6 ↻ ≫
Kmt2a ↻ ≫
Ggn ↻ ≫
Spred3 ↻ ≫
Tmem107 ↻ ≫
Cryzl1 ↻ ≫
Itsn1 ↻ ≫
Pisd ↻ ≫
Sh2b1 ↻ ≫
Lipt1 ↻ ≫
Tufm ↻ ≫
Tsga10 ↻ ≫
Slc39a10 ↻ ≫
Cd9 ↻ ≫
Adamts1 ↻ ≫
Dpagt1 ↻ ≫
H2ax ↻ ≫
Mrpl48 ↻ ≫
Hmbs ↻ ≫
Pth1r ↻ ≫
Rnaset2b ↻ ≫
Abi2 ↻ ≫
Hoxc6 ↻ ≫
Hoxc5 ↻ ≫
Ppp4r4 ↻ ≫
Srpx ↻ ≫
Slc25a4 ↻ ≫
LOC666331 ↻ ≫
Wdr25 ↻ ≫
Wars ↻ ≫
Gm11634 ↻ ≫
Dennd4a ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Dynll1 ↻ ≫
Tango6 ↻ ≫
Ptpru ↻ ≫
Mecr ↻ ≫
Uncx ↻ ≫
Taf4 ↻ ≫
Vmn1r25 ↻ ≫
Phlpp1 ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
H2bc7 ↻ ≫
H2ac7 ↻ ≫
Igsf5 ↻ ≫
Fzd5 ↻ ≫
Prss23 ↻ ≫
Jph1 ↻ ≫
Pold2 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Ptpn2 ↻ ≫
Glis2 ↻ ≫
Slc19a2 ↻ ≫
Plagl1 ↻ ≫
Usp37 ↻ ≫
Cnot9 ↻ ≫
Kif7 ↻ ≫
Mest ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Fam219a ↻ ≫
Dnaic1 ↻ ≫
Sp8 ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
Kmt2c ↻ ≫
Slf2 ↻ ≫
H4c17 ↻ ≫
H2bc15 ↻ ≫
H2ac15 ↻ ≫
H4c12 ↻ ≫
Tuba1a ↻ ≫
Cdca8 ↻ ≫
9930104L06Rik ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Ncoa7 ↻ ≫
Eno1 ↻ ≫
Ankrd1 ↻ ≫
Xpo1 ↻ ≫
Hgsnat ↻ ≫
C9orf72 ↻ ≫
Slc38a2 ↻ ≫
Dsg4 ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Necab2 ↻ ≫
Kdm2b ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Ccdc42 ↻ ≫
Slc4a3 ↻ ≫
Xpr1 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Mup7 ↻ ≫
Mdk ↻ ≫
Hlf ↻ ≫
Ptpn6 ↻ ≫
Grcc10 ↻ ≫
Smpd3 ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Notch1 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Fam234a ↻ ≫
Luc7l ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Taok3 ↻ ≫
Suds3 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
Usp12 ↻ ≫
Slc18b1 ↻ ≫
Rps12 ↻ ≫
Cdkn2d ↻ ≫
Ptprz1 ↻ ≫
Idh1 ↻ ≫
Pikfyve ↻ ≫
Bcl3 ↻ ≫
Kat6b ↻ ≫
Rnf115 ↻ ≫
Polr3c ↻ ≫
Olfr513 ↻ ≫
1700017B05Rik ↻ ≫
Inafm2 ↻ ≫
Dnajb4 ↻ ≫
Fubp1 ↻ ≫
Nfkb2 ↻ ≫
Foxp2 ↻ ≫
Pgpep1 ↻ ≫
Pdp1 ↻ ≫
Kdm3a ↻ ≫
Gatad2a ↻ ≫
Psmg1 ↻ ≫
Nolc1 ↻ ≫
Cfap20 ↻ ≫
Jpt1 ↻ ≫
Celf6 ↻ ≫
Iglon5 ↻ ≫
H3f3a ↻ ≫
Spaca6 ↻ ≫
Ndufv1 ↻ ≫
Tm2d1 ↻ ≫
Taar8c ↻ ≫
Taar9 ↻ ≫
Crabp2 ↻ ≫
Lmcd1 ↻ ≫
Fbn2 ↻ ≫
Smad7 ↻ ≫
Ap2a1 ↻ ≫
Zmynd11 ↻ ≫
Epb41l5 ↻ ≫
Capzb ↻ ≫
Mob4 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Arhgef7 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Gins2 ↻ ≫
Tmem141 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Chrna2 ↻ ≫
Gm5111 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Lgals6 ↻ ≫
Lgals4 ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Ackr2 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Zfp775 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Tfap2e ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Car11 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Myo1c ↻ ≫
Sphk2 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Rnf4 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Nkg7 ↻ ≫
Cldnd2 ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Etfb ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Grk5 ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Ddt ↻ ≫
Mkln1 ↻ ≫
Hsd17b4 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Ctsb ↻ ≫
Crtc2 ↻ ≫
Ager ↻ ≫
Cibar2 ↻ ≫
Slc39a1 ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Cks2 ↻ ≫
Agpat1 ↻ ≫
Tmem169 ↻ ≫
Pecr ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Lipg ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Rpl37rt ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Neu3 ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Bicral ↻ ≫
Secisbp2 ↻ ≫
Tle3 ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
Mcmbp ↻ ≫
Dlc1 ↻ ≫
Abcg8 ↻ ≫
Plin5 ↻ ≫
Fggy ↻ ≫
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