ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX020170 | Liver
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

◢ SRX003140: 3T3-L1

◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX150789: C17-2

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX467367: IDG-SW3

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◣ SRX020170: Liver

◢ SRX020173: Liver

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◢ SRX118180: Liver

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◢ SRX6658447: Liver

◢ SRX6658448: Liver

◢ SRX6658449: Liver

◢ SRX6658450: Liver

◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Cdkn1b ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Foxj2 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Ptgds ↻ ≫
Qrich1 ↻ ≫
Qars ↻ ≫
Tmem169 ↻ ≫
Pecr ↻ ≫
Omd ↻ ≫
Lenep ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Kyat3 ↻ ≫
Gm5111 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Zfp775 ↻ ≫
Adamts1 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Pla2g6 ↻ ≫
Greb1 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Cftr ↻ ≫
Hdhd3 ↻ ≫
Tmem141 ↻ ≫
Fcna ↻ ≫
Tle2 ↻ ≫
Rasgrp2 ↻ ≫
Ldhd ↻ ≫
Litaf ↻ ≫
Itprip ↻ ≫
Arhgef7 ↻ ≫
Tle3 ↻ ≫
Baiap2 ↻ ≫
Ptch1 ↻ ≫
Slc9a8 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
1600014C10Rik ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Slc8b1 ↻ ≫
Nr0b2 ↻ ≫
Ost4 ↻ ≫
Emilin1 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Prr32 ↻ ≫
Glipr2 ↻ ≫
Pnpla3 ↻ ≫
Fam166b ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Lrr1 ↻ ≫
Stt3a ↻ ≫
Grm7 ↻ ≫
Ergic1 ↻ ≫
Ccr7 ↻ ≫
Neurl3 ↻ ≫
Narf ↻ ≫
Cybc1 ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Sqor ↻ ≫
Trim80 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Csad ↻ ≫
Lipg ↻ ≫
Zfp874b ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Sema6c ↻ ≫
Cln6 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Fam160b1 ↻ ≫
Etnppl ↻ ≫
Myl3 ↻ ≫
Pth1r ↻ ≫
Cdkn2c ↻ ≫
Faf1 ↻ ≫
Ttbk1 ↻ ≫
Alb ↻ ≫
Gsta4 ↻ ≫
Lrrn4 ↻ ≫
Rwdd3 ↻ ≫
Skint6 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Ube2j2 ↻ ≫
Cyp3a59 ↻ ≫
Asgr2 ↻ ≫
S1pr3 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Stx1a ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Clpp ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Arhgap23 ↻ ≫
Car8 ↻ ≫
Arl4d ↻ ≫
Ace3 ↻ ≫
Myo1c ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
C1qtnf6 ↻ ≫
F12 ↻ ≫
Igsf10 ↻ ≫
Plxna1 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Mgst3 ↻ ≫
Krtap3-3 ↻ ≫
Krtap3-1 ↻ ≫
Krtap3-2 ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Cks2 ↻ ≫
Secisbp2 ↻ ≫
Nab2 ↻ ≫
LOC666331 ↻ ≫
Nemp1 ↻ ≫
Gm11634 ↻ ≫
Gulp1 ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
Frat1 ↻ ≫
Foxn3 ↻ ≫
Npcd ↻ ≫
Cbx6 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Ccdc38 ↻ ≫
Amdhd1 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
Actn4 ↻ ≫
Car11 ↻ ≫
Sphk2 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Mospd3 ↻ ≫
Mn1 ↻ ≫
A530016L24Rik ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Ifi35 ↻ ≫
Gatd1 ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Padi4 ↻ ≫
Gbp9 ↻ ≫
Colec11 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Tnks1bp1 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Zdhhc8 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Trp63 ↻ ≫
Zfp46 ↻ ≫
Mylip ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Neu3 ↻ ≫
Ndst1 ↻ ≫
H1f6 ↻ ≫
H4c3 ↻ ≫
Tmem178b ↻ ≫
Pik3c2g ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Cd38 ↻ ≫
LOC100861969 ↻ ≫
Il11ra2 ↻ ≫
Gm2002 ↻ ≫
Gm13305 ↻ ≫
Ccl21b ↻ ≫
Lhfpl2 ↻ ≫
Gcnt2 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Rassf4 ↻ ≫
Gpn3 ↻ ≫
Fam216a ↻ ≫
Eif3f ↻ ≫
Nlrp10 ↻ ≫
H2bc6 ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
H4c4 ↻ ≫
H2bc7 ↻ ≫
H2ac7 ↻ ≫
Epha1 ↻ ≫
Osbpl9 ↻ ≫
Plekhg4 ↻ ≫
Ppfia3 ↻ ≫
Defb11 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Sdr9c7 ↻ ≫
Cct8 ↻ ≫
Rdh7 ↻ ≫
Rskr ↻ ≫
Stat5b ↻ ≫
Cntfr ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Plekhg2 ↻ ≫
Ifih1 ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Flot2 ↻ ≫
Sult5a1 ↻ ≫
Spsb3 ↻ ≫
Nubp2 ↻ ≫
Igfals ↻ ≫
Ctnna3 ↻ ≫
Rps26 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Ikzf4 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Ifit3 ↻ ≫
Cfhr3 ↻ ≫
H2aj ↻ ≫
H4f16 ↻ ≫
Ttc36 ↻ ≫
Tmem25 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Ptpn3 ↻ ≫
Twist1 ↻ ≫
Olfr390 ↻ ≫
Olfr389 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
Map7d1 ↻ ≫
Trappc3 ↻ ≫
Olfr854 ↻ ≫
Olfr855 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Rab33a ↻ ≫
Aifm1 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Aup1 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Ccdc102a ↻ ≫
Abcg1 ↻ ≫
Adgrg5 ↻ ≫
Olfr1219 ↻ ≫
Polg ↻ ≫
Mapk4 ↻ ≫
Calr3 ↻ ≫
1700030K09Rik ↻ ≫
Celf2 ↻ ≫
Zfp715 ↻ ≫
Dpy19l1 ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Lrrc3 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Edil3 ↻ ≫
Ptbp3 ↻ ≫
Cyp20a1 ↻ ≫
Sirt7 ↻ ≫
Mafg ↻ ≫
H4bc24 ↻ ≫
H2bc23 ↻ ≫
H2ac24 ↻ ≫
H2ac23 ↻ ≫
H4c18 ↻ ≫
Gadd45b ↻ ≫
Lmnb2 ↻ ≫
Dlc1 ↻ ≫
Taar6 ↻ ≫
Taar7a ↻ ≫
Taar7b ↻ ≫
Tbl1x ↻ ≫
Dhrs9 ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Gle1 ↻ ≫
Ttc32 ↻ ≫
Car5a ↻ ≫
Banp ↻ ≫
Glyctk ↻ ≫
Fam53b ↻ ≫
Sec31a ↻ ≫
Bik ↻ ≫
Ak2 ↻ ≫
Col18a1 ↻ ≫
Glo1 ↻ ≫
Dnah8 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Zyg11a ↻ ≫
Otulinl ↻ ≫
Zscan4b ↻ ≫
Tpm1 ↻ ≫
Shd ↻ ≫
Fsd1 ↻ ≫
Rnf135 ↻ ≫
H3c13 ↻ ≫
H2bc18 ↻ ≫
H4c14 ↻ ≫
Cyp2t4 ↻ ≫
Rhox8 ↻ ≫
Alad ↻ ≫
Pole3 ↻ ≫
4933430I17Rik ↻ ≫
Cyp3a11 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Usp4 ↻ ≫
Gck ↻ ≫
Ass1 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Sun2 ↻ ≫
Wsb1 ↻ ≫
Cat ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Nek6 ↻ ≫
Ms4a1 ↻ ≫
Trim7 ↻ ≫
Apof ↻ ≫
Stat2 ↻ ≫
Pdcd7 ↻ ≫
Prdx2 ↻ ≫
Rnaseh2a ↻ ≫
Mfsd7a ↻ ≫
Pcgf3 ↻ ≫
Ugt1a9 ↻ ≫
Ugt1a10 ↻ ≫
Oxsr1 ↻ ≫
Klf3 ↻ ≫
Ctcfl ↻ ≫
Kansl3 ↻ ≫
Fer1l5 ↻ ≫
Chst13 ↻ ≫
Uroc1 ↻ ≫
Syt12 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Pcdh12 ↻ ≫
Togaram1 ↻ ≫
Stra6l ↻ ≫
Rilpl1 ↻ ≫
Klhl28 ↻ ≫
Tmed2 ↻ ≫
Shf ↻ ≫
Lgals3bp ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Cyp2b13 ↻ ≫
Spry1 ↻ ≫
Smim17 ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Kifc3 ↻ ≫
Taar8c ↻ ≫
Taar9 ↻ ≫
Irak1bp1 ↻ ≫
Podxl ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Sec23a ↻ ≫
Gemin2 ↻ ≫
Ankrd6 ↻ ≫
Wfdc1 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Ube2g2 ↻ ≫
Slc17a4 ↻ ≫
Sumo3 ↻ ≫
Sympk ↻ ≫
Dnmt3b ↻ ≫
Foxa3 ↻ ≫
Rragd ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Pinlyp ↻ ≫
Olfr1158 ↻ ≫
Adra1b ↻ ≫
Necab1 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Pid1 ↻ ≫
Psen2 ↻ ≫
Slc30a10 ↻ ≫
Gdi2 ↻ ≫
Cyp21a1 ↻ ≫
Nup153 ↻ ≫
Zfp608 ↻ ≫
Selenop ↻ ≫
Top2b ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Aldh2 ↻ ≫
Cfb ↻ ≫
1110038F14Rik ↻ ≫
Hexim2 ↻ ≫
Pdcd1lg2 ↻ ≫
Olfr117 ↻ ≫
Vmn1r203 ↻ ≫
Myocd ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Plk2 ↻ ≫
Nr1i2 ↻ ≫
Ifnar2 ↻ ≫
Serpina3m ↻ ≫
Ackr4 ↻ ≫
Ephx1 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Lgals7 ↻ ≫
Ugt1a1 ↻ ≫
Dnajb3 ↻ ≫
Cyp2e1 ↻ ≫
Lrmda ↻ ≫
Zdhhc3 ↻ ≫
Exosc7 ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Dlat ↻ ≫
Sult1e1 ↻ ≫
Gbp11 ↻ ≫
Rab11a ↻ ≫
Susd1 ↻ ≫
Tbcel ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Vta1 ↻ ≫
Ccdc107 ↻ ≫
Sall1 ↻ ≫
Serpina16 ↻ ≫
Sit1 ↻ ≫
Sec31b ↻ ≫
Acacb ↻ ≫
Plscr1 ↻ ≫
Bin2 ↻ ≫
Cd1d1 ↻ ≫
Nup54 ↻ ≫
Tpst2 ↻ ≫
Gramd3 ↻ ≫
Snx7 ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Tor1aip2 ↻ ≫
Tor1aip1 ↻ ≫
Ccdc124 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
9530077C05Rik ↻ ≫
Rhbdd1 ↻ ≫
Anln ↻ ≫
Olfr620 ↻ ≫
Olfr619 ↻ ≫
Abcb11 ↻ ≫
Cyp2c23 ↻ ≫
Serpina3g ↻ ≫
Ablim1 ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Chn2 ↻ ≫
Six6 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Med6 ↻ ≫
Wrap53 ↻ ≫
Trp53 ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Sh3glb2 ↻ ≫
Miga2 ↻ ≫
Foxp1 ↻ ≫
Pck1 ↻ ≫
Sfmbt1 ↻ ≫
Cyp4b1 ↻ ≫
Vps51 ↻ ≫
Tm7sf2 ↻ ≫
Zfpl1 ↻ ≫
Cdca5 ↻ ≫
Tmem262 ↻ ≫
Prkab1 ↻ ≫
Adgrg3 ↻ ≫
Tet3 ↻ ≫
Atp6ap1l ↻ ≫
Pum3 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Uox ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Olfr750 ↻ ≫
Rnase12 ↻ ≫
Chn1 ↻ ≫
Tbx19 ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Thrsp ↻ ≫
Grb14 ↻ ≫
Cyp2b9 ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Pramel32 ↻ ≫
Bcar3 ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Wfdc21 ↻ ≫
Heatr6 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Bicral ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Trp53inp1 ↻ ≫
Eef2k ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Npr1 ↻ ≫
Hrg ↻ ≫
Spaar ↻ ≫
Hrct1 ↻ ≫
Sdhaf1 ↻ ≫
Syne4 ↻ ≫
Alkbh6 ↻ ≫
Mmadhc ↻ ≫
Ctsw ↻ ≫
Fibp ↻ ≫
Efemp2 ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
Ahsg ↻ ≫
Atxn2l ↻ ≫
Pithd1 ↻ ≫
Ripor3 ↻ ≫
Obi1 ↻ ≫
Pax4 ↻ ≫
Psmd3 ↻ ≫
Zfp879 ↻ ≫
Grm6 ↻ ≫
Rnf220 ↻ ≫
Tmigd1 ↻ ≫
Gpr171 ↻ ≫
Aven ↻ ≫
Sirpb1c ↻ ≫
Ctxn3 ↻ ≫
Wwc2 ↻ ≫
Esrp2 ↻ ≫
Aldh1l1 ↻ ≫
1700113H08Rik ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
Nipsnap3b ↻ ≫
P2ry14 ↻ ≫
Lck ↻ ≫
Fam167b ↻ ≫
Wdr89 ↻ ≫
Itih1 ↻ ≫
Nek4 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Rad9b ↻ ≫
Ifitm6 ↻ ≫
Ifitm3 ↻ ≫
Gm826 ↻ ≫
Tctex1d4 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Tmem106a ↻ ≫
Tchp ↻ ≫
Kbtbd11 ↻ ≫
Clec9a ↻ ≫
Lhx5 ↻ ≫
Med4 ↻ ≫
BC034090 ↻ ≫
Gm7609 ↻ ≫
Taar8a ↻ ≫
Tmem237 ↻ ≫
Gm6460 ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
Cldn1 ↻ ≫
Col24a1 ↻ ≫
Nfatc2ip ↻ ≫
Hnf4a ↻ ≫
Ints10 ↻ ≫
Cwf19l1 ↻ ≫
Acaca ↻ ≫
Tcf21 ↻ ≫
Fyb2 ↻ ≫
Tex14 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Dhx16 ↻ ≫
Cyp3a25 ↻ ≫
Atg4d ↻ ≫
S1pr5 ↻ ≫
Ccdc177 ↻ ≫
Ssbp3 ↻ ≫
Slc25a13 ↻ ≫
Crtc2 ↻ ≫
Slc39a1 ↻ ≫
Acsl1 ↻ ≫
Tle1 ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Pak1ip1 ↻ ≫
Tmem14c ↻ ≫
C1qtnf1 ↻ ≫
Hhex ↻ ≫
Tpm2 ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Ak1 ↻ ≫
Eng ↻ ≫
Hsp90ab1 ↻ ≫
Slc35b2 ↻ ≫
Selenoi ↻ ≫
Leo1 ↻ ≫
Taar1 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Cpox ↻ ≫
Lrp5 ↻ ≫
Afp ↻ ≫
Haus5 ↻ ≫
Rbm42 ↻ ≫
Tmem132d ↻ ≫
Pth ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Ttc39b ↻ ≫
Stard10 ↻ ≫
Fam229a ↻ ≫
Kank2 ↻ ≫
Adh4 ↻ ≫
Xylb ↻ ≫
Abca8a ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Cyrib ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Col5a1 ↻ ≫
Tchhl1 ↻ ≫
Fam25c ↻ ≫
Insig2 ↻ ≫
Gmeb1 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Bloc1s2 ↻ ≫
C1rl ↻ ≫
Ssbp1 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Aqp8 ↻ ≫
B4galt5 ↻ ≫
Tsr3 ↻ ≫
Gnptg ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Sec22c ↻ ≫
Polr2e ↻ ≫
Tmtc3 ↻ ≫
Cep290 ↻ ≫
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