ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX467365 | IDG-SW3
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◣ SRX467365: IDG-SW3

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◢ SRX467367: IDG-SW3

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◢ SRX6658448: Liver

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◢ SRX6658450: Liver

◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Tcstv3 ↻ ≫
Cldn34d ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Inmt ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Asmt ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Zfp386 ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Bicral ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Calm3 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Gpr39 ↻ ≫
Zfp383 ↻ ≫
Zfp27 ↻ ≫
Itgb2 ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Cldnd2 ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Klf9 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Gins2 ↻ ≫
Spred2 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Atp11a ↻ ≫
Frs2 ↻ ≫
Loxhd1 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Hilpda ↻ ≫
Tnk2 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Slc25a51 ↻ ≫
Mast2 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Sfrp4 ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Herc3 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Ptpn22 ↻ ≫
Nupr1 ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Pitpnc1 ↻ ≫
Pate1 ↻ ≫
Dnaja2 ↻ ≫
Ltbp3 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Otulinl ↻ ≫
Adamts5 ↻ ≫
Snai3 ↻ ≫
Hivep2 ↻ ≫
Nr2c1 ↻ ≫
Angpt4 ↻ ≫
Birc6 ↻ ≫
Ciao2b ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Cnnm4 ↻ ≫
Dmp1 ↻ ≫
Arvcf ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Mief1 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Brwd1 ↻ ≫
Cyp46a1 ↻ ≫
Csrp1 ↻ ≫
9230019H11Rik ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Gm5431 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Fga ↻ ≫
Gm17455 ↻ ≫
Rcc2 ↻ ≫
Cdh12 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Hoxa6 ↻ ≫
Hoxa5 ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Cep170 ↻ ≫
Sdccag8 ↻ ≫
Tmem53 ↻ ≫
Armh1 ↻ ≫
Snai1 ↻ ≫
Crb2 ↻ ≫
Srxn1 ↻ ≫
Tnni1 ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Ndufb7 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Macrod1 ↻ ≫
Nfib ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
Il1rl1 ↻ ≫
Spg20 ↻ ≫
Cpne2 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Hoxa1 ↻ ≫
Hoxa2 ↻ ≫
Eprs ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Npas2 ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Maats1 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Vmn1r43 ↻ ≫
Ankar ↻ ≫
Atxn2 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Vasn ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Bricd5 ↻ ≫
Dot1l ↻ ≫
Plekhh2 ↻ ≫
Mrps28 ↻ ≫
B4galt5 ↻ ≫
St6galnac6 ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Dctn1 ↻ ≫
Slc25a22 ↻ ≫
Pidd1 ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Ubxn1 ↻ ≫
Arsg ↻ ≫
Hsf4 ↻ ≫
Fbxl8 ↻ ≫
Tradd ↻ ≫
Sh2d6 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Cnot2 ↻ ≫
Meig1 ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Coq3 ↻ ≫
Cycs ↻ ≫
Top2a ↻ ≫
Fmn1 ↻ ≫
Prlr ↻ ≫
Agpat1 ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Vmn2r102 ↻ ≫
Cpn2 ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Pnrc1 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Trhr2 ↻ ≫
Lepr ↻ ≫
Plin2 ↻ ≫
C5ar1 ↻ ≫
Crybg1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Dusp19 ↻ ≫
Tyk2 ↻ ≫
Ttc41 ↻ ≫
Pnldc1 ↻ ≫
Rhbdl2 ↻ ≫
Podnl1 ↻ ≫
Comt ↻ ≫
Pdcl3 ↻ ≫
Ftl1 ↻ ≫
Pde4b ↻ ≫
Csf2rb ↻ ≫
C87436 ↻ ≫
Aig1 ↻ ≫
Sptbn1 ↻ ≫
Adnp ↻ ≫
Smtn ↻ ≫
Map3k7cl ↻ ≫
Pex2 ↻ ≫
Coq10b ↻ ≫
Ndufs4 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Eps8 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Trip12 ↻ ≫
Fbxo36 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Smco4 ↻ ≫
Nrbf2 ↻ ≫
Stam ↻ ≫
Ptpn3 ↻ ≫
Crybb1 ↻ ≫
Fam180a ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Iffo2 ↻ ≫
Mfn2 ↻ ≫
Adamtsl4 ↻ ≫
Ccdc130 ↻ ≫
Trim2 ↻ ≫
Kremen1 ↻ ≫
Fancg ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Dock8 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Coro7 ↻ ≫
Dnaja3 ↻ ≫
Gsg1 ↻ ≫
Ifit3 ↻ ≫
Rffl ↻ ≫
Dnajc19 ↻ ≫
Rhob ↻ ≫
Dut ↻ ≫
Gm4861 ↻ ≫
Itgbl1 ↻ ≫
Fam13b ↻ ≫
Rtkn2 ↻ ≫
Galntl5 ↻ ≫
Spty2d1 ↻ ≫
Nlgn2 ↻ ≫
Tmem256 ↻ ≫
Cldn12 ↻ ≫
Kcnk2 ↻ ≫
Adh4 ↻ ≫
Sirt6 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Prickle2 ↻ ≫
Shb ↻ ≫
Etfdh ↻ ≫
4930579G24Rik ↻ ≫
Fam83f ↻ ≫
Hnrnpa0 ↻ ≫
Plppr3 ↻ ≫
Ehbp1 ↻ ≫
Prtn3 ↻ ≫
Cenpu ↻ ≫
Creld1 ↻ ≫
Apol9a ↻ ≫
Slc35d1 ↻ ≫
Plcd3 ↻ ≫
Acbd4 ↻ ≫
Ogn ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Ltbp1 ↻ ≫
Tm4sf1 ↻ ≫
Lrriq4 ↻ ≫
2610524H06Rik ↻ ≫
Agk ↻ ≫
Rexo4 ↻ ≫
Ilvbl ↻ ≫
Spata22 ↻ ≫
Aspa ↻ ≫
Tgtp1 ↻ ≫
Ankrd11 ↻ ≫
Git1 ↻ ≫
Ankrd13b ↻ ≫
Kcne4 ↻ ≫
Tmem218 ↻ ≫
Baz1b ↻ ≫
Nudt16 ↻ ≫
Ssh1 ↻ ≫
Mpp4 ↻ ≫
Lrrc10b ↻ ≫
Tpt1 ↻ ≫
Ppat ↻ ≫
Paics ↻ ≫
Mtmr4 ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Ulk2 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Dysf ↻ ≫
Bcl2l15 ↻ ≫
Nme1 ↻ ≫
Pdss1 ↻ ≫
Spag1 ↻ ≫
Rpf1 ↻ ≫
Arfgef2 ↻ ≫
Washc2 ↻ ≫
Gbp3 ↻ ≫
Slc22a5 ↻ ≫
Nsfl1c ↻ ≫
Dph5 ↻ ≫
Myh9 ↻ ≫
Plscr2 ↻ ≫
Cavin4 ↻ ≫
Eif4g3 ↻ ≫
S1pr4 ↻ ≫
Ncln ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Cox5b ↻ ≫
Unc50 ↻ ≫
Coa5 ↻ ≫
Mrpl34 ↻ ≫
Abhd8 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Traf3ip2 ↻ ≫
Gar1 ↻ ≫
Denr ↻ ≫
Atp5g3 ↻ ≫
Dhrs7 ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Klhdc8b ↻ ≫
Ccdc71 ↻ ≫
Sulf1 ↻ ≫
Rrm1 ↻ ≫
Tmem262 ↻ ≫
Vps51 ↻ ≫
Eapp ↻ ≫
Zfp335 ↻ ≫
Ugdh ↻ ≫
Echs1 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Heatr4 ↻ ≫
Acot2 ↻ ≫
Bbx ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Dusp27 ↻ ≫
Col6a5 ↻ ≫
Abcd2 ↻ ≫
Zfp566 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Gpatch8 ↻ ≫
Pgpep1 ↻ ≫
Med26 ↻ ≫
Abl1 ↻ ≫
Ston1 ↻ ≫
Pdlim7 ↻ ≫
Dennd4b ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Tcf3 ↻ ≫
Cyp1b1 ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Gm13285 ↻ ≫
Gm13290 ↻ ≫
Gm13289 ↻ ≫
Gm13287 ↻ ≫
Gm13288 ↻ ≫
Gm13275 ↻ ≫
Rps26 ↻ ≫
Qrsl1 ↻ ≫
Ank1 ↻ ≫
Rabl2 ↻ ≫
Gnb2 ↻ ≫
Mideas ↻ ≫
Borcs6 ↻ ≫
Dlgap2 ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Rab7b ↻ ≫
Napepld ↻ ≫
Ifi204 ↻ ≫
Hectd2 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Pcnx4 ↻ ≫
Them4 ↻ ≫
Ankrd13c ↻ ≫
4930558C23Rik ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Gga1 ↻ ≫
Traf3ip1 ↻ ≫
Ndc1 ↻ ≫
Parp8 ↻ ≫
Irf2bp2 ↻ ≫
Isy1 ↻ ≫
Zfp810 ↻ ≫
Sfi1 ↻ ≫
Eif4enif1 ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Brwd3 ↻ ≫
Pyurf ↻ ≫
Gucd1 ↻ ≫
Snrpd3 ↻ ≫
Msl2 ↻ ≫
Dpysl3 ↻ ≫
Cdc25c ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Rubcn ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Pknox2 ↻ ≫
Fyttd1 ↻ ≫
Phldb1 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Phf5a ↻ ≫
Aco2 ↻ ≫
Clca3a1 ↻ ≫
Ugt1a7c ↻ ≫
Wwc2 ↻ ≫
Adamts14 ↻ ≫
1110051M20Rik ↻ ≫
Polq ↻ ≫
Tmem95 ↻ ≫
Kctd11 ↻ ≫
Ccni ↻ ≫
2010109A12Rik ↻ ≫
Eif4e ↻ ≫
Apol9b ↻ ≫
Cxcl5 ↻ ≫
Creb5 ↻ ≫
Myo1h ↻ ≫
Ppbp ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Garre1 ↻ ≫
Metrnl ↻ ≫
Ifi211 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Cebpa ↻ ≫
Alkbh3 ↻ ≫
Col5a3 ↻ ≫
Cox14 ↻ ≫
Prr7 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Rrp12 ↻ ≫
Lgals3 ↻ ≫
Tle5 ↻ ≫
Hnrnpul1 ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
E030018B13Rik ↻ ≫
Hadh ↻ ≫
Dusp28 ↻ ≫
Ankmy1 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Prss22 ↻ ≫
S100a3 ↻ ≫
Slc39a3 ↻ ≫
Ccr9 ↻ ≫
Gm9222 ↻ ≫
Fam89b ↻ ≫
Ehbp1l1 ↻ ≫
S100a2 ↻ ≫
Schip1 ↻ ≫
Gng8 ↻ ≫
Mid1 ↻ ≫
Plekhg4 ↻ ≫
Pla2g15 ↻ ≫
Slc39a13 ↻ ≫
Serpinf1 ↻ ≫
Slit3 ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Mrps33 ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Kxd1 ↻ ≫
Atad2 ↻ ≫
Hoxa10 ↻ ≫
Sgo2a ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Nrep ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Ubxn8 ↻ ≫
Kdm5a ↻ ≫
Mvd ↻ ≫
Gjb4 ↻ ≫
Gjb5 ↻ ≫
Kank2 ↻ ≫
Usp6nl ↻ ≫
Anxa2 ↻ ≫
Pawr ↻ ≫
Clcf1 ↻ ≫
Dnaic2 ↻ ≫
Gstp2 ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Myo5c ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Gm13283 ↻ ≫
4931428F04Rik ↻ ≫
Olfr12 ↻ ≫
Tnn ↻ ≫
Prr11 ↻ ≫
Ska2 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Pex16 ↻ ≫
Large2 ↻ ≫
Agpat3 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Rhoc ↻ ≫
Oxa1l ↻ ≫
Hagh ↻ ≫
Fahd1 ↻ ≫
Wdr7 ↻ ≫
Dusp6 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Ndufs8 ↻ ≫
Mdp1 ↻ ≫
Trmt61a ↻ ≫
Pamr1 ↻ ≫
Rcan1 ↻ ≫
Fgd2 ↻ ≫
Nid1 ↻ ≫
B9d1 ↻ ≫
Sf3a3 ↻ ≫
Vwa1 ↻ ≫
Rab21 ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Gsk3a ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Slc33a1 ↻ ≫
Txnrd2 ↻ ≫
Otud5 ↻ ≫
Hspa5 ↻ ≫
Lox ↻ ≫
Irak3 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Apobec1 ↻ ≫
Gm5111 ↻ ≫
Josd1 ↻ ≫
Gtpbp1 ↻ ≫
Rgl2 ↻ ≫
Nup107 ↻ ≫
Macc1 ↻ ≫
Fggy ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Tmem268 ↻ ≫
Abhd11 ↻ ≫
Ggct ↻ ≫
Nufip2 ↻ ≫
Erlin2 ↻ ≫
Htra4 ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Rusc1 ↻ ≫
Adamtsl1 ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Ifi47 ↻ ≫
Arid5b ↻ ≫
Prrx2 ↻ ≫
Lif ↻ ≫
Olfr9 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Oacyl ↻ ≫
Mt2 ↻ ≫
Tmem205 ↻ ≫
Ccdc159 ↻ ≫
Txn2 ↻ ≫
Nr1d1 ↻ ≫
Zfp827 ↻ ≫
Sema4a ↻ ≫
Poc1a ↻ ≫
Spata13 ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Loxl1 ↻ ≫
Fcrlb ↻ ≫
Clip1 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Tpm4 ↻ ≫
Mvk ↻ ≫
Mmab ↻ ≫
Kmt5c ↻ ≫
Gpd2 ↻ ≫
Ctsl ↻ ≫
Fbxo8 ↻ ≫
Cep44 ↻ ≫
Prkcsh ↻ ≫
Ccdc151 ↻ ≫
Aldob ↻ ≫
Cwh43 ↻ ≫
Gprc5d ↻ ≫
Dicer1 ↻ ≫
Oxnad1 ↻ ≫
Dph3 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Slc38a7 ↻ ≫
Etnk1 ↻ ≫
Zfp672 ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Ppargc1a ↻ ≫
Tyw5 ↻ ≫
Maip1 ↻ ≫
Dennd6b ↻ ≫
Atp5g2 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Abhd1 ↻ ≫
Nfkbiz ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Cgref1 ↻ ≫
Zbtb21 ↻ ≫
Nyx ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Sned1 ↻ ≫
Zgpat ↻ ≫
Arfrp1 ↻ ≫
Cflar ↻ ≫
Jund ↻ ≫
Iqcn ↻ ≫
Ccnd1 ↻ ≫
Spsb1 ↻ ≫
1110002E22Rik ↻ ≫
Atrnl1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Arhgap12 ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Palld ↻ ≫
Pigt ↻ ≫
Bmp2k ↻ ≫
Idh3b ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Tekt2 ↻ ≫
Adprhl2 ↻ ≫
Krtcap2 ↻ ≫
Trim46 ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Qtrt2 ↻ ≫
Ccdc191 ↻ ≫
Orai1 ↻ ≫
Akt1s1 ↻ ≫
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