ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX003154 | 3T3-L1
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX003152: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX467367: IDG-SW3

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672821: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672854: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672855: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672856: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672888: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Adnp ↻ ≫
Pet117 ↻ ≫
Kat14 ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Syn2 ↻ ≫
Angptl4 ↻ ≫
Mgst1 ↻ ≫
Ell ↻ ≫
Tmem120a ↻ ≫
Derl1 ↻ ≫
Dpep1 ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Pigm ↻ ≫
Pcx ↻ ≫
Bscl2 ↻ ≫
Galnt9 ↻ ≫
Spatc1 ↻ ≫
Acsl1 ↻ ≫
Wdr93 ↻ ≫
Pex11a ↻ ≫
Tmem216 ↻ ≫
Rps19 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Tmcc3 ↻ ≫
Gm19774 ↻ ≫
Smim41 ↻ ≫
Clptm1 ↻ ≫
Apoc2 ↻ ≫
Synpo ↻ ≫
Malt1 ↻ ≫
Nemf ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Rasip1 ↻ ≫
Izumo1 ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Hmox1 ↻ ≫
Ccdc170 ↻ ≫
Spaar ↻ ≫
Hrct1 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Prxl2a ↻ ≫
Mgll ↻ ≫
Cycs ↻ ≫
Gsn ↻ ≫
Hoxa4 ↻ ≫
Adig ↻ ≫
Taldo1 ↻ ≫
Tlcd3b ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Lonp2 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Cidec ↻ ≫
Pdzrn3 ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Cpa1 ↻ ≫
Plin4 ↻ ≫
Pex14 ↻ ≫
Cyp4f17 ↻ ≫
Cav2 ↻ ≫
Vstm4 ↻ ≫
Gtf2i ↻ ≫
Eps15 ↻ ≫
Piezo1 ↻ ≫
Sly ↻ ≫
Gm20931 ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Hadh ↻ ≫
H1f8 ↻ ≫
Tkt ↻ ≫
Adcy7 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Rassf6 ↻ ≫
Retn ↻ ≫
Psma6 ↻ ≫
Trak1 ↻ ≫
Gins2 ↻ ≫
Slc35e3 ↻ ≫
Orm1 ↻ ≫
Pdgfra ↻ ≫
Lmbr1 ↻ ≫
Klf10 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Fitm2 ↻ ≫
Bmp2k ↻ ≫
Stx18 ↻ ≫
Tank ↻ ≫
Plin1 ↻ ≫
Adra1d ↻ ≫
Hoxc8 ↻ ≫
Ndufc2 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Tns2 ↻ ≫
Agpat1 ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Mrpl16 ↻ ≫
Nr1h3 ↻ ≫
Grm7 ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Tex45 ↻ ≫
Pex11g ↻ ≫
Gpsm3 ↻ ≫
Pbx2 ↻ ≫
Ramp2 ↻ ≫
Hoxa1 ↻ ≫
Hoxa2 ↻ ≫
Lrrc59 ↻ ≫
Jagn1 ↻ ≫
Agpat2 ↻ ≫
Megf9 ↻ ≫
Dcst2 ↻ ≫
Dcst1 ↻ ≫
Cmip ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Apmap ↻ ≫
Txnip ↻ ≫
Stpg3 ↻ ≫
Nelfb ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Creld1 ↻ ≫
Cpt2 ↻ ≫
Mtarc1 ↻ ≫
Tmem134 ↻ ≫
Aip ↻ ≫
Ywhab ↻ ≫
Rrbp1 ↻ ≫
Rgcc ↻ ≫
Fis1 ↻ ≫
Cldn15 ↻ ≫
Caprin1 ↻ ≫
Slc25a42 ↻ ≫
Tcaf1 ↻ ≫
Nfatc4 ↻ ≫
Pde8b ↻ ≫
Fgf12 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Canx ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
Cluh ↻ ≫
Hcar1 ↻ ≫
Cpsf1 ↻ ≫
Fam3c ↻ ≫
Wfdc21 ↻ ≫
Mdm2 ↻ ≫
Tnfrsf12a ↻ ≫
Thoc6 ↻ ≫
Hcfc1r1 ↻ ≫
Prkdc ↻ ≫
Pik3c2g ↻ ≫
Ankrd13a ↻ ≫
Git2 ↻ ≫
Idh3a ↻ ≫
Exd1 ↻ ≫
Chp1 ↻ ≫
Ptgr2 ↻ ≫
Car4 ↻ ≫
Mpdu1 ↻ ≫
Trabd2b ↻ ≫
Ltc4s ↻ ≫
Nat8l ↻ ≫
Coq3 ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
Oas1f ↻ ≫
Col5a1 ↻ ≫
Med23 ↻ ≫
Cdc25c ↻ ≫
Ech1 ↻ ≫
Pgm1 ↻ ≫
Etfa ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Ndufs1 ↻ ≫
Eef1b2 ↻ ≫
Stat5a ↻ ≫
Pkmyt1 ↻ ≫
Rrp1b ↻ ≫
Hsf2bp ↻ ≫
Txnl4b ↻ ≫
Dhx38 ↻ ≫
Chchd2 ↻ ≫
Scarb1 ↻ ≫
Pnrc1 ↻ ≫
Ndufa5 ↻ ≫
Asb15 ↻ ≫
Atp6v0e2 ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Pdia4 ↻ ≫
Baz1b ↻ ≫
Sorbs1 ↻ ≫
Trim29 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Agk ↻ ≫
Pus10 ↻ ≫
C5ar2 ↻ ≫
Tyw5 ↻ ≫
Maip1 ↻ ≫
Stx16 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
Asrgl1 ↻ ≫
Myc ↻ ≫
Tti2 ↻ ≫
Pparg ↻ ≫
Mlycd ↻ ≫
Opa1 ↻ ≫
Pex19 ↻ ≫
Acsf3 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Mrpl44 ↻ ≫
Rhbdf1 ↻ ≫
Crebzf ↻ ≫
Olfr1158 ↻ ≫
Map9 ↻ ≫
Nrip2 ↻ ≫
Trp53i13 ↻ ≫
Abhd15 ↻ ≫
6430571L13Rik ↻ ≫
Pp2d1 ↻ ≫
Trpv1 ↻ ≫
Cyp2t4 ↻ ≫
Naaa ↻ ≫
Mapk9 ↻ ≫
Tob2 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Qtrt2 ↻ ≫
Ccdc191 ↻ ≫
Lgals6 ↻ ≫
Lgals4 ↻ ≫
Nup188 ↻ ≫
Dolk ↻ ≫
Npm2 ↻ ≫
Qdpr ↻ ≫
Clrn2 ↻ ≫
Prpf38b ↻ ≫
Efna5 ↻ ≫
Ubiad1 ↻ ≫
Mtor ↻ ≫
Mrpl21 ↻ ≫
Ighmbp2 ↻ ≫
Acyp2 ↻ ≫
Nek7 ↻ ≫
Utp3 ↻ ≫
Zfyve21 ↻ ≫
Xrcc3 ↻ ≫
Ugt1a6b ↻ ≫
Mphosph10 ↻ ≫
Mcee ↻ ≫
Ugt1a7c ↻ ≫
Adipoq ↻ ≫
Gpr84 ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Mrpl30 ↻ ≫
Mitd1 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
D5Ertd579e ↻ ≫
Prdm11 ↻ ≫
Ucp2 ↻ ≫
Dus1l ↻ ≫
Foxj2 ↻ ≫
Ms4a1 ↻ ≫
Tmem114 ↻ ≫
Ube2i ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Calml3 ↻ ≫
Nr2c2 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Zfp768 ↻ ≫
Trp53rka ↻ ≫
Htra2 ↻ ≫
Dqx1 ↻ ≫
Otud5 ↻ ≫
Uckl1 ↻ ≫
Hnrnph1 ↻ ≫
Dusp19 ↻ ≫
Gramd1b ↻ ≫
Six6 ↻ ≫
G3bp2 ↻ ≫
Fdxr ↻ ≫
Dynlrb1 ↻ ≫
Hic2 ↻ ≫
4930578I06Rik ↻ ≫
Dbp ↻ ≫
Atg9b ↻ ≫
Abcb8 ↻ ≫
Frs2 ↻ ≫
S100a8 ↻ ≫
Nfe2 ↻ ≫
Ccng2 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Ubxn8 ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Slc5a6 ↻ ≫
Atraid ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Thrsp ↻ ≫
Slc35g3 ↻ ≫
Polr2a ↻ ≫
Dnajc19 ↻ ≫
Trim12a ↻ ≫
Olfr389 ↻ ≫
Olfr1219 ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Ube2h ↻ ≫
Klhl20 ↻ ≫
Zscan4b ↻ ≫
Ucp3 ↻ ≫
Kat7 ↻ ≫
Tmem88b ↻ ≫
Ankrd65 ↻ ≫
Trp63 ↻ ≫
Cxcr1 ↻ ≫
Lin52 ↻ ≫
Aldh6a1 ↻ ≫
Taar7a ↻ ≫
Ybx2 ↻ ≫
Serpine1 ↻ ≫
Ggnbp2 ↻ ≫
Etl4 ↻ ≫
Pex16 ↻ ≫
Taco1 ↻ ≫
Cnot1 ↻ ≫
Rbm34 ↻ ≫
Szt2 ↻ ≫
Med8 ↻ ≫
Psmg3 ↻ ≫
Smg8 ↻ ≫
Zbtb12 ↻ ≫
Chst12 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Zfp655 ↻ ≫
Pcnx4 ↻ ≫
Zfand5 ↻ ≫
Sncg ↻ ≫
Mmrn2 ↻ ≫
Ccdc57 ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Ilvbl ↻ ≫
Prpf40a ↻ ≫
Arl6ip6 ↻ ≫
Sema6d ↻ ≫
Lpp ↻ ≫
Col17a1 ↻ ≫
Pde6d ↻ ≫
Cops7b ↻ ≫
Sorbs2 ↻ ≫
Aox1 ↻ ≫
Ccdc174 ↻ ≫
Gulp1 ↻ ≫
Edil3 ↻ ≫
Ehd2 ↻ ≫
Ap1g1 ↻ ≫
Dgat1 ↻ ≫
Elmod2 ↻ ≫
Hal ↻ ≫
Cwc22 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Myocd ↻ ≫
Cyp2ab1 ↻ ≫
Calu ↻ ≫
Eci2 ↻ ≫
Sgo1 ↻ ≫
Gchfr ↻ ≫
Gm14137 ↻ ≫
Olfr117 ↻ ≫
Acadl ↻ ≫
Ten1 ↻ ≫
Acox1 ↻ ≫
Pan2 ↻ ≫
Mfsd8 ↻ ≫
Etfdh ↻ ≫
4930579G24Rik ↻ ≫
Zfp326 ↻ ≫
Mars1 ↻ ≫
2010003K11Rik ↻ ≫
Zfp386 ↻ ≫
Champ1 ↻ ≫
Niban2 ↻ ≫
Acy1 ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Hdac11 ↻ ≫
Socs2 ↻ ≫
Cblb ↻ ≫
Cfap97d2 ↻ ≫
Pdss1 ↻ ≫
Patl1 ↻ ≫
Kat6a ↻ ≫
Dolpp1 ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Nudt12 ↻ ≫
Pex3 ↻ ≫
Adat2 ↻ ≫
Zfp119a ↻ ≫
Esr1 ↻ ≫
Gcgr ↻ ≫
Gtf3c3 ↻ ≫
Scd1 ↻ ≫
Gpi1 ↻ ≫
Ccdc85c ↻ ≫
Creb1 ↻ ≫
B4galt7 ↻ ≫
5031439G07Rik ↻ ≫
Olfr222 ↻ ≫
Mrap ↻ ≫
Adamts14 ↻ ≫
Arid3b ↻ ≫
Rmdn2 ↻ ≫
Cat ↻ ≫
Pfkl ↻ ≫
Ormdl3 ↻ ≫
Hp ↻ ≫
Rad54l2 ↻ ≫
Fscn1 ↻ ≫
Zfp85 ↻ ≫
Zdhhc17 ↻ ≫
Ier2 ↻ ≫
Fbxw8 ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Aifm2 ↻ ≫
Tti1 ↻ ≫
Rprd1b ↻ ≫
Nrg4 ↻ ≫
Ccdc88a ↻ ≫
Otud6a ↻ ≫
Wdr3 ↻ ≫
Rplp2 ↻ ≫
Tbc1d19 ↻ ≫
Cox4i2 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Plekhg6 ↻ ≫
Cox19 ↻ ≫
Tnc ↻ ≫
Prr15l ↻ ≫
Hspa5 ↻ ≫
Banp ↻ ≫
Proca1 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Fads3 ↻ ≫
Tatdn3 ↻ ≫
Nsl1 ↻ ≫
Srp19 ↻ ≫
Nid1 ↻ ≫
Eef1akmt4-ece2 ↻ ≫
Eef1akmt4 ↻ ≫
Alg3 ↻ ≫
Ppp2r1a ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Cpped1 ↻ ≫
Rgl2 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Sirpb1c ↻ ≫
Ct55 ↻ ≫
Mrpl39 ↻ ≫
Mbd6 ↻ ≫
Ddit3 ↻ ≫
Six5 ↻ ≫
Afap1 ↻ ≫
Slc20a1 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Hspe1 ↻ ≫
Hspd1 ↻ ≫
Cttnbp2nl ↻ ≫
Mrps18c ↻ ≫
Helq ↻ ≫
Olr1 ↻ ≫
Nlrc5 ↻ ≫
Parl ↻ ≫
Apoe ↻ ≫
Napepld ↻ ≫
Ak1 ↻ ≫
Apoc1 ↻ ≫
Sh3bp5 ↻ ≫
Rras ↻ ≫
Scaf1 ↻ ≫
Sec22b ↻ ≫
Kctd14 ↻ ≫
Rmnd5a ↻ ≫
Septin9 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Aven ↻ ≫
Sfxn1 ↻ ≫
Ndufa2 ↻ ≫
Ik ↻ ≫
Dab2ip ↻ ≫
Cyth3 ↻ ≫
Slc25a25 ↻ ≫
Micalcl ↻ ≫
Pate1 ↻ ≫
Arl14ep ↻ ≫
Cep120 ↻ ≫
Ncbp3 ↻ ≫
Trp53rkb ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Cavin2 ↻ ≫
Rnf122 ↻ ≫
Agps ↻ ≫
Cox20 ↻ ≫
Cdc42ep1 ↻ ≫
Mrps31 ↻ ≫
Camp ↻ ≫
Pten ↻ ≫
Cdc45 ↻ ≫
Brox ↻ ≫
Aida ↻ ≫
Pspn ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Cox5b ↻ ≫
Coro7 ↻ ≫
Dnaja3 ↻ ≫
Neu1 ↻ ≫
Klb ↻ ≫
Tmem203 ↻ ≫
Ndor1 ↻ ≫
Proser1 ↻ ≫
Nhlrc3 ↻ ≫
Steap2 ↻ ≫
Uspl1 ↻ ≫
Col18a1 ↻ ≫
Stat3 ↻ ≫
Cpeb3 ↻ ≫
Marchf5 ↻ ≫
Orm2 ↻ ≫
Trafd1 ↻ ≫
Cenpm ↻ ≫
Cltc ↻ ≫
Myl6b ↻ ≫
Pwwp3a ↻ ≫
Qsox2 ↻ ≫
Tma16 ↻ ≫
Haspin ↻ ≫
Slc10a6 ↻ ≫
4931406C07Rik ↻ ≫
Taf1d ↻ ≫
Nsun3 ↻ ≫
Frat1 ↻ ≫
Hivep3 ↻ ≫
Mrpl3 ↻ ≫
Frg2f1 ↻ ≫
Foxj3 ↻ ≫
Mtmr7 ↻ ≫
Smim5 ↻ ≫
Akap7 ↻ ≫
Akt2 ↻ ≫
Nhlrc4 ↻ ≫
Pigq ↻ ≫
Tent4b ↻ ≫
Sec24b ↻ ≫
Pth ↻ ≫
Olfr850 ↻ ≫
Gm21258 ↻ ≫
Gm20736 ↻ ≫
Klrb1b ↻ ≫
Cox5a ↻ ≫
Npas4 ↻ ≫
Ciao3 ↻ ≫
Metrn ↻ ≫
Antkmt ↻ ≫
Zfp11 ↻ ≫
Ifngr1 ↻ ≫
Trim11 ↻ ≫
Usp30 ↻ ≫
Trdmt1 ↻ ≫
Chic2 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
A530016L24Rik ↻ ≫
Gucy2g ↻ ≫
Grpel1 ↻ ≫
Rnf6 ↻ ≫
Usp6nl ↻ ≫
Gtf2h1 ↻ ≫
Hps5 ↻ ≫
Zc3hc1 ↻ ≫
Pex10 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Pxmp4 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
Myocos ↻ ≫
Atxn2 ↻ ≫
Chd3 ↻ ≫
Cuedc1 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Arid1a ↻ ≫
Dmap1 ↻ ≫
Ier5 ↻ ≫
BC048671 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Mroh2a ↻ ≫
Gm4925 ↻ ≫
Arl1 ↻ ≫
Aldh9a1 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Rex1bd ↻ ≫
Tefm ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
Satb2 ↻ ≫
Taf12 ↻ ≫
Btbd8 ↻ ≫
Arfgef2 ↻ ≫
Ralgds ↻ ≫
Prrg2 ↻ ≫
Nosip ↻ ≫
Zfat ↻ ≫
Isy1 ↻ ≫
Tmem116 ↻ ≫
Erp29 ↻ ≫
Stimate ↻ ≫
Clec2d ↻ ≫
Dtnbp1 ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
M6pr ↻ ≫
4930402H24Rik ↻ ≫
Rasa3 ↻ ≫
Calr3 ↻ ≫
1700030K09Rik ↻ ≫
Zscan26 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Secisbp2l ↻ ≫
Krt14 ↻ ≫
Phf5a ↻ ≫
Aco2 ↻ ≫
Tpr ↻ ≫
Odr4 ↻ ≫
Gabpb2 ↻ ≫
Zfp219 ↻ ≫
Ppil3 ↻ ≫
Nif3l1 ↻ ≫
Tmem253 ↻ ≫
Snai2 ↻ ≫
Tusc3 ↻ ≫
Hsd17b4 ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Gpr152 ↻ ≫
Nnmt ↻ ≫
Ciz1 ↻ ≫
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