ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX369126 | CUTLL1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◣ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

CUTLL1
 SRX369126
RUNX1
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236112
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514278
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514291
RUNX1
Kasumi-1
 SRX4890469
LDB1
Kasumi-1
 SRX747572
RUNX1T1
TF-1
 SRX1261524
SMC3
Kasumi-1
 SRX858324
RUNX1
Kasumi-1
 SRX4890468
LDB1
Kasumi-1
 SRX5409710
NETO2
SKNO-1
 SRX026638
ERG
PER-117
 SRX8472392
RUNX2
CD34+
 SRX062339
RUNX1
Kasumi-1
 SRX1514281
LYL1
Kasumi-1
 SRX3098195
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX747571
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586365
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259622
RUNX1
Kasumi-1
 SRX763970
JMJD1C
Kasumi-1
 SRX259612
RUNX1
NB-4
 SRX1803059
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586366
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098194
RUNX1T1
Pre-leukemia stem cells
 SRX1735651
FOXO1
Hematopoietic cells
 SRX026660
ERG
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586367
RUNX1
Kasumi-1
 SRX1514276
FLI1
NB-4
 SRX1304579
JMJD1C
Acute myeloid leukemia
 SRX1036364
RUNX1
ME-1
 SRX265233
EP300
CTV-1
 SRX5574486
FLI1
Kasumi-1
 SRX236115
TCF3
SEM
 SRX4484980
FLI1
CTV-1
 SRX5574467
FLI1
TSU-1621MT
 SRX682384
RUNX1
Kasumi-1
 SRX4472654
EP300
KARPAS-45
 SRX8472389
RUNX2
SKH1
 SRX2574235
GATA2
Jurkat
 SRX1492212
RUNX1
Jurkat
 SRX1041800
RUNX1
TSU-1621MT
 SRX682376
ERG
CTV-1
 SRX5574487
FLI1
CTV-1
 SRX5574485
ETS1
Kasumi-1
 SRX1514277
ERG
HL-60
 SRX1304576
JMJD1C
CTV-1
 SRX5574466
ETS1
CTV-1
 SRX5574465
ETS1
HL-60
 SRX3434293
SKI
CTV-1
 SRX5574484
ETS1
CTV-1
 SRX5574468
FLI1
SEM
 SRX202967
RUNX1
697
 SRX6909701
RUNX1
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
T-ALL
 SRX725589
TAL1
CTV-1
 SRX5574501
SMARCA4
RPMI 8402
 SRX158110
TCF12
CTV-1
 SRX5574506
SPI1
MOLT-4
 SRX1637469
CDK9
MOLT-4
 SRX1637467
CDK9
T-ALL
 SRX725586
MYB
SKNO-1
 SRX026640
FLI1
SKNO-1
 SRX026639
ERG
CTV-1
 SRX5574488
SMARCA4
ICN12
 SRX656350
EP300
ICN12
 SRX656347
TCF3
Jurkat
 SRX725578
MYB
Jurkat
 SRX658610
MYB
MOLT-4
 SRX1637470
CDK9
SEM
 SRX4484982
RUNX2
697
 SRX6909699
EP300
RCH-ACV
 SRX2043231
EP300
RPMI 8402
 SRX158111
TAL1
Th1 Cells
 SRX735289
TBX21
Jurkat
 SRX725582
MYB
Jurkat
 SRX1492213
GATA3
Jurkat
 SRX1041802
GATA3
MOLT-4
 SRX1637465
BRD4
CTV-1
 SRX5574493
SPI1
Jurkat
 SRX658611
MYB
RCH-ACV
 SRX2043232
PBX1
CTV-1
 SRX5574507
SPI1
ICN12
 SRX656349
PBX1
RCH-ACV
 SRX2043230
TCF3
Th1 Cells
 SRX1799593
TBX21
Th1 Cells
 SRX1799591
TBX21
CTV-1
 SRX5574502
SMARCA4
Pre-B cells
 SRX3460917
IKZF1
GM12878
 SRX190349
RUNX3
Jurkat
 SRX2711484
USP7
RPMI 8402
 SRX158106
TCF3
Jurkat
 SRX326890
ERG
Jurkat
 SRX2711485
USP7
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015827
CREBBP
HPB-ALL
 SRX159138
NOTCH1
CTV-1
 SRX5574489
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574494
SPI1
MOLT-4
 SRX1637463
BRD4
Th1 Cells
 SRX092314
GATA3
OCI-LY1
 SRX689472
BCOR
Jurkat
 SRX1880278
BRD4
MM.1S
 SRX204906
MED1
MM.1S
 SRX327755
MED1
CUTLL1
 SRX369136
BRD4
CUTLL1
 SRX373733
ETS1
KOPT-K1
 SRX448939
BRD4
CUTLL1
 SRX369138
EP300
GM12878
 SRX150510
MXI1
OCI-LY1
 SRX689470
BCL6
Jurkat
 SRX4705120
GATA3
GM12878
 SRX100434
TCF12
MM.1S
 SRX327756
MED1
MM.1S
 SRX2140207
HDAC1
MM.1S
 SRX219372
BRD4
ME-1
 SRX5567180
RUNX1
ME-1
 SRX4393712
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259621
RUNX1
Kasumi-1
 SRX112545
RUNX1
CD34+
 SRX248931
FLI1
Kasumi-1
 SRX698186
LMO2
HL-60
 SRX3434294
RUNX1
ME-1
 SRX5567178
RNF2
ME-1
 SRX265234
HDAC1
SEM
 SRX2043226
TCF3
SEM
 SRX4484990
MYB
CD34+
 SRX029435
RUNX1
RPMI 8402
 SRX158113
TAL1
CUTLL1
 SRX3433645
USP7
Pre-B cells
 SRX3460918
MTA2
ALL-SIL
 SRX731025
TLX1
CD4+ T cells
 SRX7894794
ETS1
CUTLL1
 SRX070882
NOTCH1
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX128783
RUNX1
CUTLL1
 SRX369137
MED1
CUTLL1
 SRX369131
NOTCH1
Jurkat
 SRX326888
GABPA
Jurkat
 SRX326887
GABPA
CD4+ T cells
 SRX212441
ETS1
Treg
 SRX212439
ETS1
CUTLL1
 SRX369128
NOTCH1
CAR-T cells
 SRX6800707
IRF4
KOPT-K1
 SRX448946
BRD4
CD4+ T cells
 SRX198033
BRD4
MOLT-4
 SRX2314265
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314263
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314264
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314262
SUPT5H
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015825
ETS1
CUTLL1
 SRX369132
RBPJ
Th2 Cells
 SRX092315
GATA3
CUTLL1
 SRX070881
NOTCH1
ME-1
 SRX3030206
RUNX1
Kasumi-1
 SRX858325
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX026635
TCF12
Kasumi-1
 SRX747573
NCOR1
U-937
 SRX952434
RUNX1
SKH1
 SRX2574236
GATA2
Kasumi-1
 SRX698187
LMO3
Kasumi-1
 SRX236114
TCF12
Kasumi-1
 SRX3098193
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX112544
RUNX1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930116
EP300
Kasumi-1
 SRX1514284
EP300
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX1477666
MED12
EOL-1
 SRX3927290
DPF2
U-937
 SRX097097
SMAD1
TSU-1621MT
 SRX682385
LMO2
THP-1
 SRX3824044
KMT2B
UPR9
 SRX014782
RARA
Kasumi-1
 SRX1304574
LYL1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX097073
SMAD1
Kasumi-1
 SRX1514286
HDAC2
TSU-1621MT
 SRX682388
TAL1
MV-4-11
 SRX3031986
BRD4
Kasumi-1
 SRX259611
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098196
RUNX1T1
HL-60
 SRX3434291
SKI
ME-1
 SRX5567177
RNF2
SKH1
 SRX3098188
MECOM
MV-4-11
 SRX2375366
CDK9
TSU-1621MT
 SRX682382
FUS
Kasumi-1
 SRX1514285
HDAC1
THP-1
 SRX1304581
JMJD1C
Kasumi-1
 SRX698188
SPI1
Kasumi-1
 SRX1653204
NR4A1
SEM
 SRX1873451
MED1
NB-4
 SRX1304580
LYL1
Kasumi-1
 SRX062335
RUNX1
KG-1
 SRX3599222
ZBTB16
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
ME-1
 SRX4393709
GATA2
Acute myeloid leukemia
 SRX5930115
NCOR2
Kasumi-1
 SRX062336
RUNX1
ME-1
 SRX4393708
GATA2
SKH1
 SRX3098190
CEBPA
THP-1
 SRX3824043
KMT2B
MV-4-11
 SRX2375362
CDK9
MV-4-11
 SRX3031982
BRD4
ME-1
 SRX265222
RUNX1
Kasumi-1
 SRX062337
RUNX1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930117
EP300
MOLM-13
 SRX3927297
DPF2
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
HL-60
 SRX1304577
LYL1