ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX2014504 | Jurkat
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◣ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

Jurkat
 SRX2014504
RUNX1
SEM
 SRX2281252
KMT2A
PBMC
 SRX2963102
RUNX1
MM.1S
 SRX366792
BRD3
Jurkat
 SRX2513052
TET2
NAMALWA
 SRX389278
NRF1
Jurkat
 SRX2513053
TET2
GM12878
 SRX150389
NRF1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX026653
ERG
ME-1
 SRX265218
CBFB
PBMC
 SRX2963103
TET2
Jurkat
 SRX2014505
TET2
Th1 Cells
 SRX1460849
AFF4
K-562
 SRX063921
ERG
MV-4-11
 SRX1293531
KMT2A
SEM
 SRX2281249
KMT2A
K-562
 SRX063922
ERG
SEM
 SRX2281247
KMT2A
ME-1
 SRX265225
TCF12
Acute promyelocytic leukemia
 SRX026657
ERG
K-562
 SRX063920
ERG
K-562
 SRX063919
ERG
MM.1S
 SRX204905
BRD4
K-562
 SRX1091814
CTCFL
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236112
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514278
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514291
RUNX1
Kasumi-1
 SRX4890469
LDB1
Kasumi-1
 SRX747572
RUNX1T1
TF-1
 SRX1261524
SMC3
Kasumi-1
 SRX858324
RUNX1
Kasumi-1
 SRX4890468
LDB1
Kasumi-1
 SRX5409710
NETO2
SKNO-1
 SRX026638
ERG
PER-117
 SRX8472392
RUNX2
CD34+
 SRX062339
RUNX1
Kasumi-1
 SRX1514281
LYL1
Kasumi-1
 SRX3098195
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX747571
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586365
RUNX1
ME-1
 SRX3030206
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259622
RUNX1
Kasumi-1
 SRX763970
JMJD1C
Kasumi-1
 SRX259612
RUNX1
ME-1
 SRX5567180
RUNX1
ME-1
 SRX4393712
RUNX1
NB-4
 SRX1803059
RUNX1
Kasumi-1
 SRX259621
RUNX1
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586366
RUNX1
Kasumi-1
 SRX858325
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX3098194
RUNX1T1
Pre-leukemia stem cells
 SRX1735651
FOXO1
Hematopoietic cells
 SRX026660
ERG
Pre-B lymphoblast cells
 SRX3586367
RUNX1
Kasumi-1
 SRX112545
RUNX1
CD34+
 SRX248931
FLI1
Kasumi-1
 SRX1514276
FLI1
Kasumi-1
 SRX698186
LMO2
NB-4
 SRX1304579
JMJD1C
Acute myeloid leukemia
 SRX1036364
RUNX1
ME-1
 SRX265233
EP300
CTV-1
 SRX5574486
FLI1
Kasumi-1
 SRX236115
TCF3
SEM
 SRX4484980
FLI1
Kasumi-1
 SRX026635
TCF12
CTV-1
 SRX5574467
FLI1
TSU-1621MT
 SRX682384
RUNX1
Kasumi-1
 SRX747573
NCOR1
Kasumi-1
 SRX4472654
EP300
KARPAS-45
 SRX8472389
RUNX2
SKH1
 SRX2574235
GATA2
Jurkat
 SRX1492212
RUNX1
Jurkat
 SRX1041800
RUNX1
TSU-1621MT
 SRX682376
ERG
U-937
 SRX952434
RUNX1
CTV-1
 SRX5574487
FLI1
CTV-1
 SRX5574485
ETS1
HL-60
 SRX3434294
RUNX1
SKH1
 SRX2574236
GATA2
CUTLL1
 SRX369126
RUNX1
Kasumi-1
 SRX1514277
ERG
Kasumi-1
 SRX698187
LMO3
Kasumi-1
 SRX236114
TCF12
Kasumi-1
 SRX3098193
RUNX1T1
HL-60
 SRX1304576
JMJD1C
CTV-1
 SRX5574466
ETS1
CTV-1
 SRX5574465
ETS1
HL-60
 SRX3434293
SKI
Kasumi-1
 SRX112544
RUNX1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930116
EP300
ME-1
 SRX5567178
RNF2
CTV-1
 SRX5574484
ETS1
Kasumi-1
 SRX1514284
EP300
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX1477666
MED12
EOL-1
 SRX3927290
DPF2
CTV-1
 SRX5574468
FLI1
SEM
 SRX202967
RUNX1
U-937
 SRX097097
SMAD1
TSU-1621MT
 SRX682385
LMO2
THP-1
 SRX3824044
KMT2B
697
 SRX6909701
RUNX1
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
T-ALL
 SRX725589
TAL1
ME-1
 SRX265234
HDAC1
CTV-1
 SRX5574501
SMARCA4
UPR9
 SRX014782
RARA
Kasumi-1
 SRX1304574
LYL1
RPMI 8402
 SRX158110
TCF12
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX097073
SMAD1
Kasumi-1
 SRX1514286
HDAC2
TSU-1621MT
 SRX682388
TAL1
MV-4-11
 SRX3031986
BRD4
Kasumi-1
 SRX259611
RUNX1
CTV-1
 SRX5574506
SPI1
MOLT-4
 SRX1637469
CDK9
Kasumi-1
 SRX3098196
RUNX1T1
HL-60
 SRX3434291
SKI
ME-1
 SRX5567177
RNF2
SKH1
 SRX3098188
MECOM
MV-4-11
 SRX2375366
CDK9
TSU-1621MT
 SRX682382
FUS
MOLT-4
 SRX1637467
CDK9
T-ALL
 SRX725586
MYB
SKNO-1
 SRX026640
FLI1
SKNO-1
 SRX026639
ERG
CTV-1
 SRX5574488
SMARCA4
ICN12
 SRX656350
EP300
ICN12
 SRX656347
TCF3
Jurkat
 SRX725578
MYB
Jurkat
 SRX658610
MYB
Kasumi-1
 SRX1514285
HDAC1
MOLT-4
 SRX1637470
CDK9
SEM
 SRX4484982
RUNX2
THP-1
 SRX1304581
JMJD1C
Kasumi-1
 SRX698188
SPI1
697
 SRX6909699
EP300
RCH-ACV
 SRX2043231
EP300
Kasumi-1
 SRX1653204
NR4A1
SEM
 SRX1873451
MED1
RPMI 8402
 SRX158111
TAL1
NB-4
 SRX1304580
LYL1
Kasumi-1
 SRX062335
RUNX1
SEM
 SRX2043226
TCF3
KG-1
 SRX3599222
ZBTB16
Kasumi-1
 SRX747574
EP300
Th1 Cells
 SRX735289
TBX21
ME-1
 SRX4393709
GATA2
Jurkat
 SRX725582
MYB
Acute myeloid leukemia
 SRX5930115
NCOR2
Kasumi-1
 SRX062336
RUNX1
Jurkat
 SRX1492213
GATA3
Jurkat
 SRX1041802
GATA3
SEM
 SRX4484990
MYB
MOLT-4
 SRX1637465
BRD4
ME-1
 SRX4393708
GATA2
CTV-1
 SRX5574493
SPI1
Jurkat
 SRX658611
MYB
SKH1
 SRX3098190
CEBPA
THP-1
 SRX3824043
KMT2B
MV-4-11
 SRX2375362
CDK9
MV-4-11
 SRX3031982
BRD4
RCH-ACV
 SRX2043232
PBX1
ME-1
 SRX265222
RUNX1
CD34+
 SRX029435
RUNX1
Kasumi-1
 SRX062337
RUNX1
Acute myeloid leukemia
 SRX5930117
EP300
CTV-1
 SRX5574507
SPI1
ICN12
 SRX656349
PBX1
MOLM-13
 SRX3927297
DPF2
RCH-ACV
 SRX2043230
TCF3
Th1 Cells
 SRX1799593
TBX21
Th1 Cells
 SRX1799591
TBX21
CTV-1
 SRX5574502
SMARCA4
Pre-B cells
 SRX3460917
IKZF1
GM12878
 SRX190349
RUNX3
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
HL-60
 SRX1304577
LYL1
Jurkat
 SRX2711484
USP7
RPMI 8402
 SRX158106
TCF3
SKH1
 SRX3098185
MECOM
NB-4
 SRX080047
EP300
HL-60
 SRX3434290
SKI
Jurkat
 SRX326890
ERG
Jurkat
 SRX2711485
USP7
Pre-B ALL 
 SRX625674
IKZF1
MV-4-11
 SRX3031988
BRD4
MV-4-11
 SRX3031984
BRD4
SEM
 SRX4484988
ERG
TF-1
 SRX1261523
SMC3
Jurkat (Clone E6-1)
 SRX015827
CREBBP
Kasumi-1
 SRX1653203
NR4A1
HPB-ALL
 SRX159138
NOTCH1
NALM-6
 SRX4211810
PAX5
RPMI 8402
 SRX158113
TAL1
MOLM-13
 SRX3927294
SMARCA4
U-937
 SRX685530
DEK
ME-1
 SRX265230
ERG
CD34+
 SRX248935
RUNX1
CTV-1
 SRX5574489
SMARCA4
CTV-1
 SRX5574494
SPI1
MOLT-4
 SRX1637463
BRD4
OCI-AML3
 ERX195060
BRD4
OCI-AML3
 ERX195059
BRD4