ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CLOCK

Query protein: CLOCK
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX1393088 | U2OS
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
CLOCK's Target genes

◢ CLOCK: Average

◢ SRX359928: LoVo

◢ SRX1091022: NOMO-1

◢ SRX1091025: NOMO-1

◢ SRX1091030: NOMO-1

◢ SRX1091036: THP-1

◢ SRX1091039: THP-1

◢ SRX1393087: U2OS

◣ SRX1393088: U2OS

◢ SRX235054: U2OS

◢ CLOCK: STRING
NR1D2 ↻ ≫
NKIRAS1 ↻ ≫
TEF ↻ ≫
AGAP11 ↻ ≫
ADIRF ↻ ≫
PER3 ↻ ≫
PER2 ↻ ≫
PER1 ↻ ≫
NR1D1 ↻ ≫
CRY2 ↻ ≫
DBP ↻ ≫
SERPINE1 ↻ ≫
ANKRD12 ↻ ≫
RALGDS ↻ ≫
CPEB1 ↻ ≫
OSGIN1 ↻ ≫
AVPI1 ↻ ≫
PIK3IP1 ↻ ≫
BHLHE40 ↻ ≫
FRG2C ↻ ≫
FIBP ↻ ≫
CCDC85B ↻ ≫
RRAGC ↻ ≫
GET4 ↻ ≫
IER3 ↻ ≫
FLOT1 ↻ ≫
EIF5A2 ↻ ≫
MTRNR2L1 ↻ ≫
KLF11 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
HLF ↻ ≫
USP36 ↻ ≫
NR6A1 ↻ ≫
MTHFD1L ↻ ≫
SNAP29 ↻ ≫
PI4KA ↻ ≫
RAD9A ↻ ≫
CLN6 ↻ ≫
HIF1A ↻ ≫
CRY1 ↻ ≫
TSPAN4 ↻ ≫
POLR2L ↻ ≫
NOL8 ↻ ≫
CENPP ↻ ≫
LSM12 ↻ ≫
G6PC3 ↻ ≫
ACTN2 ↻ ≫
TMEM116 ↻ ≫
ERP29 ↻ ≫
RPS29 ↻ ≫
CCDC24 ↻ ≫
PPP1R3C ↻ ≫
TRAPPC6A ↻ ≫
BLOC1S3 ↻ ≫
CLUAP1 ↻ ≫
C16orf90 ↻ ≫
GTF3A ↻ ≫
KHDRBS1 ↻ ≫
SNN ↻ ≫
ELFN2 ↻ ≫
IGSF8 ↻ ≫
AGO1 ↻ ≫
NPTN ↻ ≫
ATXN2 ↻ ≫
MARCHF8 ↻ ≫
DUX4 ↻ ≫
PLD6 ↻ ≫
MARCHF9 ↻ ≫
CDK4 ↻ ≫
YPEL5 ↻ ≫
PIP4P1 ↻ ≫
GNPDA1 ↻ ≫
VPS26A ↻ ≫
PC ↻ ≫
LIN54 ↻ ≫
CREBRF ↻ ≫
TLE6 ↻ ≫
DDX5 ↻ ≫
CEP95 ↻ ≫
COL23A1 ↻ ≫
RNMT ↻ ≫
FAM210A ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
FRG2 ↻ ≫
FAM214B ↻ ≫
RAB3IL1 ↻ ≫
ELAVL3 ↻ ≫
SLC25A39 ↻ ≫
ZNRF2 ↻ ≫
CPLX3 ↻ ≫
KAT5 ↻ ≫
TMEM185B ↻ ≫
FAM117B ↻ ≫
BHLHE41 ↻ ≫
KLF10 ↻ ≫
GIGYF1 ↻ ≫
FAM76A ↻ ≫
LARP1 ↻ ≫
HSF2 ↻ ≫
STMN1 ↻ ≫
SCAF11 ↻ ≫
OTUD1 ↻ ≫
HSPB1 ↻ ≫
ERCC1 ↻ ≫
HOXC13 ↻ ≫
CAMKK1 ↻ ≫
TRAPPC2L ↻ ≫
GALNS ↻ ≫
G3BP1 ↻ ≫
COMMD8 ↻ ≫
MRPL40 ↻ ≫
HIRA ↻ ≫
PUM2 ↻ ≫
TSGA10 ↻ ≫
CLCN7 ↻ ≫
PPAT ↻ ≫
PAICS ↻ ≫
GMFB ↻ ≫
ESYT1 ↻ ≫
CIPC ↻ ≫
SLC30A1 ↻ ≫
EIF4G1 ↻ ≫
SLC35A5 ↻ ≫
ATG3 ↻ ≫
ZNF239 ↻ ≫
GBE1 ↻ ≫
CCDC107 ↻ ≫
FOXRED2 ↻ ≫
CHAMP1 ↻ ≫
CHKA ↻ ≫
GZF1 ↻ ≫
TRIP6 ↻ ≫
MTHFR ↻ ≫
CLCN6 ↻ ≫
GPR146 ↻ ≫
DGAT2 ↻ ≫
SLC20A1 ↻ ≫
LDB1 ↻ ≫
EPM2A ↻ ≫
LAMTOR4 ↻ ≫
CCDC200 ↻ ≫
SLC25A13 ↻ ≫
LRFN4 ↻ ≫
UNKL ↻ ≫
ANKRD53 ↻ ≫
FNIP1 ↻ ≫
ZNF696 ↻ ≫
FLCN ↻ ≫
BCAR1 ↻ ≫
AATF ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
MAMDC2 ↻ ≫
TTYH1 ↻ ≫
TKTL1 ↻ ≫
TEX28 ↻ ≫
MUC3A ↻ ≫
RPEL1 ↻ ≫
COL6A1 ↻ ≫
MAN2B2 ↻ ≫
GALR1 ↻ ≫
NTN5 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
COLEC11 ↻ ≫
PLEC ↻ ≫
PARP10 ↻ ≫
LFNG ↻ ≫
PCBP3 ↻ ≫
LRRC24 ↻ ≫
C8orf82 ↻ ≫
FSCN2 ↻ ≫
LY6L ↻ ≫
SPATC1L ↻ ≫
PIP4P2 ↻ ≫
ARHGAP39 ↻ ≫
CACNA1I ↻ ≫
SLC39A14 ↻ ≫
TFDP1 ↻ ≫
PROZ ↻ ≫
H4C14 ↻ ≫
EPN1 ↻ ≫
RORC ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
MSH3 ↻ ≫
DHFR ↻ ≫
FAF2 ↻ ≫
H4C11 ↻ ≫
LINGO1 ↻ ≫
SLC35F6 ↻ ≫
U2AF2 ↻ ≫
HERC3 ↻ ≫
BAIAP2L2 ↻ ≫
OPRL1 ↻ ≫
ISOC2 ↻ ≫
PDE4C ↻ ≫
CRYAA ↻ ≫
CRYAA2 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
SLC22A11 ↻ ≫
FAH ↻ ≫
MDGA2 ↻ ≫
H4C15 ↻ ≫
JPH3 ↻ ≫
GGA2 ↻ ≫
CORO7-PAM16 ↻ ≫
CORO7 ↻ ≫
ATP12A ↻ ≫
NR2F1 ↻ ≫
AGRN ↻ ≫
FCMR ↻ ≫
PKP3 ↻ ≫
COPS7A ↻ ≫
RASD2 ↻ ≫
PKD1L1 ↻ ≫
PINX1 ↻ ≫
CAMK2B ↻ ≫
LRP2 ↻ ≫
HNF4A ↻ ≫
KRTAP5-7 ↻ ≫
PWWP2B ↻ ≫
OGDH ↻ ≫
MXI1 ↻ ≫
THNSL1 ↻ ≫
TBC1D3L ↻ ≫
TBC1D3K ↻ ≫
TBC1D3J ↻ ≫
TBC1D3I ↻ ≫
TBC1D3H ↻ ≫
TBC1D3G ↻ ≫
TBC1D3F ↻ ≫
TBC1D3E ↻ ≫
TBC1D3D ↻ ≫
TBC1D3C ↻ ≫
TBC1D3 ↻ ≫
TRIM8 ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
RRP1 ↻ ≫
ADARB1 ↻ ≫
TBCEL-TECTA ↻ ≫
TBCEL ↻ ≫
HPS5 ↻ ≫
GTF2H1 ↻ ≫
SLC12A7 ↻ ≫
RAB37 ↻ ≫
WDR97 ↻ ≫
MAF1 ↻ ≫
LY6E ↻ ≫
C7orf57 ↻ ≫
LGR6 ↻ ≫
BOK ↻ ≫
GYG1 ↻ ≫
C14orf119 ↻ ≫
ADPRHL1 ↻ ≫
ACIN1 ↻ ≫
ZFP36 ↻ ≫
PDP2 ↻ ≫
FNDC10 ↻ ≫
SYCP1 ↻ ≫
PGAP6 ↻ ≫
ARL4A ↻ ≫
PTBP1 ↻ ≫
SPG21 ↻ ≫
H4C12 ↻ ≫
SEPTIN9 ↻ ≫
GGT5 ↻ ≫
SPAAR ↻ ≫
SPATC1 ↻ ≫
SLC45A1 ↻ ≫
MN1 ↻ ≫
AMZ1 ↻ ≫
PHF20 ↻ ≫
ILVBL ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
NDUFS6 ↻ ≫
MRPL36 ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
LKAAEAR1 ↻ ≫
POLI ↻ ≫
DIXDC1 ↻ ≫
HAGHL ↻ ≫
CCDC78 ↻ ≫
KLHL15 ↻ ≫
KDM6B ↻ ≫
SURF4 ↻ ≫
PALD1 ↻ ≫
GCNT2 ↻ ≫
TRIM48 ↻ ≫
ZBTB37 ↻ ≫
OSGEP ↻ ≫
APEX1 ↻ ≫
RGPD2 ↻ ≫
RGPD1 ↻ ≫
ZNF706 ↻ ≫
MTA2 ↻ ≫
KRTAP2-1 ↻ ≫
CDC16 ↻ ≫
SLC16A3 ↻ ≫
PMS2 ↻ ≫
AIMP2 ↻ ≫
CRYBB2 ↻ ≫
CCN4 ↻ ≫
ASPHD2 ↻ ≫
ZFP2 ↻ ≫
TRAF3IP3 ↻ ≫
KRTAP4-8 ↻ ≫
KRTAP4-11 ↻ ≫
ADGRB1 ↻ ≫
SYNGAP1 ↻ ≫
ILF3 ↻ ≫
HDAC4 ↻ ≫
CUTA ↻ ≫
SOX12 ↻ ≫
RPL3L ↻ ≫
YDJC ↻ ≫
CCDC116 ↻ ≫
ZNF331 ↻ ≫
SERF2 ↻ ≫
PCGF1 ↻ ≫
MC3R ↻ ≫
LBX2 ↻ ≫
KRTAP4-12 ↻ ≫
CSRNP1 ↻ ≫
SDK1 ↻ ≫
NAPA ↻ ≫
KRTAP4-4 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
MYEOV ↻ ≫
COX14 ↻ ≫
ZC3H4 ↻ ≫
PIK3R2 ↻ ≫
SMARCE1 ↻ ≫
C4orf19 ↻ ≫
TNFRSF6B ↻ ≫
ATP11A ↻ ≫
RASGRF1 ↻ ≫
L3HYPDH ↻ ≫
JKAMP ↻ ≫
CNDP2 ↻ ≫
LRCOL1 ↻ ≫
KISS1 ↻ ≫
TPSAB1 ↻ ≫
TMEM132D ↻ ≫
MAP2K7 ↻ ≫
EMILIN2 ↻ ≫
USP7 ↻ ≫
UBE4A ↻ ≫
SERPINB9 ↻ ≫
YTHDF1 ↻ ≫
TBX1 ↻ ≫
RP1L1 ↻ ≫
MAPK1 ↻ ≫
LOC100130520 ↻ ≫
CD300H ↻ ≫
WTAP ↻ ≫
SOD2 ↻ ≫
RAD50 ↻ ≫
KRTAP9-8 ↻ ≫
SCN5A ↻ ≫
PDE1B ↻ ≫
CAP1 ↻ ≫
UCKL1 ↻ ≫
TMEM74B ↻ ≫
SETD1A ↻ ≫
NPM1 ↻ ≫
POLN ↻ ≫
HAUS3 ↻ ≫
GLI2 ↻ ≫
ITGB2 ↻ ≫
MCF2L ↻ ≫
UBE2QL1 ↻ ≫
TMEM132B ↻ ≫
SLC22A7 ↻ ≫
PIGQ ↻ ≫
NHLRC4 ↻ ≫
CPNE7 ↻ ≫
RPS21 ↻ ≫
OTOF ↻ ≫
TAS1R2 ↻ ≫
SOWAHA ↻ ≫
SIRT1 ↻ ≫
NUCB1 ↻ ≫
EFCAB3 ↻ ≫
UBE2Q1 ↻ ≫
CEP72 ↻ ≫
LDHA ↻ ≫
KRTAP9-7 ↻ ≫
KRTAP9-4 ↻ ≫
ACY3 ↻ ≫
ERCC4 ↻ ≫
DEPTOR ↻ ≫
TXNIP ↻ ≫
ST3GAL1 ↻ ≫
N6AMT1 ↻ ≫
LOC100996750 ↻ ≫
KRTAP4-7 ↻ ≫
EIF4A3 ↻ ≫
CITED4 ↻ ≫
AIG1 ↻ ≫
ABCA7 ↻ ≫
KRTAP2-3 ↻ ≫
KRTAP2-2 ↻ ≫
CASQ1 ↻ ≫
SNX8 ↻ ≫
MAT2A ↻ ≫
LDHB ↻ ≫
FGFBP1 ↻ ≫
ADK ↻ ≫
SLC25A38 ↻ ≫
LEPROTL1 ↻ ≫
DOK7 ↻ ≫
DACT3 ↻ ≫
CGREF1 ↻ ≫
ACAD9 ↻ ≫
ABHD1 ↻ ≫
ARHGAP45 ↻ ≫
RTN4R ↻ ≫
KRTAP9-2 ↻ ≫
KRTAP2-4 ↻ ≫
CD7 ↻ ≫
ACSM2B ↻ ≫
RASGEF1C ↻ ≫
MEF2D ↻ ≫
HK2 ↻ ≫
FBXL22 ↻ ≫
TPO ↻ ≫
TMEM80 ↻ ≫
SQLE ↻ ≫
RIMBP2 ↻ ≫
PCDHA13 ↻ ≫
PCDHA12 ↻ ≫
KIAA1522 ↻ ≫
GOLIM4 ↻ ≫
DEAF1 ↻ ≫
CRTAM ↻ ≫
ACTRT2 ↻ ≫
SDHA ↻ ≫
NPEPL1 ↻ ≫
NLK ↻ ≫
CCDC127 ↻ ≫
ZFP91 ↻ ≫
RAMP3 ↻ ≫
LPXN ↻ ≫
KRTAP10-6 ↻ ≫
TMEM204 ↻ ≫
SPRING1 ↻ ≫
RNFT2 ↻ ≫
PPP6R2 ↻ ≫
PAPLN ↻ ≫
MARS2 ↻ ≫
TMEM238 ↻ ≫
RPL28 ↻ ≫
IDI1 ↻ ≫
FAM240C ↻ ≫
FOXI2 ↻ ≫
ARRDC4 ↻ ≫
USP32 ↻ ≫
TLCD5 ↻ ≫
ZNF74 ↻ ≫
FRMD1 ↻ ≫
ZNF16 ↻ ≫
SOX8 ↻ ≫
RELL1 ↻ ≫
PNMA6E ↻ ≫
NKAIN4 ↻ ≫
LMF1 ↻ ≫
ISYNA1 ↻ ≫
PANX2 ↻ ≫
KRTAP10-5 ↻ ≫
POTEH ↻ ≫
HAGH ↻ ≫
FAHD1 ↻ ≫
ALDH3B2 ↻ ≫
TMSB10 ↻ ≫
TMEM248 ↻ ≫
MGAT3 ↻ ≫
KRTAP9-6 ↻ ≫
GEMIN4 ↻ ≫
CTSH ↻ ≫
TDRD15 ↻ ≫
NUP188 ↻ ≫
INO80 ↻ ≫
HGC6.3 ↻ ≫
DOLK ↻ ≫
SLC5A9 ↻ ≫
GOLGA6L10 ↻ ≫
CAD ↻ ≫
ZCCHC7 ↻ ≫
SDC3 ↻ ≫
MBP ↻ ≫
AJUBA ↻ ≫
MB ↻ ≫
HOXA7 ↻ ≫
HOXA6 ↻ ≫
HOXA3 ↻ ≫
C3orf70 ↻ ≫
BCL2L14 ↻ ≫
LPA ↻ ≫
RTP5 ↻ ≫
PDE4A ↻ ≫
PCDHB3 ↻ ≫
PCDHB2 ↻ ≫
MC1R ↻ ≫
MARVELD1 ↻ ≫
KRTAP10-7 ↻ ≫
ERRFI1 ↻ ≫
CD5 ↻ ≫
ZNF536 ↻ ≫
TMEM119 ↻ ≫
FAM104A ↻ ≫
EDN2 ↻ ≫
ANKLE2 ↻ ≫
SEMA4D ↻ ≫
MPP2 ↻ ≫
KLHL31 ↻ ≫
BAIAP3 ↻ ≫
ADGRE1 ↻ ≫
GP1BB ↻ ≫
TMEM175 ↻ ≫
PCDHB11 ↻ ≫
MRAP ↻ ≫
GJB3 ↻ ≫
GAK ↻ ≫
CCR6 ↻ ≫
PKN1 ↻ ≫
PDE4DIP ↻ ≫
MTRNR2L9 ↻ ≫
SLC16A1 ↻ ≫
RELT ↻ ≫
KRTAP10-3 ↻ ≫
SPACA3 ↻ ≫
SHTN1 ↻ ≫
LPAR6 ↻ ≫
B3GNTL1 ↻ ≫
AGR2 ↻ ≫
ZNF750 ↻ ≫
WNT7B ↻ ≫
KRTAP4-1 ↻ ≫
B3GAT1 ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
MYBPC3 ↻ ≫
MRGPRF ↻ ≫
LRRC56 ↻ ≫
KRTAP10-1 ↻ ≫
C3 ↻ ≫
SLC19A1 ↻ ≫
RUBCN ↻ ≫
PRLH ↻ ≫
FYTTD1 ↻ ≫
ADAP1 ↻ ≫
IPMK ↻ ≫
CISD1 ↻ ≫
ASPH ↻ ≫
CACNA1B ↻ ≫
SELENOW ↻ ≫
CD300LG ↻ ≫
ANGPT2 ↻ ≫
KRTAP9-9 ↻ ≫
CD300A ↻ ≫
ZNF566 ↻ ≫
NAB2 ↻ ≫
CALN1 ↻ ≫
SHANK1 ↻ ≫
CLEC11A ↻ ≫
LSP1 ↻ ≫
SLC9A3R2 ↻ ≫
NMRK1 ↻ ≫
CCK ↻ ≫
PNPLA2 ↻ ≫
THPO ↻ ≫
ANGPTL2 ↻ ≫