ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RNF2

Query protein: RNF2
Cell class: Kidney
Sort key: SRX4650968 | 293
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RNF2's Colocalization partners

◢ RNF2: Average

◢ SRX113579: 293

◢ SRX113589: 293

◢ SRX4650905: 293

◢ SRX4650906: 293

◢ SRX4650907: 293

◢ SRX4650908: 293

◢ SRX4650909: 293

◢ SRX4650910: 293

◢ SRX4650911: 293

◢ SRX4650912: 293

◢ SRX4650927: 293

◢ SRX4650928: 293

◢ SRX4650929: 293

◢ SRX4650930: 293

◢ SRX4650931: 293

◢ SRX4650932: 293

◢ SRX4650947: 293

◢ SRX4650948: 293

◢ SRX4650949: 293

◢ SRX4650950: 293

◢ SRX4650951: 293

◢ SRX4650952: 293

◢ SRX4650965: 293

◢ SRX4650966: 293

◢ SRX4650967: 293

◣ SRX4650968: 293

◢ SRX4650969: 293

◢ SRX4650970: 293

◢ SRX4650983: 293

◢ SRX4650984: 293

◢ SRX4650985: 293

◢ SRX4650986: 293

◢ SRX4650987: 293

◢ SRX4650988: 293

◢ RNF2: STRING

293
 SRX4650968
RNF2
293
 SRX4650936
SUZ12
293
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RNF2
293
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SUZ12
293
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RNF2
293
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RNF2
293
 SRX4650907
RNF2
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293
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SUZ12
293
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SUZ12
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SUZ12
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 SRX4650933
SUZ12
293
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SUZ12
293
 SRX4650914
SUZ12
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SUZ12
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CBX7
293
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CBX7
293
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SUZ12
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RNF2
293
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RNF2
293
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RNF2
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SUZ12
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SUZ12
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CBX7
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RNF2
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SUZ12
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RNF2
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SUZ12
293
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RNF2
293
 SRX4650967
RNF2
293
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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 SRX4650973
SUZ12
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RNF2
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SUZ12
293
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SUZ12
293
 SRX4650975
SUZ12
293
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RNF2
293
 SRX4650969
RNF2
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PHC1
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RNF2
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PHC1
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CBX7
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CBX7
293
 SRX5299354
CBX7
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RNF2
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 SRX4650911
RNF2
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RNF2
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 SRX4650910
RNF2
293
 SRX4650958
SUZ12
293
 SRX4650957
SUZ12
293
 SRX4650952
RNF2
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 SRX4650950
RNF2
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PCGF1
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BMI1
293
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BMI1
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SCML2
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SCML2
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AR
293
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AFF4
Kidney Cortex
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SIX2
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BMI1
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RYBP
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EZH2
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EZH2
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EZH2
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EZH2
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EZH2
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SCML2
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SCML2
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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 SRX2323894
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KMT2A
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EHMT2
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EHMT2
293
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EHMT2
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EHMT2
293
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EHMT2
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EHMT2
293
 SRX973412
EHMT2
293
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ZFX
293
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USP7
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FOXM1
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FOXM1
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NUTM1
293
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NUTM1
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IRF2BP2
293
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IRF2BP2
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IRF2BP2
293
 SRX5202658
IRF2BP2
293
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ELL2
293
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AR
293
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CDK9
293
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BRD4
293
 SRX367310
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293
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BRD4
786-O
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RELA
786-O
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RELA
786-O
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293
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FANCD2
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ARNT
OS-RC-2
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ARNT
293
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AFF1
293
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293
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AFF1
293
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MYC
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SIX1
Kidney Cortex
 SRX1478538
SIX1
Kidney Cortex
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SIX1
Kidney Cortex
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SIX2
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SMARCA4
G-401
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293
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AFF4
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ELK4
293
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293
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CTNNB1
293
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CTNNB1
293
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AFF1
293
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TAF1C
293
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MED26
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MED26
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ICE1
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CBX4
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293
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PCGF2
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EZH2
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PCGF1
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SCML2
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PHC1
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PHC1
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PHC1
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AUTS2
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2A
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 SRX4931240
KMT2A
293
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KMT2A
293
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KMT2A
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KMT2A
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 SRX4931232
KMT2A
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 SRX2513054
RUNX1
293
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KMT2A
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 SRX2323890
KMT2A
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 SRX973433
EHMT2
293
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EHMT2
293
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EHMT2
293
 SRX973420
EHMT2
hTERT-HME1
 SRX4415495
RBBP7
hTERT-HME1
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RBBP7
293
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RBBP5
293
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WDR5
293
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WDR5
293
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TAF7
293
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ASXL1
Caki-1
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KDM5C
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KDM5C
Caki-1
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KDM5C
Caki-1
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KDM5C
293
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CBX1
293
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CBX5
293
 SRX974295
MEF2B
293
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MEF2B
293
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MEF2B
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MEF2B
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MEF2B
293
 SRX974290
MEF2B
786-O
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EPAS1
786-O
 SRX968421
ARNT
786-O
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EPAS1
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EPAS1
786-O
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ARNT
293
 SRX8018257
SUPT6H
293
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SUPT6H
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SUPT6H
293
 SRX8018231
CPSF3
293
 SRX8018230
CPSF3
293
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CPSF3
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CPSF3
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ZFX
293
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ZFX
293
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ZNF711
293
 SRX7805362
ZNF711
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ZFX
293
 SRX7805360
ZFX
293
 SRX738220
NUP98
293
 SRX738218
HOXA9
HGrC1
 SRX6957491
SMAD2
HGrC1
 SRX6957490
SMAD4
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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SMAD2
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SMAD4
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
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FOXL2
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SMAD2
HGrC1
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SMAD2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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FOXL2
HGrC1
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SMAD2
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SMAD2
HGrC1
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SMAD2
HGrC1
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SMAD4
HGrC1
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SMAD4
HGrC1
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SMAD4
HGrC1
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SMAD4
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SMAD2
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SMAD4
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FOXL2
HGrC1
 SRX6957399
SMAD4
HGrC1
 SRX6957398
SMAD4
HGrC1
 SRX6957397
FOXL2
HGrC1
 SRX6957396
FOXL2
HGrC1
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FOXL2
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 SRX6957392
FOXL2
293
 SRX6927199
THAP11
293
 SRX6927198
THAP11
293
 SRX6927197
THAP11
293
 SRX6927196
THAP11
293
 SRX6927195
THAP11
293
 SRX6927194
THAP11
iSLK
 SRX6916370
RAD21
iSLK
 SRX6916369
CTCF
iSLK
 SRX6916368
RAD21
iSLK
 SRX6916367
CTCF
iSLK
 SRX6916366
RAD21
iSLK
 SRX6916365
CTCF
RCC4
 SRX6853602
ARNT
RCC4
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ARNT
RCC4
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ARNT
293
 SRX6435429
PPP1R10
293
 SRX6435428
PPP1R10
293
 SRX6435411
SUPT5H
293
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SUPT5H
293
 SRX6435408
SUPT5H
293
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SUPT5H
293
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SUPT5H
293
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SUPT5H
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SUPT5H
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SUPT5H
293
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SUPT5H
293
 SRX6435398
SUPT5H
293
 SRX6435397
SUPT5H
293
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SUPT5H
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SUPT5H
293
 SRX6435392
SUPT5H
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