ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for TRIM28

Query protein: TRIM28
Cell class: Kidney
Sort key: SRX150671 | 293
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs TRIM28's Colocalization partners

◢ TRIM28: Average

◢ SRX065546: 293

◢ SRX065547: 293

◣ SRX150671: 293

◢ TRIM28: STRING

293
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786-O
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293
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WDR5
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BRCA2
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YAP1
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CREB1
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CREB1
Kidney Cortex
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VDR
Kidney Cortex
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VDR
Kidney Cortex
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VDR
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XRCC5
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RBM14
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BRD4
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PCGF2
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SMARCA4
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SMARCB1
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SMARCC1
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SMARCA4
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SMARCC1
TTC1240
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293
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IRF2BP2
293
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IRF2BP2
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IRF2BP2
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DICER1
293
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FOXA1
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293
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KMT2A
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ELL2
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2D
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KMT2A
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KMT2A
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KMT2D
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KMT2A
293
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KMT2A
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KMT2D
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KMT2A
293
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KMT2A
293
 SRX4894935
RELA
293
 SRX4894934
RELA
293
 SRX4819827
MED26
293
 SRX4819826
MED26
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ARNT
RCC4
 SRX4802353
ARNT
RCC4
 SRX4802350
EPAS1
RCC4
 SRX4802349
EPAS1
RCC4
 SRX4802348
HIF1A
RCC4
 SRX4802347
HIF1A
HKC8
 SRX4802346
HIF1A
HKC8
 SRX4802345
ARNT
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EPAS1
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ARNT
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ARNT
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ARNT
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HIF1A
HKC8
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HIF1A
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ARNT
HKC8
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ARNT
HKC8
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EPAS1
HKC8
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EPAS1
HKC8
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HIF1A
HKC8
 SRX4802299
HIF1A
293
 SRX4650988
RNF2
293
 SRX4650987
RNF2
293
 SRX4650986
RNF2
293
 SRX4650985
RNF2
293
 SRX4650984
RNF2
293
 SRX4650983
RNF2
293
 SRX4650976
SUZ12
293
 SRX4650975
SUZ12
293
 SRX4650974
SUZ12
293
 SRX4650973
SUZ12
293
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SUZ12
293
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SUZ12
293
 SRX4650970
RNF2
293
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RNF2
293
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RNF2
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RNF2
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RNF2
293
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RNF2
293
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SUZ12
293
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SUZ12
293
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SUZ12
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SUZ12
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SUZ12
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SUZ12
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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SUZ12
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SUZ12
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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SUZ12
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SUZ12
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SUZ12
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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RNF2
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293
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NCAPH2
TTC-1240
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SMARCA4
TTC-1240
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SMARCA4
TTC-1240
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SMARCA4
TTC-1240
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SMARCA4
TTC-1240
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CTCF
TTC-1240
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BRD9
TTC-1240
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BRD9
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RBBP7
hTERT-HME1
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RBBP7
hTERT-HME1
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HAT1
hTERT-HME1
 SRX4415492
HAT1
293
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SUPT16H
293
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AR
293
 SRX433193
AR
293
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AR
293
 SRX433191
AR
293
 SRX433190
AR
293
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AR
293
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CTCF
293
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TET3
293
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293
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CBX4
TTC-1240
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BRD9
TTC-1240
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BRD9
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CSE1L
293
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CSE1L
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293
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NELFA
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293
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CSTF3
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293
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SLBP
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SLBP
293
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SLBP
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FOXK1
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ASXL1
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CDK9
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CDK9
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CDK9
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EP300
293
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BRD4
293
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BRD4
293
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JMJD6
293
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JMJD6
Renal cell carcinoma
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ZHX2
Renal cell carcinoma
 SRX3636887
ZHX2
Renal cell carcinoma
 SRX3636885
RELA
293
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CREBBP
293
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CREBBP
293
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CREBBP
293
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CREBBP
293
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EP300
293
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EP300
293
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EP300
293
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EP300
G-401
 SRX3587645
MYC
G-401
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MYC
G-401
 SRX3587643
MYC
G-401
 SRX3587642
MYC
G-401
 SRX3587641
MYC
G-401
 SRX3587640
MYC
293
 SRX3422689
MYC
293
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MYC
293
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MYC
293
 SRX3422677
MYC
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MYC
293
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MYC
293
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BRD4
293
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BRD4
786-O
 SRX3346357
RELA
786-O
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RELA
786-O
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EPAS1
786-O
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RELA
786-O
 SRX3346352
RELA
786-O
 SRX3346350
EPAS1
293
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CTCF
293
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CTCF
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NR3C1
293
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NR3C1
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NR3C1
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NR3C1
293
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NR3C1
786-O
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ARID2
786-O
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ARID2
786-O
 SRX3102708
ARID2
293
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ZFX
293
 SRX3091916
ZFX
Renal cell carcinoma
 SRX3051209
EPAS1
Renal cell carcinoma
 SRX3051208
HIF1A
293
 SRX3020590
PHIP
Renal tubular cells
 SRX2993408
ARNTL
Renal tubular cells
 SRX2993407
HIF1A
A498
 SRX2940749
TP53
UO-31
 SRX2940748
TP53
293
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FANCD2
293
 SRX277585
FANCD2
OS-RC-2
 SRX2749155
ARNT
OS-RC-2
 SRX2749150
ARNT
786-O
 SRX2749144
ARNT
786-O
 SRX2749139
EP300
786-O
 SRX2749136
ARNT
293
 SRX2731520
NCAPH2
293
 SRX2731519
NCAPH2
293
 SRX2731518
NCAPH2
293
 SRX2731517
NCAPH2
293
 SRX2513054
RUNX1
293
 SRX235608
SMC3
293
 SRX2323897
AFF1
293
 SRX2323896
AFF1
293
 SRX2323895
KMT2A
293
 SRX2323894
KMT2A
293
 SRX2323893
AFF1
293
 SRX2323892
AFF4
293
 SRX2323891
KMT2A
293
 SRX2323890
KMT2A
293
 SRX2323867
KMT2A
293
 SRX2323866
KMT2A
293
 SRX2255901
RELA
293
 SRX2255900
RELA
293
 SRX2255899
RELA
293
 SRX2255898
RELA
293
 SRX2178948
ZMYND8
293
 SRX2178947
ZMYND8
293
 SRX210720
MYC
293
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MYC
293
 SRX210718
MYC
Renal cell carcinoma
 SRX2055845
JUN
Renal cell carcinoma
 SRX2055844
EP300
Renal cell carcinoma
 SRX2055843
RELA
Renal cell carcinoma
 SRX2055842
ETS1
293
 SRX204662
RBBP5
RPTEC
 SRX199895
CTCF
RPTEC
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CTCF
293
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ZSCAN5B
293
 SRX1993434
ZSCAN5B
293
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TET3
Kidney
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CTCF
293
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ZMYND8
293
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ZMYND8
Rhabdoid Tumor
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PGBD5
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CBX5
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BRD4
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BRD3
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BRD2
786-O
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CTCF
786-O
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CTCF
293
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ZNF76
293
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ZNF143
293
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ELK4
293
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BMI1
293
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SCML2
293
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BMI1
293
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SCML2
293
 SRX149704
BMI1
293
 SRX149703
SCML2
Kidney Cortex
 SRX1478544
SIX2
Kidney Cortex
 SRX1478543
SIX2
Kidney Cortex
 SRX1478542
SIX2
Kidney Cortex
 SRX1478541
SIX2
Kidney Cortex
 SRX1478540
SIX1
Kidney Cortex
 SRX1478539
SIX1
Kidney Cortex
 SRX1478538
SIX1
Kidney Cortex
 SRX1478537
EP300
293
 SRX1457748
RELA
293
 SRX1457747
RELA
293
 SRX1457746
RELA
293
 SRX1457745
RELA
293
 SRX1429050
PARP1
293
 SRX1427030
MBD3L2
293
 SRX1427029
TET2
293
 SRX1353403
CTCF
293
 SRX1353402
CTCF
Kidney Cortex
 SRX1318620
SIX1
Kidney Cortex
 SRX1318619
SIX1
Kidney Cortex
 SRX1318617
SIX2
Kidney Cortex
 SRX1318615
SIX2
293
 SRX130268
OGT
293
 SRX130267
TET3
293
 SRX130266
TET2
293
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TAF15
293
 SRX1293071
EWSR1
293
 SRX1293070
FUS
293
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SMN1
Caki-1
 SRX1268852
KDM5C
Caki-1
 SRX1268851
KDM5C
Caki-1
 SRX1268850
KDM5C
Caki-1
 SRX1268849
KDM5C
293
 SRX1206075
XRN2
293
 SRX118011
TBL1Y
293
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GPS2
786-O
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ARNTL
786-O
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EPAS1
293
 SRX113592
CBX2
293
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BMI1
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RYBP
293
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RNF2
293
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CBX2
293
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PCGF5
293
 SRX113583
BMI1
293
 SRX113581
PCGF1
293
 SRX113580
RYBP
293
 SRX113579
RNF2
G-401
 SRX1123849
SMARCA4
G-401
 SRX1123848
SMARCC1
G-401
 SRX1123844
SMARCA4
G-401
 SRX1123843
SMARCC1
293
 SRX110230
AFF4
HEK293-T-REx
 SRX1094521
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094520
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094518
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094516
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094514
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094512
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094510
BRD4
HEK293-T-REx
 SRX1094508
BRD4
293
 SRX1022747
WRN
293
 SRX094470
TCF7L2
HRE
 SRX080400
CTCF
HRE
 SRX080390
CTCF
293
 SRX080350
CTCF
293
 SRX080331
CTCF
293
 SRX065549
ELK4
293
 SRX065548
ELK4
VMRC-RCW
 ERX3266650
PAX8
Caki-1
 ERX3266645
PAX8
786-O
 ERX3266640
PAX8
769-P
 ERX3266635
PAX8
293
 ERX2722359
CTNNB1
293
 ERX2722358
CTNNB1
293
 ERX2722357
CTNNB1
293
 ERX2722356
CTNNB1
293
 ERX2722354
CTNNB1
293
 ERX2722352
CTNNB1
293
 ERX2722350
CTNNB1
293
 ERX2722348
CTNNB1
293
 ERX2443916
RFX5
293
 ERX2443915
RFX5
293
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HOXB13
293
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RFX5
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RFX5
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HOXB13
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HOXB13
293
 DRX059637
MLLT6
293
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AFF1
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BMI1
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DOT1L
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 DRX022359
MED26
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MED26
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MED26
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 DRX022355
ICE1
293
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ICE1
293
 DRX022353
ICE1
293
 DRX022350
TAF7
293
 DRX013191
RAD21
293
 DRX013190
CTCF