ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rpa1

Query protein: Rpa1
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX205963 | Thymocytes
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Rpa1's Target genes

◢ Rpa1: Average

◢ SRX205922: B cells

◢ SRX205923: B cells

◢ SRX205924: B cells

◢ SRX205925: B cells

◢ SRX205926: B cells

◢ SRX205927: B cells

◢ SRX205928: B cells

◢ SRX205929: B cells

◢ SRX205930: B cells

◢ SRX205931: B cells

◢ SRX205935: B cells

◢ SRX205936: B cells

◢ SRX205937: B cells

◢ SRX205939: B cells

◢ SRX205940: B cells

◢ SRX205941: B cells

◢ SRX205943: B cells

◢ SRX205945: B cells

◢ SRX205946: B cells

◢ SRX205947: B cells

◢ SRX205948: B cells

◢ SRX205949: B cells

◢ SRX205951: B cells

◢ SRX205952: B cells

◢ SRX205953: B cells

◢ SRX205954: B cells

◢ SRX205955: B cells

◢ SRX205956: B cells

◢ SRX205957: B cells

◢ SRX205967: B cells

◢ SRX205966: MEF

◢ SRX6403362: MEF

◢ SRX6403363: MEF

◢ SRX6403364: MEF

◢ SRX119446: Spleen

◢ SRX119447: Spleen

◢ SRX119448: Spleen

◢ SRX205960: Thymocytes

◢ SRX205961: Thymocytes

◢ SRX205962: Thymocytes

◣ SRX205963: Thymocytes

◢ SRX205964: Thymocytes

◢ SRX205965: Thymocytes

◢ Rpa1: STRING
Vmn2r4 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Klra1 ↻ ≫
Vmn2r15 ↻ ≫
Gm12789 ↻ ≫
Hdac10 ↻ ≫
Ydjc ↻ ≫
Ccdc116 ↻ ≫
Olfr149 ↻ ≫
Sstr4 ↻ ≫
Olfr1310 ↻ ≫
Vmn2r112 ↻ ≫
Vamp1 ↻ ≫
Olfr711 ↻ ≫
Olfr1360 ↻ ≫
Adam1a ↻ ≫
Clasrp ↻ ≫
Prox2 ↻ ≫
Catsper3 ↻ ≫
Hsd17b3 ↻ ≫
Ltk ↻ ≫
Clec1a ↻ ≫
Olfr1276 ↻ ≫
Uba1 ↻ ≫
Samd3 ↻ ≫
Olfr955 ↻ ≫
Mageb16 ↻ ≫
Emc2 ↻ ≫
Olfr171 ↻ ≫
Syne1 ↻ ≫
Rps29 ↻ ≫
Rhov ↻ ≫
Coq5 ↻ ≫
Vmn1r227 ↻ ≫
Lipa ↻ ≫
Stk4 ↻ ≫
Arl14epl ↻ ≫
Tm4sf1 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Emid1 ↻ ≫
Gm20594 ↻ ≫
Nms ↻ ≫
Rxrg ↻ ≫
Eif2ak1 ↻ ≫
Olfr30 ↻ ≫
Pparg ↻ ≫
Krtap1-4 ↻ ≫
Uhmk1 ↻ ≫
Vmn2r22 ↻ ≫
Gm5458 ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Rlf ↻ ≫
Clec7a ↻ ≫
Nckap5 ↻ ≫
Mgam ↻ ≫
Esrrg ↻ ≫
Setdb1 ↻ ≫
Tsku ↻ ≫
Ropn1 ↻ ≫
1700006A11Rik ↻ ≫
Abraxas1 ↻ ≫
Micos10 ↻ ≫
Hecw1 ↻ ≫
Cept1 ↻ ≫
Eef2k ↻ ≫
Morn2 ↻ ≫
Dhx57 ↻ ≫
Lax1 ↻ ≫
Fa2h ↻ ≫
Olfr488 ↻ ≫
Fnta ↻ ≫
Krt42 ↻ ≫
Cndp2 ↻ ≫
H2al1j ↻ ≫
Bcl2l2 ↻ ≫
Vmn1r67 ↻ ≫
Aqp11 ↻ ≫
Try10 ↻ ≫
Ccdc152 ↻ ≫
Akr1c21 ↻ ≫
Vnn3 ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Ascl3 ↻ ≫
Rhox3h ↻ ≫
Plch1 ↻ ≫
Plekhg1 ↻ ≫
Olfr850 ↻ ≫
Vti1b ↻ ≫
Zbtb3 ↻ ≫
Olfr913 ↻ ≫
Ang4 ↻ ≫
Nek6 ↻ ≫
Ostm1 ↻ ≫
Nxf3 ↻ ≫
Rhox2h ↻ ≫
2310057N15Rik ↻ ≫
Pde7b ↻ ≫
Rpn1 ↻ ≫
Tyw3 ↻ ≫
Cryz ↻ ≫
Smu1 ↻ ≫
Kifc1 ↻ ≫
Tecrl ↻ ≫
Alyref2 ↻ ≫
Vmn2r14 ↻ ≫
Slc24a2 ↻ ≫
Npm2 ↻ ≫
Naaa ↻ ≫
Slc25a38 ↻ ≫
Prp2 ↻ ≫
Awat2 ↻ ≫
Dna2 ↻ ≫
Olfr270 ↻ ≫
Hectd4 ↻ ≫
Dlg3 ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
Pgam1 ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
Catspere2 ↻ ≫
H2-M10.3 ↻ ≫
Acoxl ↻ ≫
Dhrs7b ↻ ≫
4933402J07Rik ↻ ≫
Gemin6 ↻ ≫
Nudt15 ↻ ≫
Mlst8 ↻ ≫
Tlr1 ↻ ≫
Elapor1 ↻ ≫
1700013F07Rik ↻ ≫
Ddx1 ↻ ≫
Slc41a2 ↻ ≫
Bet1 ↻ ≫
4930579F01Rik ↻ ≫
Dguok ↻ ≫
Slco6c1 ↻ ≫
Commd1 ↻ ≫
Bbs2 ↻ ≫
Kifc5b ↻ ≫
Wdr11 ↻ ≫
Cldn10 ↻ ≫
Rdm1 ↻ ≫
Mtres1 ↻ ≫
Pax2 ↻ ≫
Opalin ↻ ≫
Olfr761 ↻ ≫
Commd2 ↻ ≫
Ms4a10 ↻ ≫
Gmfg ↻ ≫
Tlr3 ↻ ≫
Btbd35f23 ↻ ≫
Btbd35f21 ↻ ≫
Birc2 ↻ ≫
Slu7 ↻ ≫
Cyp8b1 ↻ ≫
Vcam1 ↻ ≫
Add3 ↻ ≫
Dnah6 ↻ ≫
Aunip ↻ ≫
Olfr743 ↻ ≫
Olfr378 ↻ ≫
Ube3c ↻ ≫
Fanci ↻ ≫
Cfap69 ↻ ≫
Yod1 ↻ ≫
Olfr1395 ↻ ≫
Kat5 ↻ ≫
Rpl27 ↻ ≫
Map4 ↻ ≫
Vrk1 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
Klra3 ↻ ≫
Fancg ↻ ≫
Mctp1 ↻ ≫
Tdpoz8 ↻ ≫
Prl7a1 ↻ ≫
Dcdc2b ↻ ≫
Trim69 ↻ ≫
Hlcs ↻ ≫
Mex3a ↻ ≫
Tas2r136 ↻ ≫
Tekt5 ↻ ≫
Lmo7 ↻ ≫
Trappc6b ↻ ≫
Ifit3b ↻ ≫
Rad17 ↻ ≫
Btbd35f26 ↻ ≫
Hemgn ↻ ≫
Glrx2 ↻ ≫
Tcerg1 ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Lce1g ↻ ≫
H3c6 ↻ ≫
Tm4sf19 ↻ ≫
Runx3 ↻ ≫
Scml4 ↻ ≫
Polr3e ↻ ≫
Crb1 ↻ ≫
Nop58 ↻ ≫
P4hb ↻ ≫
Pole3 ↻ ≫
4933430I17Rik ↻ ≫
Psmc1 ↻ ≫
Mvb12a ↻ ≫
Ccl3 ↻ ≫
Sgk2 ↻ ≫
Btbd35f2 ↻ ≫
Btbd35f1 ↻ ≫
9930012K11Rik ↻ ≫
Mtfmt ↻ ≫
Fnbp1 ↻ ≫
Rogdi ↻ ≫
Tac2 ↻ ≫
Pim1 ↻ ≫
Zfp280c ↻ ≫
Vmn2r10 ↻ ≫
Ncstn ↻ ≫
Cyp2b13 ↻ ≫
Arhgdib ↻ ≫
Gna11 ↻ ≫
Atf7ip ↻ ≫
Osgin1 ↻ ≫
Gcdh ↻ ≫
Skint11 ↻ ≫
Oacyl ↻ ≫
Cldn34b4 ↻ ≫
Cacnb2 ↻ ≫
Pdcd2l ↻ ≫
Deup1 ↻ ≫
Ddx11 ↻ ≫
Pggt1b ↻ ≫
Ebf1 ↻ ≫
Taf1 ↻ ≫
Rbms2 ↻ ≫
Ess2 ↻ ≫
Slc4a4 ↻ ≫
Agmat ↻ ≫
Map2k6 ↻ ≫
Olfr392 ↻ ≫
Cst9 ↻ ≫
Gm4787 ↻ ≫
Coq9 ↻ ≫
Ciapin1 ↻ ≫
Kcnj13 ↻ ≫
Olfr1408 ↻ ≫
Rpl32 ↻ ≫
Slitrk1 ↻ ≫
Prim2 ↻ ≫
Pm20d2 ↻ ≫
Champ1 ↻ ≫
Agtpbp1 ↻ ≫
Olfr137 ↻ ≫
Dpy30 ↻ ≫
Alg14 ↻ ≫
Scn8a ↻ ≫
Polr2h ↻ ≫
Rab20 ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Zfp113 ↻ ≫
Dnph1 ↻ ≫
Cdca7l ↻ ≫
Lilrb4a ↻ ≫
Btbd35f18 ↻ ≫
Btbd35f16 ↻ ≫
Btbd35f15 ↻ ≫
Btbd35f11 ↻ ≫
Btbd35f10 ↻ ≫
Itpkb ↻ ≫
Pdk4 ↻ ≫
Olfr93 ↻ ≫
Olfr728 ↻ ≫
Qrsl1 ↻ ≫
2610008E11Rik ↻ ≫
Mbnl2 ↻ ≫
Idh3b ↻ ≫
Coq2 ↻ ≫
Cdk1 ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Pramel12 ↻ ≫
Gm15881 ↻ ≫
Tmem181a ↻ ≫
Tfeb ↻ ≫
Plg ↻ ≫
Anks3 ↻ ≫
4930451G09Rik ↻ ≫
Rnf216 ↻ ≫
Hspb1 ↻ ≫
Dmac2 ↻ ≫
Cldn34c4 ↻ ≫
Tmem87b ↻ ≫
Stxbp1 ↻ ≫
Fam160b2 ↻ ≫
Bmyc ↻ ≫
Olfr485 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Ndufb4 ↻ ≫
Gimap1 ↻ ≫
Dusp3 ↻ ≫
Pemt ↻ ≫
Med9 ↻ ≫
Tlr6 ↻ ≫
Krtap9-3 ↻ ≫
Btbd35f20 ↻ ≫
Usp50 ↻ ≫
Timeless ↻ ≫
Nfe2l1 ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Taf6 ↻ ≫
Cnpy4 ↻ ≫
Ttc14 ↻ ≫
Krtap19-9b ↻ ≫
Zfp599 ↻ ≫
Tgif1 ↻ ≫
AI661453 ↻ ≫
Smim4 ↻ ≫
Lsg1 ↻ ≫
Tmem50a ↻ ≫
Synpo2 ↻ ≫
Foxd3 ↻ ≫
Fgfbp3 ↻ ≫
Polm ↻ ≫
Lsm2 ↻ ≫
Slamf7 ↻ ≫
Ptger3 ↻ ≫
Plac8 ↻ ≫
Atp6v0a1 ↻ ≫
Tas2r119 ↻ ≫
Snrnp35 ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Liph ↻ ≫
Sft2d1 ↻ ≫
Senp7 ↻ ≫
Pigs ↻ ≫
Tti2 ↻ ≫
Il2ra ↻ ≫
Taf9 ↻ ≫
Mrps30 ↻ ≫
Ak6 ↻ ≫
Myh10 ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Dnajc5b ↻ ≫
Fam227b ↻ ≫
Dtwd1 ↻ ≫
Supt6 ↻ ≫
Siglecg ↻ ≫
Sdf2 ↻ ≫
Psmb2 ↻ ≫
Rnf168 ↻ ≫
Polrmt ↻ ≫
Itln1 ↻ ≫
Exoc4 ↻ ≫
Ppp1r12b ↻ ≫
Sf3b6 ↻ ≫
Dnah8 ↻ ≫
Nuf2 ↻ ≫
Lztr1 ↻ ≫
Klhdc10 ↻ ≫
Topbp1 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Pes1 ↻ ≫
Cyfip2 ↻ ≫
Clpb ↻ ≫
E2f2 ↻ ≫
Alpk1 ↻ ≫
Rptor ↻ ≫
Med15 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Bub3 ↻ ≫
Zfp52 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
H4c11 ↻ ≫
Dalrd3 ↻ ≫
Nadk ↻ ≫
1700066B19Rik ↻ ≫
Vps53 ↻ ≫
Tmem160 ↻ ≫
Gapvd1 ↻ ≫
Fam227a ↻ ≫
Dlx2 ↻ ≫
Ccdc180 ↻ ≫
Cby1 ↻ ≫
Ufc1 ↻ ≫
Rfc3 ↻ ≫
Acad9 ↻ ≫
Zfp213 ↻ ≫
Srpk2 ↻ ≫
Lrrc49 ↻ ≫
Baz1a ↻ ≫
Acyp1 ↻ ≫
Nucb1 ↻ ≫
Apobec1 ↻ ≫
Shkbp1 ↻ ≫
Mrps21 ↻ ≫
Irak2 ↻ ≫
Uba6 ↻ ≫
Pih1d1 ↻ ≫
Pdlim5 ↻ ≫
Nabp1 ↻ ≫
Os9 ↻ ≫
Ankrd55 ↻ ≫
Tsfm ↻ ≫
Kif14 ↻ ≫
Il4ra ↻ ≫
Stom ↻ ≫
Rbbp4 ↻ ≫
Gm17660 ↻ ≫
Bphl ↻ ≫
Zfp280b ↻ ≫
Tfdp2 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Smim40 ↻ ≫
Scaf1 ↻ ≫
N4bp2 ↻ ≫
Mat2b ↻ ≫
Bahcc1 ↻ ≫
Ahi1 ↻ ≫
Ubxn7 ↻ ≫
Snx27 ↻ ≫
Med11 ↻ ≫
Nup107 ↻ ≫
Rad23a ↻ ≫
Fsbp ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Rexo5 ↻ ≫
Frat2 ↻ ≫
Eri2 ↻ ≫
Eef1akmt1 ↻ ≫
Parp2 ↻ ≫
Ndufb8 ↻ ≫
Zfyve1 ↻ ≫
Zc3h6 ↻ ≫
Syde2 ↻ ≫
Ncapg2 ↻ ≫
Ifna11 ↻ ≫
Ercc1 ↻ ≫
Cflar ↻ ≫
Atp5e ↻ ≫
Pnpla8 ↻ ≫
Zfp397 ↻ ≫
Psmc4 ↻ ≫
Fgfr4 ↻ ≫
H3c4 ↻ ≫
Ptgs1 ↻ ≫
Fanca ↻ ≫
Wdr31 ↻ ≫