ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Nkx3-2

Query protein: Nkx3-2
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: Nkx3-2 | Average
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Nkx3-2's Target genes

◣ Nkx32: Average

◢ SRX130587: Neural tube

◢ SRX130591: NIH/3T3

◢ Nkx32: STRING
Cldn34d ↻ ≫
Nkx3-2 ↻ ≫
Olfr806 ↻ ≫
Wwox ↻ ≫
Abhd6 ↻ ≫
Gxylt1 ↻ ≫
Tmcc1 ↻ ≫
Kpna1 ↻ ≫
Mllt3 ↻ ≫
Cdh23 ↻ ≫
Tmem117 ↻ ≫
Tbc1d15 ↻ ≫
Lysmd4 ↻ ≫
Trem2 ↻ ≫
Gm51573 ↻ ≫
CK137956 ↻ ≫
Ciita ↻ ≫
Twf1 ↻ ≫
Tasp1 ↻ ≫
Tmem267 ↻ ≫
Prl3c1 ↻ ≫
Ank ↻ ≫
Map4k5 ↻ ≫
Atl1 ↻ ≫
Cfap36 ↻ ≫
Ube2l6 ↻ ≫
1700066M21Rik ↻ ≫
Fam234b ↻ ≫
Trappc6b ↻ ≫
Il31ra ↻ ≫
Cndp1 ↻ ≫
Dst ↻ ≫
Yipf4 ↻ ≫
Fpr1 ↻ ≫
Olfr1225 ↻ ≫
Mmp7 ↻ ≫
Slc26a2 ↻ ≫
Tbc1d14 ↻ ≫
St8sia5 ↻ ≫
Krt27 ↻ ≫
Scn8a ↻ ≫
Abcg2 ↻ ≫
Prr18 ↻ ≫
Eqtn ↻ ≫
Dnajc11 ↻ ≫
Tent5c ↻ ≫
Ifna13 ↻ ≫
Daglb ↻ ≫
4930503B20Rik ↻ ≫
Psma3 ↻ ≫
Zfp719 ↻ ≫
Olfr992 ↻ ≫
Dnmt1 ↻ ≫
Sptlc2 ↻ ≫
Gtse1 ↻ ≫
Efcab14 ↻ ≫
Neo1 ↻ ≫
Alkbh3 ↻ ≫
Ubl7 ↻ ≫
Cct4 ↻ ≫
Bach2 ↻ ≫
Aadacl2fm1 ↻ ≫
Setd4 ↻ ≫
Cbr1 ↻ ≫
Vmn2r108 ↻ ≫
Tdpoz2 ↻ ≫
Arhgef37 ↻ ≫
Smc2 ↻ ≫
Adamts10 ↻ ≫
Tmem125 ↻ ≫
Rpl7l1 ↻ ≫
Scoc ↻ ≫
Ptprh ↻ ≫
Gas2 ↻ ≫
Fancf ↻ ≫
Lig4 ↻ ≫
Abhd13 ↻ ≫
Rpl8 ↻ ≫
Racgap1 ↻ ≫
Commd5 ↻ ≫
Olfr1434 ↻ ≫
Prl7c1 ↻ ≫
Hsd3b4 ↻ ≫
Gm10681 ↻ ≫
Tnfrsf1a ↻ ≫
Kirrel3 ↻ ≫
Kif1b ↻ ≫
Cyp2j13 ↻ ≫
Spo11 ↻ ≫
Ccdc3 ↻ ≫
Arap1 ↻ ≫
Actl9 ↻ ≫
Csf2ra ↻ ≫
Serpini1 ↻ ≫
Pdcd10 ↻ ≫
Rwdd1 ↻ ≫
Inpp5a ↻ ≫
Rusc1 ↻ ≫
Rragc ↻ ≫
Grm4 ↻ ≫
Syngr2 ↻ ≫
Rnf216 ↻ ≫
Vmn2r4 ↻ ≫
Vmn1r85 ↻ ≫
Gcgr ↻ ≫
Gal3st2b ↻ ≫
Prpf3 ↻ ≫
Tox ↻ ≫
Srsf12 ↻ ≫
Eef2 ↻ ≫
Dapk3 ↻ ≫
Cpne4 ↻ ≫
Ppp3cc ↻ ≫
Olfr347 ↻ ≫
Chchd6 ↻ ≫
Arhgap42 ↻ ≫
Arl2 ↻ ≫
Rapgef6 ↻ ≫
Cdrt4 ↻ ≫
Olfr1289 ↻ ≫
Epha4 ↻ ≫
Olfr1221 ↻ ≫
Lrrn3 ↻ ≫
Klhl17 ↻ ≫
Gm4450 ↻ ≫
Cdh12 ↻ ≫
Tmed9 ↻ ≫
Ckap5 ↻ ≫
Atxn7l2 ↻ ≫
Trip4 ↻ ≫
Spag16 ↻ ≫
Lce1f ↻ ≫
Svil ↻ ≫
Olfr816 ↻ ≫
Klre1 ↻ ≫
Glcci1 ↻ ≫
Cenps ↻ ≫
Sbno2 ↻ ≫
Rab21 ↻ ≫
Mrc2 ↻ ≫
Olfr787 ↻ ≫
Rftn2 ↻ ≫
Llcfc1 ↻ ≫
Zfp648 ↻ ≫
Sftpb ↻ ≫
Dcun1d5 ↻ ≫
Bri3 ↻ ≫
Vash1 ↻ ≫
Edn2 ↻ ≫
Zfp111 ↻ ≫
Mmp3 ↻ ≫
Elf2 ↻ ≫
Dchs2 ↻ ≫
Vmn1r32 ↻ ≫
Rps21 ↻ ≫
Nhp2 ↻ ≫
Gnat2 ↻ ≫
Cecr2 ↻ ≫
Ucp1 ↻ ≫
Synpr ↻ ≫
Rasgrf2 ↻ ≫
Olfr1357 ↻ ≫
Muc3 ↻ ≫
Ccdc149 ↻ ≫
Apela ↻ ≫
Wbp1l ↻ ≫
Pnliprp2 ↻ ≫
Dna2 ↻ ≫
Dao ↻ ≫
1810046K07Rik ↻ ≫
Gm28710 ↻ ≫
Tcf12 ↻ ≫
Gfra2 ↻ ≫
Npc1 ↻ ≫
Jmjd1c ↻ ≫
Gde1 ↻ ≫
Ccp110 ↻ ≫
Atp10d ↻ ≫
Atic ↻ ≫
Rpl15 ↻ ≫
Nkiras1 ↻ ≫
Hmgb1 ↻ ≫
Oasl1 ↻ ≫
Inf2 ↻ ≫
Clcn4 ↻ ≫
Piwil1 ↻ ≫
Olfr951 ↻ ≫
Epb41l1 ↻ ≫
Map3k3 ↻ ≫
Pdgfrb ↻ ≫
Ccdc110 ↻ ≫
Ppp6c ↻ ≫
Birc2 ↻ ≫
Stambp ↻ ≫
Krtap1-5 ↻ ≫
Krtap1-4 ↻ ≫
Tmem68 ↻ ≫
Tgs1 ↻ ≫
Gmfb ↻ ≫
Slc36a3 ↻ ≫
Vps35l ↻ ≫
Tceanc ↻ ≫
Nova1 ↻ ≫
Mfn2 ↻ ≫
Fut8 ↻ ≫
Ctla4 ↻ ≫
Ptpn13 ↻ ≫
Pias1 ↻ ≫
Mrps28 ↻ ≫
Mical1 ↻ ≫
Zfp800 ↻ ≫
Tex55 ↻ ≫
Chia1 ↻ ≫
C1ql3 ↻ ≫
Usp39 ↻ ≫
Trappc4 ↻ ≫
Rps25 ↻ ≫
0610030E20Rik ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Tex24 ↻ ≫
Prkch ↻ ≫
Srd5a3 ↻ ≫
Ncapg2 ↻ ≫
L3mbtl1 ↻ ≫
Ctsf ↻ ≫
Zbed4 ↻ ≫
Ttc23l ↻ ≫
Mcrip2 ↻ ≫
Rpe ↻ ≫
Reps1 ↻ ≫
Ppp1r17 ↻ ≫
Abra ↻ ≫
Zscan12 ↻ ≫
E430018J23Rik ↻ ≫
9130019O22Rik ↻ ≫
4932438H23Rik ↻ ≫
Rerg ↻ ≫
Cfap45 ↻ ≫
Mcc ↻ ≫
Lrg1 ↻ ≫
Farsb ↻ ≫
Npsr1 ↻ ≫
Myh11 ↻ ≫
Mrpl40 ↻ ≫
Ifi203 ↻ ≫
Hira ↻ ≫
Ghsr ↻ ≫
D1Pas1 ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Cep78 ↻ ≫
Ptpn22 ↻ ≫
Psen2 ↻ ≫
Ints9 ↻ ≫
Hmbox1 ↻ ≫
Ptrhd1 ↻ ≫
Pick1 ↻ ≫
Cenpo ↻ ≫
Hdac8 ↻ ≫
Acyp1 ↻ ≫
Maml3 ↻ ≫
4931429L15Rik ↻ ≫
Timm8a2 ↻ ≫
Smim19 ↻ ≫
Slc20a2 ↻ ≫
Nek10 ↻ ≫
Rps3 ↻ ≫
Pes1 ↻ ≫
Olfr1402 ↻ ≫
Zfp142 ↻ ≫
Pafah2 ↻ ≫
Olfr50 ↻ ≫
Lingo2 ↻ ≫
Galc ↻ ≫
Cdh4 ↻ ≫
Ccl11 ↻ ≫
Bcs1l ↻ ≫
Gm10778 ↻ ≫
Zfp658 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Olfr286 ↻ ≫
Asic1 ↻ ≫
Xab2 ↻ ≫
Pet100 ↻ ≫
Pcp2 ↻ ≫
Ntan1 ↻ ≫
Enpp7 ↻ ≫
Ccdc17 ↻ ≫
H2az1 ↻ ≫
Dnajb14 ↻ ≫
Rplp0 ↻ ≫
Runx1t1 ↻ ≫
Golga7b ↻ ≫
Chrna4 ↻ ≫
9930012K11Rik ↻ ≫
Crispld2 ↻ ≫
Zfp821 ↻ ≫
Setdb2 ↻ ≫
Rsbn1 ↻ ≫
Nphp1 ↻ ≫
Mtln ↻ ≫
Klf14 ↻ ≫
Ist1 ↻ ≫
Grik2 ↻ ≫
Gm45935 ↻ ≫
Gatad2a ↻ ≫
Cab39l ↻ ≫
Aox2 ↻ ≫
Itgb3 ↻ ≫
Tmem123 ↻ ≫
Slc22a27 ↻ ≫
Nat8f6 ↻ ≫
Icam1 ↻ ≫
Arl4a ↻ ≫
Ppp2r5c ↻ ≫
Amy1 ↻ ≫
Usp5 ↻ ≫
Cdca3 ↻ ≫
Ankrd33 ↻ ≫
Abca6 ↻ ≫
Zfp579 ↻ ≫
Yap1 ↻ ≫
Pcyt1a ↻ ≫
Fndc11 ↻ ≫
Elk1 ↻ ≫
Dcp2 ↻ ≫
Dcaf15 ↻ ≫
Clec4g ↻ ≫
BC052040 ↻ ≫
Baz2a ↻ ≫
Sfxn2 ↻ ≫
Arl3 ↻ ≫
Fbxw17 ↻ ≫
Olfr239 ↻ ≫
C2cd6 ↻ ≫
Dcaf5 ↻ ≫
Tatdn2 ↻ ≫
Tcl1b2 ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Ncam1 ↻ ≫
Dusp4 ↻ ≫
Rell2 ↻ ≫
Katnb1 ↻ ≫
Kank3 ↻ ≫
Hdac3 ↻ ≫
Gnai3 ↻ ≫
Kcnt1 ↻ ≫
Fbxl14 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Chchd7 ↻ ≫
Pcid2 ↻ ≫
Cul4a ↻ ≫
4931408C20Rik ↻ ≫
Myo10 ↻ ≫
Shh ↻ ≫
Ihh ↻ ≫
Runx2 ↻ ≫