ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Rxra

Query protein: Rxra
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX520463 | F9
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Rxra's Target genes

◢ Rxra: Average

◢ SRX003138: 3T3-L1

◢ SRX003139: 3T3-L1

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◢ SRX868178: ES cells

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◢ SRX467367: IDG-SW3

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◢ SRX6658451: Liver

◢ SRX769793: Macrophages

◢ SRX423951: MC3T3-E1

◢ SRX423952: MC3T3-E1

◢ SRX423962: MC3T3-E1

◢ SRX423963: MC3T3-E1

◢ SRX1672782: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672783: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672784: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672785: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672818: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672819: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672820: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672857: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672886: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1672887: Mesenchymal stem cells

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◢ SRX1672889: Mesenchymal stem cells

◢ SRX1017447: P19

◢ SRX1017448: P19

◢ SRX1017449: P19

◢ SRX1017450: P19

◢ SRX1017451: P19

◢ SRX305975: Unclassified

◢ SRX305977: Unclassified

◢ SRX305979: Unclassified

◢ SRX305981: Unclassified

◢ Rxra: STRING
Slc15a1 ↻ ≫
Fubp3 ↻ ≫
Porcn ↻ ≫
Ttk ↻ ≫
Rbks ↻ ≫
Babam2 ↻ ≫
Adgra2 ↻ ≫
Rarb ↻ ≫
Plekhb1 ↻ ≫
Enpp4 ↻ ≫
Mtf2 ↻ ≫
Alkbh7 ↻ ≫
Tcp11 ↻ ≫
Slc6a16 ↻ ≫
Mbd3 ↻ ≫
Oxnad1 ↻ ≫
Dph3 ↻ ≫
Acp6 ↻ ≫
Spata33 ↻ ≫
Chmp1a ↻ ≫
Slc43a1 ↻ ≫
Cdx1 ↻ ≫
Ptprz1 ↻ ≫
Dhx32 ↻ ≫
Hivep3 ↻ ≫
Homer3 ↻ ≫
Fam32a ↻ ≫
Cdk15 ↻ ≫
Dppa2 ↻ ≫
Eif4e1b ↻ ≫
H2-Q8 ↻ ≫
H2-Q6 ↻ ≫
Rab8a ↻ ≫
Arf4 ↻ ≫
Mkrn1 ↻ ≫
Tfrc ↻ ≫
Uck1 ↻ ≫
Mylpf ↻ ≫
Phf5a ↻ ≫
Aco2 ↻ ≫
Sdha ↻ ≫
Ccdc127 ↻ ≫
Bmt2 ↻ ≫
Ankrd28 ↻ ≫
Wsb2 ↻ ≫
Fkbp8 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Gtpbp4 ↻ ≫
Dpp9 ↻ ≫
Dusp9 ↻ ≫
Cox17 ↻ ≫
Tmem191c ↻ ≫
H2-Q9 ↻ ≫
H2-Q7 ↻ ≫
Lipe ↻ ≫
Cfl2 ↻ ≫
Muc1 ↻ ≫
Irf5 ↻ ≫
Chchd1 ↻ ≫
Cox5b ↻ ≫
Eif4e ↻ ≫
Ifitm7 ↻ ≫
Bmerb1 ↻ ≫
Guf1 ↻ ≫
Tm7sf3 ↻ ≫
Arhgap19 ↻ ≫
Nr6a1 ↻ ≫
Zfp930 ↻ ≫
Abr ↻ ≫
Abcb7 ↻ ≫
Mdk ↻ ≫
Wnt8a ↻ ≫
Ubap1 ↻ ≫
Ndufs8 ↻ ≫
Phc1 ↻ ≫
Dedd ↻ ≫
Rarg ↻ ≫
Rhobtb1 ↻ ≫
Prdm14 ↻ ≫
Zfyve28 ↻ ≫
H2-Bl ↻ ≫
Cfap20dc ↻ ≫
Cabin1 ↻ ≫
Inppl1 ↻ ≫
Tradd ↻ ≫
Fbxl8 ↻ ≫
Rusc2 ↻ ≫
Klhl34 ↻ ≫
Knop1 ↻ ≫
Iqck ↻ ≫
Nek2 ↻ ≫
Rbm14 ↻ ≫
Gm21992 ↻ ≫
Hrob ↻ ≫
Gabbr1 ↻ ≫
Sbno1 ↻ ≫
Utp14b ↻ ≫
Acsl3 ↻ ≫
Bhmg1 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
Pyroxd1 ↻ ≫
Sntb2 ↻ ≫
Usp37 ↻ ≫
Cnot9 ↻ ≫
Hagh ↻ ≫
Fahd1 ↻ ≫
Slx1b ↻ ≫
Bola2 ↻ ≫
Mpv17l2 ↻ ≫
Arih2 ↻ ≫
Ccar1 ↻ ≫
Ilf2 ↻ ≫
Fasn ↻ ≫
Otud5 ↻ ≫
Lpar5 ↻ ≫
Zdhhc18 ↻ ≫
Hhip ↻ ≫
Letmd1 ↻ ≫
Nfe2l1 ↻ ≫
Ghdc ↻ ≫
Hnrnpab ↻ ≫
Cog6 ↻ ≫
Ciao2b ↻ ≫
Pibf1 ↻ ≫
Dis3 ↻ ≫
Zcchc24 ↻ ≫
Mib2 ↻ ≫
Abcb8 ↻ ≫
Icam1 ↻ ≫
Ap1b1 ↻ ≫
Pla2g15 ↻ ≫
Rnf5 ↻ ≫
Iqgap3 ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Vars ↻ ≫
D17H6S56E-5 ↻ ≫
Cnot2 ↻ ≫
Sugt1 ↻ ≫
Zyg11a ↻ ≫
Tomm5 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Cyb5r4 ↻ ≫
St3gal3 ↻ ≫
B230307C23Rik ↻ ≫
Slc25a20 ↻ ≫
Sec24c ↻ ≫
Fbxo31 ↻ ≫
Atp5e ↻ ≫
Taf6l ↻ ≫
Dok4 ↻ ≫
Tle6 ↻ ≫
Nelfcd ↻ ≫
Adgrg5 ↻ ≫
Hoxa5 ↻ ≫
Il33 ↻ ≫
Xkr5 ↻ ≫
Foxr2 ↻ ≫
Tbc1d22a ↻ ≫
Ttpal ↻ ≫
Ubr7 ↻ ≫
Dhcr24 ↻ ≫
Atg10 ↻ ≫
Stard6 ↻ ≫
4930503L19Rik ↻ ≫
Pbx2 ↻ ≫
Pigt ↻ ≫
Rnf125 ↻ ≫
Dleu7 ↻ ≫
Smarca5 ↻ ≫
Tmem259 ↻ ≫
Ptpmt1 ↻ ≫
Dennd6a ↻ ≫
Dag1 ↻ ≫
Cacnb3 ↻ ≫
Dusp5 ↻ ≫
Gm48552 ↻ ≫
Hadh ↻ ≫
S100a16 ↻ ≫
Zfp710 ↻ ≫
Stra8 ↻ ≫
Adap1 ↻ ≫
Arl15 ↻ ≫
Krt222 ↻ ≫
Ldb1 ↻ ≫
Scd2 ↻ ≫
Gipc2 ↻ ≫
Pdcl3 ↻ ≫
Kbtbd7 ↻ ≫
Sirt3 ↻ ≫
Psmd13 ↻ ≫
Otud7b ↻ ≫
Slc35f2 ↻ ≫
Ogdh ↻ ≫
Tspan9 ↻ ≫
H3c11 ↻ ≫
Ndufs7 ↻ ≫
Pdk1 ↻ ≫
Dnajc22 ↻ ≫
Camk1d ↻ ≫
Itpka ↻ ≫
Ccnb1ip1 ↻ ≫
Mllt6 ↻ ≫
Atxn2 ↻ ≫
Ubxn8 ↻ ≫
Gpcpd1 ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Gm18905 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Stat4 ↻ ≫
BC028528 ↻ ≫
Atox1 ↻ ≫
Usp9x ↻ ≫
Rbpj ↻ ≫
Chd9 ↻ ≫
Cxcr3 ↻ ≫
Agtpbp1 ↻ ≫
Clpb ↻ ≫
Szt2 ↻ ≫
Med8 ↻ ≫
Abca1 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
A930018P22Rik ↻ ≫
Zfp438 ↻ ≫
Spa17 ↻ ≫
Siae ↻ ≫
Trim7 ↻ ≫
Pym1 ↻ ≫
Pam16 ↻ ≫
Ube2f ↻ ≫
Lman1 ↻ ≫
Zfp395 ↻ ≫
Zfp53 ↻ ≫
Tma7 ↻ ≫
Ccdc51 ↻ ≫
Fam169a ↻ ≫
Mrpl16 ↻ ≫
Upp1 ↻ ≫
2410137M14Rik ↻ ≫
Srebf1 ↻ ≫
Ubac2 ↻ ≫
Rfc4 ↻ ≫
Myrip ↻ ≫
Tirap ↻ ≫
Sco2 ↻ ≫
Trpm3 ↻ ≫
H4c8 ↻ ≫
Trim29 ↻ ≫
Pcmtd1 ↻ ≫
Rec8 ↻ ≫
Zfp770 ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Dnajc19 ↻ ≫
Caap1 ↻ ≫
Uckl1 ↻ ≫
Mpc1 ↻ ≫
Zkscan6 ↻ ≫
Gpr180 ↻ ≫
Raf1 ↻ ≫
Slc25a1 ↻ ≫
Kremen1 ↻ ≫
Lrp10 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Mrps36 ↻ ≫
Tti1 ↻ ≫
Rprd1b ↻ ≫
Cep43 ↻ ≫
Erf ↻ ≫
Abca3 ↻ ≫
Abca17 ↻ ≫
Ankrd9 ↻ ≫
Ltbp4 ↻ ≫
Uqcrc1 ↻ ≫
Plpp2 ↻ ≫
Ctnna3 ↻ ≫
Ccdc66 ↻ ≫
Cfap161 ↻ ≫
Efna1 ↻ ≫
Cops6 ↻ ≫
Dhdh ↻ ≫
Fbln1 ↻ ≫
Prrt3 ↻ ≫
Urgcp ↻ ≫
Cpt1a ↻ ≫
Unc50 ↻ ≫
Coa5 ↻ ≫
Prmt8 ↻ ≫
Susd2 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Hic1 ↻ ≫
Ilrun ↻ ≫
Dnajc27 ↻ ≫
Sipa1 ↻ ≫
Slc2a3 ↻ ≫
H2-Q2 ↻ ≫
Atp2a2 ↻ ≫
Mdh1b ↻ ≫
Fastkd2 ↻ ≫
Tmem222 ↻ ≫
Slc16a13 ↻ ≫
Slc35d1 ↻ ≫
Rxrg ↻ ≫
Pank3 ↻ ≫
Mrpl45 ↻ ≫
Ilvbl ↻ ≫
Wdr25 ↻ ≫
Wars ↻ ≫
Luzp1 ↻ ≫
Gmnn ↻ ≫
Csnk1a1 ↻ ≫
Etfdh ↻ ≫
4930579G24Rik ↻ ≫
Cst3 ↻ ≫
Iffo1 ↻ ≫
Ndufa2 ↻ ≫
Ik ↻ ≫
Rasl10b ↻ ≫
Grpel1 ↻ ≫
Mecom ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Trp53inp2 ↻ ≫
Fbxl3 ↻ ≫
Scd1 ↻ ≫
Crybg2 ↻ ≫
Shoc2 ↻ ≫
Bbip1 ↻ ≫
Agbl5 ↻ ≫
Ino80c ↻ ≫
Nsa2 ↻ ≫
Gfm2 ↻ ≫
Cdk17 ↻ ≫
Mrps15 ↻ ≫
Wdr82 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
2610528J11Rik ↻ ≫
Sspn ↻ ≫
Zfp513 ↻ ≫
Trip12 ↻ ≫
Fbxo36 ↻ ≫
Lyst ↻ ≫
Esr2 ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Tagap1 ↻ ≫
Tfap2c ↻ ≫
Pfn1 ↻ ≫
Nectin2 ↻ ≫
Mbtd1 ↻ ≫
Decr1 ↻ ≫
Mettl27 ↻ ≫
Wdr7 ↻ ≫
Lims1 ↻ ≫
Pspc1 ↻ ≫
Rara ↻ ≫
Reep3 ↻ ≫
Ccdc71 ↻ ≫
Car3 ↻ ≫
Pou5f1 ↻ ≫
Csnk1g2 ↻ ≫
Cep70 ↻ ≫
Phyhd1 ↻ ≫
Tafa4 ↻ ≫
Atp6ap1l ↻ ≫
Hikeshi ↻ ≫
Rpl30 ↻ ≫
Rgs3 ↻ ≫
Rbm47 ↻ ≫
Slc39a14 ↻ ≫
Zfp383 ↻ ≫
Wdr26 ↻ ≫
Tab1 ↻ ≫
Anapc5 ↻ ≫
Uba2 ↻ ≫
Midn ↻ ≫
Dennd10 ↻ ≫
BC048679 ↻ ≫
Lsm11 ↻ ≫
Ndufs1 ↻ ≫
Eef1b2 ↻ ≫
Ints5 ↻ ≫
Rps24 ↻ ≫
Ppdpf ↻ ≫
Hexb ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Itga9 ↻ ≫
Fundc1 ↻ ≫
Cryzl2 ↻ ≫
H2-Q10 ↻ ≫
Tmem39a ↻ ≫
Mbd2 ↻ ≫
Naa35 ↻ ≫
Smarcd2 ↻ ≫
Mbd6 ↻ ≫
Akap1 ↻ ≫
Rad51 ↻ ≫
Nudt16 ↻ ≫
Gpi1 ↻ ≫
Aars ↻ ≫
Rpe ↻ ≫
Agfg2 ↻ ≫
Rsph4a ↻ ≫
Robo4 ↻ ≫
Slc25a39 ↻ ≫
Pcca ↻ ≫
Gjc1 ↻ ≫
Nudt1 ↻ ≫
As3mt ↻ ≫
Mrm2 ↻ ≫
Yars ↻ ≫
S100pbp ↻ ≫
Nqo2 ↻ ≫
Vcl ↻ ≫
Traf3 ↻ ≫
Ccr4 ↻ ≫
Mapk8 ↻ ≫
Naca ↻ ≫
Knl1 ↻ ≫
Ogfod2 ↻ ≫
Gspt2 ↻ ≫
Snx29 ↻ ≫
Chd1l ↻ ≫
Snx15 ↻ ≫
Acad12 ↻ ≫
Tasp1 ↻ ≫
Fignl1 ↻ ≫
Anapc10 ↻ ≫
Abce1 ↻ ≫
Colca2 ↻ ≫
Wdr77 ↻ ≫
Atp5pb ↻ ≫
Mrpl40 ↻ ≫
Hira ↻ ≫
Pabpc1 ↻ ≫
Ube2g1 ↻ ≫
Eif2s3y ↻ ≫
Myadml2 ↻ ≫
Tpcn1 ↻ ≫
Iqcd ↻ ≫
Cdkn2aip ↻ ≫
Sacm1l ↻ ≫
Fbxl15 ↻ ≫
Fam122b ↻ ≫
Trmt10c ↻ ≫
Kif2c ↻ ≫
Use1 ↻ ≫
Dnajc4 ↻ ≫
Churc1 ↻ ≫
Macroh2a1 ↻ ≫
Cln5 ↻ ≫
Srp54a ↻ ≫
Gna12 ↻ ≫
Rps3 ↻ ≫
Trp53bp1 ↻ ≫
Sdhaf1 ↻ ≫
Pcnx4 ↻ ≫
Ddx56 ↻ ≫
Nags ↻ ≫
Ccl20 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Cbx1 ↻ ≫
Hspa5 ↻ ≫
Ptcd3 ↻ ≫
Polr1a ↻ ≫
Zfp768 ↻ ≫
Rrnad1 ↻ ≫
Isg20l2 ↻ ≫
Fam98c ↻ ≫
Sat1 ↻ ≫
Klhl22 ↻ ≫
Hectd1 ↻ ≫
Fads1 ↻ ≫
Hint1 ↻ ≫
Cilp2 ↻ ≫
Sox8 ↻ ≫
Mrpl1 ↻ ≫
Sf3b3 ↻ ≫
Cog4 ↻ ≫
Rhox11 ↻ ≫
Nup153 ↻ ≫
Supt16 ↻ ≫
Tent2 ↻ ≫
Xkr8 ↻ ≫
Sinhcaf ↻ ≫
Lsm8 ↻ ≫
Cdk5rap1 ↻ ≫
Zfp33b ↻ ≫
Dtx4 ↻ ≫
Pes1 ↻ ≫
Racgap1 ↻ ≫
Ryr2 ↻ ≫
Ccdc83 ↻ ≫
Chic2 ↻ ≫
Dnaja3 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Map1lc3b ↻ ≫
Rasl11a ↻ ≫
Mrpl4 ↻ ≫
Rom1 ↻ ≫
Eml3 ↻ ≫
Hectd2 ↻ ≫
Rps3a1 ↻ ≫
Rrp15 ↻ ≫
Foxn4 ↻ ≫
Ptf1a ↻ ≫
Lsm4 ↻ ≫
Fgd4 ↻ ≫
Shb ↻ ≫
Ergic2 ↻ ≫
Tmc8 ↻ ≫
Tmem143 ↻ ≫
Syngr4 ↻ ≫
Smad6 ↻ ≫
3300002I08Rik ↻ ≫
Mcph1 ↻ ≫
Prelid3b ↻ ≫
Tsc22d2 ↻ ≫
Vcan ↻ ≫
Pus7l ↻ ≫
Irak4 ↻ ≫
Pgpep1 ↻ ≫
H2-Q1 ↻ ≫
Srp54c ↻ ≫
Srp54b ↻ ≫
Uqcrb ↻ ≫
Gm10767 ↻ ≫
Mif ↻ ≫
Zfp532 ↻ ≫
Pdp2 ↻ ≫
Ctsl ↻ ≫
Flywch2 ↻ ≫
Kcnj16 ↻ ≫
Mrpl37 ↻ ≫
Cyb5rl ↻ ≫
Gm8439 ↻ ≫
Cyc1 ↻ ≫
Zfp551 ↻ ≫
Zfp946 ↻ ≫
Smim20 ↻ ≫
Ifna6 ↻ ≫
Lgi2 ↻ ≫
Calu ↻ ≫
Tube1 ↻ ≫
Fam229b ↻ ≫
Elovl6 ↻ ≫
1700016H13Rik ↻ ≫
Tlr5 ↻ ≫
Nr0b1 ↻ ≫
Ap5s1 ↻ ≫
Tbc1d17 ↻ ≫
Akt1s1 ↻ ≫
Wdfy1 ↻ ≫
Mynn ↻ ≫
B3galnt2 ↻ ≫
Exoc4 ↻ ≫
Spry4 ↻ ≫
Fam166c ↻ ≫
Mill1 ↻ ≫
Atf1 ↻ ≫
B4galnt1 ↻ ≫
Otp ↻ ≫
Plekhg5 ↻ ≫
Mrps30 ↻ ≫
Madd ↻ ≫
Zranb3 ↻ ≫
R3hdm1 ↻ ≫
Cnpy1 ↻ ≫
H2-M5 ↻ ≫
Idh3b ↻ ≫
Krt79 ↻ ≫
Slc4a7 ↻ ≫
Ndufb6 ↻ ≫
Haus4 ↻ ≫
Rasgef1a ↻ ≫
Vmac ↻ ≫
Ndufa11 ↻ ≫
Zfp319 ↻ ≫
Usb1 ↻ ≫
Casd1 ↻ ≫
Lekr1 ↻ ≫
Nploc4 ↻ ≫
Rita1 ↻ ≫
Mid1ip1 ↻ ≫
Rad9a ↻ ≫
Hax1 ↻ ≫
Spdya ↻ ≫
Capn3 ↻ ≫
Cacna2d3 ↻ ≫
Sema4d ↻ ≫
Gtf3c4 ↻ ≫
Ddx31 ↻ ≫
Rnase4 ↻ ≫
Ang ↻ ≫
Vwa8 ↻ ≫
Amacr ↻ ≫
Akap11 ↻ ≫
Ap1g2 ↻ ≫
Tm9sf2 ↻ ≫
Fjx1 ↻ ≫
Got2 ↻ ≫
Setx ↻ ≫
Cdkn2d ↻ ≫
Srek1 ↻ ≫
Calcoco2 ↻ ≫
Zbtb40 ↻ ≫
Atxn1l ↻ ≫
Pde7a ↻ ≫
Upf2 ↻ ≫
Sulf2 ↻ ≫
Pex11g ↻ ≫
Armh3 ↻ ≫
Gm45915 ↻ ≫
Rdx ↻ ≫
Tacr2 ↻ ≫
Cd164 ↻ ≫
Sumf1 ↻ ≫
Cisd3 ↻ ≫
Cttnbp2nl ↻ ≫
Etv3l ↻ ≫
Ptgr2 ↻ ≫
Daam1 ↻ ≫
Osbpl1a ↻ ≫
Adcy6 ↻ ≫
Asap3 ↻ ≫
Gm3500 ↻ ≫
Gm3005 ↻ ≫
Nsun4 ↻ ≫
Stim1 ↻ ≫
Dph5 ↻ ≫
Ppp1r16a ↻ ≫
Gm45871 ↻ ≫
Nup35 ↻ ≫
Acaa2 ↻ ≫
Gm5784 ↻ ≫
Tcea3 ↻ ≫
Dcaf11 ↻ ≫
Sgsm2 ↻ ≫
Tsr1 ↻ ≫
Ncln ↻ ≫
Trmt2a ↻ ≫
Ranbp1 ↻ ≫
Kdelr1 ↻ ≫
Cep135 ↻ ≫
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