ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for Clock

Query protein: Clock
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX4416892 | Liver
 
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  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Target Genes
Clock's Target genes

◢ Clock: Average

◢ SRX1098141: Beta-TC-6

◢ DRX011942: Liver

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◢ Clock: STRING
Nr1d1 ↻ ≫
Nr1d2 ↻ ≫
Per2 ↻ ≫
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Jade1 ↻ ≫
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Tbcel ↻ ≫
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Dctpp1 ↻ ≫
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Gpi1 ↻ ≫
1810013L24Rik ↻ ≫
Bnip3 ↻ ≫
Cry2 ↻ ≫
Gnpnat1 ↻ ≫
Ell3 ↻ ≫
Serinc4 ↻ ≫
Serf2 ↻ ≫
Hypk ↻ ≫
Bhlhe40 ↻ ≫
Upp2 ↻ ≫
Avpi1 ↻ ≫
Igsf8 ↻ ≫
Ube2q1 ↻ ≫
Chrnb2 ↻ ≫
Rnf145 ↻ ≫
Adh5 ↻ ≫
Txndc11 ↻ ≫
Khdrbs1 ↻ ≫
Mapk6 ↻ ≫
Mcidas ↻ ≫
Ccno ↻ ≫
Slc27a2 ↻ ≫
Lcorl ↻ ≫
Sertad2 ↻ ≫
Nptn ↻ ≫
Hmgn2 ↻ ≫
Gys2 ↻ ≫
Fbxo30 ↻ ≫
Ankrd12 ↻ ≫
Etnk2 ↻ ≫
Sumo2 ↻ ≫
Mknk2 ↻ ≫
Chpf2 ↻ ≫
Abcf2 ↻ ≫
Slc35a5 ↻ ≫
Atg3 ↻ ≫
Gpr146 ↻ ≫
Zswim7 ↻ ≫
Ttc19 ↻ ≫
Mthfd1l ↻ ≫
Rint1 ↻ ≫
Pus7 ↻ ≫
Ntpcr ↻ ≫
Hlf ↻ ≫
Nfix ↻ ≫
Fosl1 ↻ ≫
Fibp ↻ ≫
Ccdc85b ↻ ≫
Pard6b ↻ ≫
Dis3l2 ↻ ≫
Rapgef1 ↻ ≫
Ppp1r3c ↻ ≫
Prdx2 ↻ ≫
Junb ↻ ≫
Trim37 ↻ ≫
Dcun1d4 ↻ ≫
Fam76a ↻ ≫
Cnn3 ↻ ≫
Plekha6 ↻ ≫
Rorc ↻ ≫
C2cd4d ↻ ≫
Zfp292 ↻ ≫
Sipa1l2 ↻ ≫
Klf15 ↻ ≫
Tns2 ↻ ≫
2900026A02Rik ↻ ≫
Agmat ↻ ≫
Hes1 ↻ ≫
Fnip1 ↻ ≫
Kdm6b ↻ ≫
Taf1c ↻ ≫
Adad2 ↻ ≫
Hif1a ↻ ≫
E030030I06Rik ↻ ≫
Phospho1 ↻ ≫
Klf11 ↻ ≫
Sde2 ↻ ≫
Tulp4 ↻ ≫
Shkbp1 ↻ ≫
Bri3 ↻ ≫
Ttc39b ↻ ≫
Aven ↻ ≫
Sox12 ↻ ≫
Ilf3 ↻ ≫
Lamp1 ↻ ≫
Ccdc88c ↻ ≫
Atp6ap1l ↻ ≫
Pip4p1 ↻ ≫
Osgep ↻ ≫
Apex1 ↻ ≫
Atl3 ↻ ≫
Ccne2 ↻ ≫
Thrsp ↻ ≫
Ddx50 ↻ ≫
Ubald1 ↻ ≫
Mgrn1 ↻ ≫
Mapk8 ↻ ≫
Cyp2u1 ↻ ≫
Tspan4 ↻ ≫
Polr2l ↻ ≫
Cd151 ↻ ≫
Mtor ↻ ≫
Smim17 ↻ ≫
Supv3l1 ↻ ≫
Rpp38 ↻ ≫
Acbd7 ↻ ≫
St6gal1 ↻ ≫
Zfp131 ↻ ≫
Foxo3 ↻ ≫
Dgat2 ↻ ≫
Tmem222 ↻ ≫
Slc38a3 ↻ ≫
Gnat1 ↻ ≫
Ppp1r3e ↻ ≫
Bcl2l2 ↻ ≫
Smim14 ↻ ≫
Qk ↻ ≫
Ttc21a ↻ ≫
Gorasp1 ↻ ≫
Eef2k ↻ ≫
Slc20a1 ↻ ≫
Lrp4 ↻ ≫
Ptma ↻ ≫
Pten ↻ ≫
Pim3 ↻ ≫
Serpina16 ↻ ≫
Sorbs3 ↻ ≫
Acsl1 ↻ ≫
Pla2g6 ↻ ≫
Trpm7 ↻ ≫
Eif3a ↻ ≫
Osbpl2 ↻ ≫
Mnt ↻ ≫
Syngap1 ↻ ≫
Phf1 ↻ ≫
Cuta ↻ ≫
Hs6st1 ↻ ≫
Utp11 ↻ ≫
Fhl3 ↻ ≫
Tmem63a ↻ ≫
Lefty1 ↻ ≫
Snai3 ↻ ≫
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Gmfb ↻ ≫
Cgrrf1 ↻ ≫
Cps1 ↻ ≫
Usp28 ↻ ≫
Xntrpc ↻ ≫
Xndc1 ↻ ≫
Rnf121 ↻ ≫
Pms2 ↻ ≫
Aimp2 ↻ ≫
Nfe2 ↻ ≫
Sertad1 ↻ ≫
Cops7a ↻ ≫
Albfm1 ↻ ≫
Tha1 ↻ ≫
Hnf4a ↻ ≫
Hdac11 ↻ ≫
Ptgfr ↻ ≫
L3hypdh ↻ ≫
Jkamp ↻ ≫
Gpt2 ↻ ≫
Pabpc4 ↻ ≫
Ppia ↻ ≫
Ptp4a2 ↻ ≫
Vps13a ↻ ≫
Inmt ↻ ≫
Selenbp1 ↻ ≫
Reep6 ↻ ≫
Pcsk4 ↻ ≫
2310011J03Rik ↻ ≫
AW549877 ↻ ≫
Pdxk ↻ ≫
Cfh ↻ ≫
Mex3d ↻ ≫
Smdt1 ↻ ≫
Ndufa6 ↻ ≫
Cdyl ↻ ≫
Eva1a ↻ ≫
Prr18 ↻ ≫
Uba7 ↻ ≫
Mical3 ↻ ≫
Rnaseh2b ↻ ≫
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Yaf2 ↻ ≫
Cyp17a1 ↻ ≫
Cyth1 ↻ ≫
Insig1 ↻ ≫
Mphosph9 ↻ ≫
2810006K23Rik ↻ ≫
Lonrf1 ↻ ≫
Uox ↻ ≫
Pcbp1 ↻ ≫
Pdcd4 ↻ ≫
Arid3a ↻ ≫
Pgm2l1 ↻ ≫
Osbpl5 ↻ ≫
Mrgprg ↻ ≫
Map7 ↻ ≫
Nt5c2 ↻ ≫
Ttc7 ↻ ≫
Gstt2 ↻ ≫
Naa80 ↻ ≫
Hyal3 ↻ ≫
Lsmem2 ↻ ≫
Ifrd2 ↻ ≫
Ankrd24 ↻ ≫
Gm10778 ↻ ≫
Txndc16 ↻ ≫
Gpr137c ↻ ≫
Xrcc1 ↻ ≫
Pinlyp ↻ ≫
Marchf8 ↻ ≫
Actg1 ↻ ≫
Prpf3 ↻ ≫
Mrps21 ↻ ≫
Casc3 ↻ ≫
Ski ↻ ≫
Lrp3 ↻ ≫
Padi1 ↻ ≫
Prrg4 ↻ ≫
Serpine1 ↻ ≫
Atxn3 ↻ ≫
Gga2 ↻ ≫
Slc30a1 ↻ ≫
Zfp526 ↻ ≫
Dedd2 ↻ ≫
Pbld2 ↻ ≫
Hnrnph3 ↻ ≫
Akr1d1 ↻ ≫
Nup62 ↻ ≫
Il4i1b ↻ ≫
Atf5 ↻ ≫
Mllt1 ↻ ≫
Wee1 ↻ ≫
Sra1 ↻ ≫
Slc35a4 ↻ ≫
Apbb3 ↻ ≫
Rybp ↻ ≫
Prr3 ↻ ≫
Abcf1 ↻ ≫
Gnl1 ↻ ≫
Yif1b ↻ ≫
Kcnk6 ↻ ≫
2200002D01Rik ↻ ≫
Slc16a7 ↻ ≫
Usp2 ↻ ≫
Nfe2l2 ↻ ≫
Fam214b ↻ ≫
Mrpl48 ↻ ≫
Snx8 ↻ ≫
Srd5a2 ↻ ≫
Usp36 ↻ ≫
Lss ↻ ≫
Cpeb1 ↻ ≫
Hmgcl ↻ ≫
Gale ↻ ≫
Gpatch3 ↻ ≫
Polr2h ↻ ≫
Clcn2 ↻ ≫
Lrp1 ↻ ≫
Rps28 ↻ ≫
Ndufa7 ↻ ≫
Kank3 ↻ ≫
Trappc10 ↻ ≫
Rev1 ↻ ≫
Fbxw4 ↻ ≫
Rnf13 ↻ ≫
Esrra ↻ ≫
Catsperz ↻ ≫
Tada2a ↻ ≫
Car5a ↻ ≫
Banp ↻ ≫
Ngef ↻ ≫
Neu2 ↻ ≫
Gm3448 ↻ ≫
Gm3417 ↻ ≫
Tcte3 ↻ ≫
Gm3435 ↻ ≫
Shmt1 ↻ ≫
Gpr84 ↻ ≫
Zfp775 ↻ ≫
Repin1 ↻ ≫
Gm5111 ↻ ≫
Marveld1 ↻ ≫
Hsdl1 ↻ ≫
Dnaaf1 ↻ ≫
Hmga1b ↻ ≫
Hmga1 ↻ ≫
Pnrc1 ↻ ≫
Hhipl1 ↻ ≫
Mesp2 ↻ ≫
Hpf1 ↻ ≫
Slc13a2 ↻ ≫
Ado ↻ ≫
Adora1 ↻ ≫
Nampt ↻ ≫
Phf23 ↻ ≫
Gabarap ↻ ≫
Dvl2 ↻ ≫
Lekr1 ↻ ≫
Trib1 ↻ ≫
Cyp2a5 ↻ ≫
Napa ↻ ≫
Hjurp ↻ ≫
A730008H23Rik ↻ ≫
Tspan31 ↻ ≫
Marchf9 ↻ ≫
Cdk4 ↻ ≫
Zfp358 ↻ ≫
Mcoln1 ↻ ≫
Golga5 ↻ ≫
Plag1 ↻ ≫
Epha1 ↻ ≫
Ermard ↻ ≫
Ldlrad3 ↻ ≫
Luc7l2 ↻ ≫
Rsad1 ↻ ≫
Slc35g1 ↻ ≫
Mfsd4b4 ↻ ≫
Setd4 ↻ ≫
Cbr1 ↻ ≫
Senp3 ↻ ≫
Eif4a1 ↻ ≫
Tnfsf13 ↻ ≫
Macrod1 ↻ ≫
Odc1 ↻ ≫
Nup210 ↻ ≫
Dda1 ↻ ≫
Ano8 ↻ ≫
Slc6a9 ↻ ≫
Nfil3 ↻ ≫
Slc26a2 ↻ ≫
Pde6a ↻ ≫
Arrdc1 ↻ ≫
Pigw ↻ ≫
Myo19 ↻ ≫
Ggnbp2 ↻ ≫
Hey1 ↻ ≫
Susd6 ↻ ≫
Slc38a4 ↻ ≫
Por ↻ ≫
Arl4a ↻ ≫
Pdk1 ↻ ≫
Cep295 ↻ ≫
Ahcy ↻ ≫
9030025P20Rik ↻ ≫
Atf7 ↻ ≫
Rasl11b ↻ ≫
Map11 ↻ ≫
Lamtor4 ↻ ≫
Ccdc141 ↻ ≫
Mcmdc2 ↻ ≫
Rps6ka4 ↻ ≫
Bahcc1 ↻ ≫
Ppm1l ↻ ≫
Rrp9 ↻ ≫
Parp3 ↻ ≫
Ak4 ↻ ≫
Tesmin ↻ ≫
Zfp91 ↻ ≫
Lpxn ↻ ≫
Rbm4b ↻ ≫
Ubtd1 ↻ ≫
Mms19 ↻ ≫
Fzd5 ↻ ≫
Vdac1 ↻ ≫
Ntsr2 ↻ ≫
Rmnd1 ↻ ≫
Armt1 ↻ ≫
Srm ↻ ≫
H2-DMa ↻ ≫
Brd2 ↻ ≫
Zfp872 ↻ ≫
Atf3 ↻ ≫
Gjb2 ↻ ≫
Zbtb7b ↻ ≫
Cp ↻ ≫
Anks3 ↻ ≫
4930451G09Rik ↻ ≫
Bmp2k ↻ ≫
Sesn1 ↻ ≫
Cep57l1 ↻ ≫
Cdk5r1 ↻ ≫
Zzz3 ↻ ≫
Ipo5 ↻ ≫
Ninj1 ↻ ≫
Stk35 ↻ ≫
Sox7 ↻ ≫
Ypel5 ↻ ≫
Anks4b ↻ ≫
Dapk1 ↻ ≫
Eps15l1 ↻ ≫
Urad ↻ ≫
Shfl ↻ ≫
Ppan ↻ ≫
Angptl6 ↻ ≫
Slc17a8 ↻ ≫
Pla2g12a ↻ ≫
Ndufaf4 ↻ ≫
Rcbtb1 ↻ ≫
Fkbp4 ↻ ≫
Dusp12 ↻ ≫
Hdgf ↻ ≫
Rtkn ↻ ≫
Ino80b ↻ ≫
Lrrc8d ↻ ≫
Aacs ↻ ≫
Tet3 ↻ ≫
Ralb ↻ ≫
Ywhag ↻ ≫
Serpina6 ↻ ≫
Ercc6 ↻ ≫
Tmem11 ↻ ≫
Tada1 ↻ ≫
Lrrc63 ↻ ≫
Lcp1 ↻ ≫
Rasd2 ↻ ≫
Sertad3 ↻ ≫
Ube2q2 ↻ ≫
Tctex1d4 ↻ ≫
Btbd19 ↻ ≫
Pfkl ↻ ≫
Pygl ↻ ≫
Atp9a ↻ ≫
Zkscan6 ↻ ≫
Igsf23 ↻ ≫
Ceacam20 ↻ ≫
2410002F23Rik ↻ ≫
Fam43a ↻ ≫
Ctdsp1 ↻ ≫
Coq8a ↻ ≫
Rbfox2 ↻ ≫
Fbxo3 ↻ ≫
4931422A03Rik ↻ ≫
Hsf1 ↻ ≫
Bop1 ↻ ≫
Bcat2 ↻ ≫
Cetn3 ↻ ≫
Zmym6 ↻ ≫
Tgfbr3l ↻ ≫
Map2k7 ↻ ≫
Azin1 ↻ ≫
Ppp1r15b ↻ ≫
Zfp36l2 ↻ ≫
Usp22 ↻ ≫
Slc41a1 ↻ ≫
Trim11 ↻ ≫
P2ry2 ↻ ≫
Mthfr ↻ ≫
Clcn6 ↻ ≫
Fech ↻ ≫
Pou2f1 ↻ ≫
Pacs1 ↻ ≫
Epop ↻ ≫
Lhpp ↻ ≫
Ctsd ↻ ≫
Rab44 ↻ ≫
Eif5a2 ↻ ≫
Elavl3 ↻ ≫
Dmxl2 ↻ ≫
Arsa ↻ ≫
Eif4g1 ↻ ≫
Nrg4 ↻ ≫
Slc29a1 ↻ ≫
Mymx ↻ ≫
Il1r1 ↻ ≫
C1qbp ↻ ≫
0610010F05Rik ↻ ≫
Sec24a ↻ ≫
Sar1b ↻ ≫
Stag1 ↻ ≫
Clk4 ↻ ≫
BC049762 ↻ ≫
Dnajc16 ↻ ≫
Casp9 ↻ ≫
Plin5 ↻ ≫
Lrg1 ↻ ≫
Plin4 ↻ ≫
Strbp ↻ ≫
Slc8b1 ↻ ≫
Plbd2 ↻ ≫
Atp6v0c ↻ ≫
Amdhd2 ↻ ≫
Selenot ↻ ≫
Arrb2 ↻ ≫
Rhebl1 ↻ ≫
Kmt2d ↻ ≫
Pdcd11 ↻ ≫
Atp5md ↻ ≫
Thap11 ↻ ≫
Nutf2 ↻ ≫
Cenpt ↻ ≫
Dlgap4 ↻ ≫
Adcy10 ↻ ≫
9330182O14Rik ↻ ≫
Kansl2 ↻ ≫
Aspg ↻ ≫
Engase ↻ ≫
Gtf3a ↻ ≫
Ctsl ↻ ≫
Tmem185b ↻ ≫
Pcx ↻ ≫
Rbbp6 ↻ ≫
Ubc ↻ ≫
Saal1 ↻ ≫
Saa3 ↻ ≫
Hinfp ↻ ≫
Smad2 ↻ ≫
Dazap1 ↻ ≫
Gamt ↻ ≫
Mcfd2 ↻ ≫
Ergic1 ↻ ≫
Ecsit ↻ ≫
Gas2 ↻ ≫
Fancf ↻ ≫
Meig1 ↻ ≫
Dclre1c ↻ ≫
Hexa ↻ ≫
Qdpr ↻ ≫
Clrn2 ↻ ≫
Amotl2 ↻ ≫
Slc7a2 ↻ ≫
Clmn ↻ ≫
Rnase10 ↻ ≫
Srsf4 ↻ ≫
Fam131c ↻ ≫
Ifrd1 ↻ ≫
Gne ↻ ≫
Wdsub1 ↻ ≫
Ldha ↻ ≫
Zbtb25 ↻ ≫
Zbtb1 ↻ ≫
Mgll ↻ ≫
Spag4 ↻ ≫
Vars ↻ ≫
D17H6S56E-5 ↻ ≫
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Tfeb ↻ ≫
Tbx10 ↻ ≫
Acy3 ↻ ≫
Bcar1 ↻ ≫
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Gnb1 ↻ ≫
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Ralgapa2 ↻ ≫
Pes1 ↻ ≫
Syde2 ↻ ≫
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Ppp1ccb ↻ ≫
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Egln2 ↻ ≫
Mia2 ↻ ≫
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Pfkfb3 ↻ ≫
Acsl5 ↻ ≫
Anxa7 ↻ ≫
Stard5 ↻ ≫
Pop7 ↻ ≫
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Kdm2a ↻ ≫
Ptpa ↻ ≫
Crat ↻ ≫
Slc38a9 ↻ ≫
Ddx4 ↻ ≫
Mocs2 ↻ ≫
Hnrnpf ↻ ≫
Synj2 ↻ ≫
Zbtb12 ↻ ≫
Ehmt2 ↻ ≫
Zmiz1 ↻ ≫
Mfsd3 ↻ ≫
Gpt ↻ ≫
Dbi ↻ ≫
3110009E18Rik ↻ ≫
Kng2 ↻ ≫
Efhd2 ↻ ≫
Slc6a6 ↻ ≫
Ece1 ↻ ≫
Myo1g ↻ ≫
Nr3c1 ↻ ≫
Slc2a9 ↻ ≫
Igfbp4 ↻ ≫
Unc5d ↻ ≫
Syne3 ↻ ≫
Dusp7 ↻ ≫
Sgk1 ↻ ≫
Xpot ↻ ≫
Mpdu1 ↻ ≫
Iba57 ↻ ≫
Trmo ↻ ≫
Ces1e ↻ ≫
Ppat ↻ ≫
Paics ↻ ≫
Hcfc2 ↻ ≫
Glt8d2 ↻ ≫
Ankrd9 ↻ ≫
Susd1 ↻ ≫
Cc2d1b ↻ ≫
Lima1 ↻ ≫
Hspa9 ↻ ≫
Zcwpw1 ↻ ≫
Ppp1r35 ↻ ≫
Mepce ↻ ≫
Pdia3 ↻ ≫
Catsper2 ↻ ≫
Adi1 ↻ ≫
Bsg ↻ ≫
Arhgef16 ↻ ≫
Gm5724 ↻ ≫
Ogfrl1 ↻ ≫
Mbnl1 ↻ ≫
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Mars2 ↻ ≫
Sema3b ↻ ≫
Zbtb17 ↻ ≫
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Clcn7 ↻ ≫
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Cobll1 ↻ ≫
Cnnm2 ↻ ≫
Fam241a ↻ ≫
Hilpda ↻ ≫
Fam71f2 ↻ ≫
Nmnat3 ↻ ≫
Rnf130 ↻ ≫
Hook1 ↻ ≫
Scaf11 ↻ ≫
Hacd3 ↻ ≫
Usp4 ↻ ≫
Gpx1 ↻ ≫
Ppl ↻ ≫
1110017D15Rik ↻ ≫
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F10 ↻ ≫
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Hoga1 ↻ ≫
Ankrd2 ↻ ≫
4933411K16Rik ↻ ≫
Slc15a4 ↻ ≫
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Phf20 ↻ ≫
Comt ↻ ≫
Arhgap42 ↻ ≫
Slc5a6 ↻ ≫
Cad ↻ ≫
Atraid ↻ ≫
Bmf ↻ ≫
Zfp36 ↻ ≫
Top1mt ↻ ≫
Med29 ↻ ≫
Paf1 ↻ ≫
Cyp26a1 ↻ ≫
Papss2 ↻ ≫
Acat1 ↻ ≫
Rnaseh2a ↻ ≫
Map4k1 ↻ ≫
Eif3k ↻ ≫
Ppm1a ↻ ≫
Cblc ↻ ≫
Rara ↻ ≫
Gprc5c ↻ ≫
Czib ↻ ≫
Gid4 ↻ ≫
U2surp ↻ ≫
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Clpb ↻ ≫
Ddx59 ↻ ≫
Maco1 ↻ ≫
D10Wsu102e ↻ ≫
Fntb ↻ ≫
Ccdc9 ↻ ≫
Lamc1 ↻ ≫
Pipox ↻ ≫
Shox2 ↻ ≫
Tmem212 ↻ ≫
Usp53 ↻ ≫
1700102P08Rik ↻ ≫
Usp42 ↻ ≫
Zfyve9 ↻ ≫
Stxbp3 ↻ ≫
Adipor2 ↻ ≫
Dpagt1 ↻ ≫
C2cd2l ↻ ≫
Larp1 ↻ ≫
Gm11634 ↻ ≫
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