ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for Srf

Query protein: Srf
Cell class: Cardiovascular
Sort key: SRX3591810 | Heart Ventricles
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs Srf's Colocalization partners

◢ Srf: Average

◢ SRX3591805: Heart Ventricles

◢ SRX3591806: Heart Ventricles

◢ SRX3591809: Heart Ventricles

◣ SRX3591810: Heart Ventricles

◢ SRX018659: HL-1

◢ SRX3855845: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855853: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855854: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855867: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855868: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855875: Vascular smooth muscle cells

◢ SRX3855876: Vascular smooth muscle cells

◢ Srf: STRING
Heart Ventricles
  SRX3591810
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855875
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855867
Srf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3591809
Srf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3591805
Srf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3591806
Srf
 ↻ ≫
Heart
  SRX6714137
Nelfa
 ↻ ≫
Heart
  SRX6714136
Nelfa
 ↻ ≫
Heart
  SRX517512
Gtf2b
 ↻ ≫
Heart
  SRX4159426
Yap1
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3015434
Tbx5
 ↻ ≫
Heart
  SRX517513
Gtf2b
 ↻ ≫
Heart
  SRX517511
Gtf2b
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3845133
Tbx5
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855876
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855868
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855853
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855854
Srf
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855845
Srf
 ↻ ≫
Heart
  SRX143848
Ctcf
 ↻ ≫
Heart
  SRX143839
Ep300
 ↻ ≫
Heart
  SRX062957
Ep300
 ↻ ≫
Heart
  SRX062954
Ctcf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2645975
Ctcf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2645977
Ctcf
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX3845130
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX116273
Nkx2-5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846347
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846346
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846345
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846344
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846335
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846334
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846333
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846332
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846331
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846330
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX373595
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX373594
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX373579
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX373578
Gata4
 ↻ ≫
Heart
  SRX116272
Gata4
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846350
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846349
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846348
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846339
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846338
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846337
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846336
Mef2c
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2922948
Mef2a
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2922947
Mef2a
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2922946
Mef2a
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2922945
Mef2a
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497459
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497458
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497450
Mef2c
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497449
Mef2c
 ↻ ≫
Heart
  SRX7586625
Foxo1
 ↻ ≫
Heart
  SRX7586624
Foxo1
 ↻ ≫
Heart
  SRX7586623
Foxo1
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299491
Hoxb13
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299490
Hoxb13
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299489
Hoxb13
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299485
Meis1
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299484
Meis1
 ↻ ≫
Heart
  SRX7299483
Meis1
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX6821119
Lin9
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846353
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846352
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846351
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846343
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846342
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846341
Tbx5
 ↻ ≫
Cardiac fibroblast
  SRX5846340
Tbx5
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796028
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796027
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796026
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796025
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796024
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796023
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796022
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796021
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796020
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796019
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796018
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796017
Stat1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796016
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796015
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796014
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796013
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796012
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796011
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796010
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796009
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796008
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796007
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796006
Rela
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4796005
Rela
 ↻ ≫
Brain pericytes
  SRX4740105
Rbpj
 ↻ ≫
Brain pericytes
  SRX4740104
Rbpj
 ↻ ≫
Lung endothelial cells
  SRX4615044
Nr3c1
 ↻ ≫
Lung endothelial cells
  SRX4615043
Nr3c1
 ↻ ≫
Lung endothelial cells
  SRX4615042
Nr3c1
 ↻ ≫
Lung endothelial cells
  SRX4615041
Nr3c1
 ↻ ≫
Lung endothelial cells
  SRX4615040
Nr3c1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX4373761
Thoc5
 ↻ ≫
Heart
  SRX4159427
Yap1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855880
Med1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855879
Smad3
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855878
Med1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855877
Smad3
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855872
Med1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855871
Smad3
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855870
Med1
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855869
Smad3
 ↻ ≫
Vascular smooth muscle cells
  SRX3855846
Med1
 ↻ ≫
Aorta
  SRX377390
Esr1
 ↻ ≫
Aorta
  SRX377389
Esr1
 ↻ ≫
Heart
  SRX3699475
Arntl
 ↻ ≫
Heart
  SRX3699473
Arntl
 ↻ ≫
Heart
  SRX3699471
Arntl
 ↻ ≫
Heart
  SRX3257469
Anp32e
 ↻ ≫
Heart
  SRX3257468
Anp32e
 ↻ ≫
Heart
  SRX275457
Brd4
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2741876
Lmnb1
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2741875
Lmnb1
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2734782
Tcf7l2
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2734777
Tcf7l2
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2734776
Tcf7l2
 ↻ ≫
Heart
  SRX2734478
Ezh1
 ↻ ≫
Heart
  SRX2734477
Ezh1
 ↻ ≫
Heart
  SRX2734476
Ezh1
 ↻ ≫
Heart
  SRX2734475
Ezh1
 ↻ ≫
Heart Atria
  SRX272831
Nr2f2
 ↻ ≫
Heart Atria
  SRX272830
Nr2f2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2499670
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2499669
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2499661
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2499660
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497453
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497452
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497444
Ehmt2
 ↻ ≫
Cardiomyocytes
  SRX2497443
Ehmt2
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2162110
Hdac2
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2162109
Hdac2
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2162094
Eed
 ↻ ≫
Heart Ventricles
  SRX2162093
Eed
 ↻ ≫
Heart
  SRX1495352
Smarca4
 ↻ ≫
Heart
  SRX1495351
Smarca4
 ↻ ≫
Heart
  SRX1495350
Smarca4
 ↻ ≫
Heart
  SRX1495349
Smarca4
 ↻ ≫
Heart
  SRX1304810
Nr1d1
 ↻ ≫
Heart
  SRX1304809
Nr1d1
 ↻ ≫
Atrioventicular canals
  SRX1271841
Sox9
 ↻ ≫
Heart
  SRX116271
Tbx3
 ↻ ≫
Heart
  SRX116270
Tbx3
 ↻ ≫
Sinoatrial Node
  SRX1030299
Isl1
 ↻ ≫
Heart
  SRX099631
Ep300
 ↻ ≫
HL-1
  SRX055315
Jarid2
 ↻ ≫
HL-1
  SRX055314
Rbp2
 ↻ ≫
HL-1
  SRX022484
Ep300
 ↻ ≫
HL-1
  SRX018659
Srf
 ↻ ≫