ChIP-Atlas: Target genes

Potential target genes for CBX3

Query protein: CBX3
Distance from TSS: ± 1 kb  ± 5 kb  ± 10 kb
Sort key: SRX190214 | HCT 116
 
Color legends
  1000 750 500 250 1 0  (Values = Binding scores of MACS2 and STRING)

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CBX3's Target genes

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◢ SRX055346: HCT 116

◢ SRX055348: HCT 116

◢ SRX055353: HCT 116

◢ SRX055354: HCT 116

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◣ SRX190214: HCT 116

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◢ SRX186764: K-562

◢ SRX190188: K-562

◢ CBX3: STRING
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WDR11 ↻ ≫
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NME1 ↻ ≫
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DNAJC25 ↻ ≫
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IKZF5 ↻ ≫
ACADSB ↻ ≫
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TMEM242 ↻ ≫
NDUFS3 ↻ ≫
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DRG2 ↻ ≫
FMNL3 ↻ ≫
MRPS23 ↻ ≫
PLEKHM3 ↻ ≫
COMMD2 ↻ ≫
SEC22B ↻ ≫
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LAMTOR5 ↻ ≫
FOXJ3 ↻ ≫
CCDC59 ↻ ≫
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SELENOH ↻ ≫
NOC3L ↻ ≫
TMEM41A ↻ ≫
STX18 ↻ ≫
HLTF ↻ ≫
C17orf75 ↻ ≫
AATF ↻ ≫
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INTS14 ↻ ≫
AIP ↻ ≫
CWC25 ↻ ≫
SNAP47 ↻ ≫
JMJD4 ↻ ≫
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NDUFC2 ↻ ≫
SF3B6 ↻ ≫
FAM228B ↻ ≫
MITD1 ↻ ≫
DFFB ↻ ≫
CEP104 ↻ ≫
CEP350 ↻ ≫
TSFM ↻ ≫
PPP6C ↻ ≫
TTC4 ↻ ≫
ITGB3BP ↻ ≫
EFCAB7 ↻ ≫
AP3S2 ↻ ≫
CCDC88A ↻ ≫
DCAF10 ↻ ≫
MTRNR2L2 ↻ ≫
CDIP1 ↻ ≫
MTOR ↻ ≫
BSDC1 ↻ ≫
GFM1 ↻ ≫
BNIP1 ↻ ≫
NECAP2 ↻ ≫
RPL5 ↻ ≫
GTF2H2 ↻ ≫
GTF2H2C_2 ↻ ≫
INTS5 ↻ ≫
FANCD2 ↻ ≫
DPY19L4 ↻ ≫
STXBP2 ↻ ≫
UTP3 ↻ ≫
NUP54 ↻ ≫
ZNF212 ↻ ≫
NDUFAF5 ↻ ≫
ESF1 ↻ ≫
C11orf49 ↻ ≫
CTNNB1 ↻ ≫
C8orf33 ↻ ≫
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SRFBP1 ↻ ≫
DDX18 ↻ ≫
MFF ↻ ≫
TTC26 ↻ ≫
R3HCC1 ↻ ≫
RPL38 ↻ ≫
ANKRD46 ↻ ≫
FAM133B ↻ ≫
TRMT61B ↻ ≫
GGACT ↻ ≫
DUS1L ↻ ≫
EXD2 ↻ ≫
TCERG1 ↻ ≫
ZBTB40 ↻ ≫
MTERF1 ↻ ≫
TOP3B ↻ ≫
PAFAH2 ↻ ≫
BMS1 ↻ ≫
NDUFAF1 ↻ ≫
FAM227B ↻ ≫
DTWD1 ↻ ≫
LSG1 ↻ ≫
SRRM3 ↻ ≫
LARP1 ↻ ≫
CCAR2 ↻ ≫
TUT1 ↻ ≫
NOC4L ↻ ≫
DDX51 ↻ ≫
SLC30A6 ↻ ≫
MRPL21 ↻ ≫
IGHMBP2 ↻ ≫
WASHC2C ↻ ≫
IPO4 ↻ ≫
DHX8 ↻ ≫
KIF15 ↻ ≫
KIAA1143 ↻ ≫
KLHL20 ↻ ≫
GOSR1 ↻ ≫
XKR9 ↻ ≫
LACTB2 ↻ ≫
EIF2D ↻ ≫
ZMPSTE24 ↻ ≫
AAR2 ↻ ≫
FXN ↻ ≫
UBOX5 ↻ ≫
FASTKD5 ↻ ≫
C12orf73 ↻ ≫
SLC44A1 ↻ ≫
CWF19L1 ↻ ≫
SLC35B1 ↻ ≫
DUS2 ↻ ≫
DDX28 ↻ ≫
NOL11 ↻ ≫
TRIAP1 ↻ ≫
CC2D1A ↻ ≫
C19orf57 ↻ ≫
WDR24 ↻ ≫
ZCWPW1 ↻ ≫
MEPCE ↻ ≫
ALG10 ↻ ≫
CSRNP1 ↻ ≫
RINT1 ↻ ≫
MTIF2 ↻ ≫
KRR1 ↻ ≫
TSPAN10 ↻ ≫
NPLOC4 ↻ ≫
WDR70 ↻ ≫
RBM45 ↻ ≫
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USH1G ↻ ≫
OTOP2 ↻ ≫
AGK ↻ ≫
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GIN1 ↻ ≫
LRRC37A3 ↻ ≫
CCDC86 ↻ ≫
MFAP3L ↻ ≫
SCNM1 ↻ ≫
LYSMD1 ↻ ≫
MRPL16 ↻ ≫
SECISBP2L ↻ ≫
CCDC174 ↻ ≫
WASHC5 ↻ ≫
NSMCE2 ↻ ≫
RBSN ↻ ≫
IRGM ↻ ≫
DNAJC11 ↻ ≫
ZNF791 ↻ ≫
ZNF490 ↻ ≫
ZNF579 ↻ ≫
JRK ↻ ≫
NOL7 ↻ ≫
FRG1 ↻ ≫
SLC39A3 ↻ ≫
TIMM22 ↻ ≫
NAT10 ↻ ≫
NR1H2 ↻ ≫
SAAL1 ↻ ≫
CCDC107 ↻ ≫
DHRS13 ↻ ≫
PPM1H ↻ ≫
SPOCD1 ↻ ≫
C18orf21 ↻ ≫
CDKN2AIPNL ↻ ≫
ANAPC5 ↻ ≫
PARL ↻ ≫
NAF1 ↻ ≫
RNF216 ↻ ≫
GOT2 ↻ ≫
TVP23B ↻ ≫
IPO11 ↻ ≫
NUP107 ↻ ≫
PBK ↻ ≫
CRB1 ↻ ≫
RPP14 ↻ ≫
HTD2 ↻ ≫
GTF2H2C ↻ ≫
CDC73 ↻ ≫
FAM135A ↻ ≫
ZSCAN22 ↻ ≫
TCFL5 ↻ ≫
SEMA6A ↻ ≫
PAXBP1 ↻ ≫
ALKBH3 ↻ ≫
GPAM ↻ ≫
SLC25A32 ↻ ≫
DCAF13 ↻ ≫
SRP68 ↻ ≫
MRPS31 ↻ ≫
GALK2 ↻ ≫
COPS2 ↻ ≫
ZNF609 ↻ ≫
THUMPD1 ↻ ≫
SLC25A51 ↻ ≫
DDX46 ↻ ≫
MRPL55 ↻ ≫
SPOP ↻ ≫
LARS2 ↻ ≫
TMEM222 ↻ ≫
MAGOH ↻ ≫
MOB4 ↻ ≫
RAB18 ↻ ≫
ARL8B ↻ ≫
EIF3F ↻ ≫
NLRX1 ↻ ≫
ATP5MC2 ↻ ≫
CDIPT ↻ ≫
NOP16 ↻ ≫
HIGD2A ↻ ≫
CORO1C ↻ ≫
ZNF572 ↻ ≫
ZNF280C ↻ ≫
TCTN3 ↻ ≫
ATL3 ↻ ≫
RNF166 ↻ ≫
CTU2 ↻ ≫
SLC39A11 ↻ ≫
ANGEL1 ↻ ≫
VIRMA ↻ ≫
TBL3 ↻ ≫
ZC3HC1 ↻ ≫
SNRPB2 ↻ ≫
RUVBL1 ↻ ≫
TMEM68 ↻ ≫
TGS1 ↻ ≫
POLR3B ↻ ≫
TAF1C ↻ ≫
CCNL1 ↻ ≫
TAF5 ↻ ≫
CCDC126 ↻ ≫
PSMB7 ↻ ≫
ERLIN2 ↻ ≫
PRKCE ↻ ≫
ZFR ↻ ≫
RANBP2 ↻ ≫
COIL ↻ ≫
G6PC3 ↻ ≫
SMG5 ↻ ≫
CYB5R4 ↻ ≫
TMEM101 ↻ ≫
ZNF292 ↻ ≫
NUP153 ↻ ≫
BORCS7 ↻ ≫
SMC3 ↻ ≫
ZNF721 ↻ ≫
PIGG ↻ ≫
TBC1D13 ↻ ≫
DNAJC2 ↻ ≫
NMNAT1 ↻ ≫
LZIC ↻ ≫
DNAJC19 ↻ ≫
PRRG2 ↻ ≫
NOSIP ↻ ≫
NCEH1 ↻ ≫
TXNDC9 ↻ ≫
EIF5B ↻ ≫
SPRYD7 ↻ ≫
STAT3 ↻ ≫
CENPW ↻ ≫
RPS3A ↻ ≫
TUBGCP3 ↻ ≫
PDIA5 ↻ ≫
INO80C ↻ ≫
DNAJC24 ↻ ≫
DCDC1 ↻ ≫
ACAD9 ↻ ≫
ZNF205 ↻ ≫
M1AP ↻ ≫
TATDN2 ↻ ≫
GBA ↻ ≫
PNPT1 ↻ ≫
ATP5MC3 ↻ ≫
CYRIB ↻ ≫
GORASP2 ↻ ≫
AQR ↻ ≫
DYM ↻ ≫
COX7A2 ↻ ≫
ANAPC11 ↻ ≫
ALYREF ↻ ≫
C19orf53 ↻ ≫
LEMD2 ↻ ≫
LDAH ↻ ≫
GTF2H3 ↻ ≫
EIF2B1 ↻ ≫
SMIM12 ↻ ≫
TEFM ↻ ≫
SDAD1 ↻ ≫
DDX41 ↻ ≫
NUS1 ↻ ≫
MFSD4B ↻ ≫
PSMD3 ↻ ≫
SLC35A3 ↻ ≫
ARL14EP ↻ ≫
SRSF11 ↻ ≫
LRRC40 ↻ ≫
KAT7 ↻ ≫
ZNF286A ↻ ≫
TIGD6 ↻ ≫
HMGXB3 ↻ ≫
NR1H3 ↻ ≫
ACP2 ↻ ≫
RPS14 ↻ ≫
EPRS1 ↻ ≫
HINT3 ↻ ≫
MRPS14 ↻ ≫
CUEDC2 ↻ ≫
TMEM115 ↻ ≫
RPS20 ↻ ≫
TCHP ↻ ≫
TIGD1 ↻ ≫
EIF4E2 ↻ ≫
COA3 ↻ ≫
CNTD1 ↻ ≫
CFAP20 ↻ ≫
BOD1L1 ↻ ≫
MAGOHB ↻ ≫
STEAP1B ↻ ≫
API5 ↻ ≫
VPS25 ↻ ≫
RPS13 ↻ ≫
TRIM59 ↻ ≫
SEC13 ↻ ≫
RPL27 ↻ ≫
LAMP1 ↻ ≫
FASTKD1 ↻ ≫
RANBP3 ↻ ≫
POLR2K ↻ ≫
RPS15 ↻ ≫
MTMR9 ↻ ≫
POLR2J3 ↻ ≫
YIPF2 ↻ ≫
TIMM29 ↻ ≫
UBXN6 ↻ ≫
TOR1AIP1 ↻ ≫
IFTAP ↻ ≫
TPRKB ↻ ≫
EEFSEC ↻ ≫
MRPL1 ↻ ≫
DHDDS ↻ ≫
RPL29 ↻ ≫
YJU2 ↻ ≫
NOP14 ↻ ≫
GRK4 ↻ ≫
ARHGEF12 ↻ ≫
WTAP ↻ ≫
SOD2 ↻ ≫
SH3GL1 ↻ ≫
ZSCAN30 ↻ ≫
EIF1AD ↻ ≫
BANF1 ↻ ≫
EIF3E ↻ ≫
AK2 ↻ ≫
ZNF3 ↻ ≫
RPTOR ↻ ≫
ATR ↻ ≫
TBPL1 ↻ ≫
ADPRS ↻ ≫
KPNB1 ↻ ≫
PRKACA ↻ ≫
PSMD9 ↻ ≫
HPD ↻ ≫
TMEM170A ↻ ≫
OGFOD2 ↻ ≫
RARS1 ↻ ≫
LSM5 ↻ ≫
PCBP2 ↻ ≫
C2CD5 ↻ ≫
AARS2 ↻ ≫
SLC9B1 ↻ ≫
TTC1 ↻ ≫
LRRC47 ↻ ≫
KDM3A ↻ ≫
PMPCB ↻ ≫
DPP8 ↻ ≫
FBXO38 ↻ ≫
NSA2 ↻ ≫
GFM2 ↻ ≫
GEMIN5 ↻ ≫
MCOLN1 ↻ ≫
RBM28 ↻ ≫
POLR1H ↻ ≫
DUSP6 ↻ ≫
SNRPE ↻ ≫
SCAF11 ↻ ≫
FZD1 ↻ ≫
PIGL ↻ ≫
GTPBP10 ↻ ≫
ZNF165 ↻ ≫
ALKBH2 ↻ ≫
ASB6 ↻ ≫
HNRNPA1L2 ↻ ≫
AURKAIP1 ↻ ≫
PDCD6 ↻ ≫
CNNM2 ↻ ≫
TTI2 ↻ ≫
NOS3 ↻ ≫
FAF1 ↻ ≫
EIF3G ↻ ≫
NSUN5 ↻ ≫
NUP214 ↻ ≫
MAPKAPK5 ↻ ≫
LOC112694756 ↻ ≫
TFPT ↻ ≫
PRPF31 ↻ ≫
MMUT ↻ ≫
CENPQ ↻ ≫
MMADHC ↻ ≫
MAP3K13 ↻ ≫
NUDCD1 ↻ ≫
STK25 ↻ ≫
RPL6 ↻ ≫
COPS8 ↻ ≫
PTPN11 ↻ ≫
GPR180 ↻ ≫
RTTN ↻ ≫
KNL1 ↻ ≫
INO80B ↻ ≫
MTHFD2L ↻ ≫
NEK3 ↻ ≫
KCTD5 ↻ ≫
C8orf37 ↻ ≫
PNPO ↻ ≫
UBE2Q1 ↻ ≫
C6orf89 ↻ ≫
ABLIM1 ↻ ≫
BUB1B ↻ ≫
TRAPPC9 ↻ ≫
PIKFYVE ↻ ≫
RABEP1 ↻ ≫
PPIG ↻ ≫
BUD13 ↻ ≫
POLR1F ↻ ≫
MEST ↻ ≫
MRPL12 ↻ ≫
COMMD9 ↻ ≫
C12orf43 ↻ ≫
KIF1B ↻ ≫
MAP3K7 ↻ ≫
VPS33A ↻ ≫
PPP4R3B ↻ ≫
RBM42 ↻ ≫
MIGA1 ↻ ≫
USP4 ↻ ≫
ETFDH ↻ ≫
C4orf46 ↻ ≫
ZNF268 ↻ ≫
MRPS15 ↻ ≫
ZNF670 ↻ ≫
BRF2 ↻ ≫
CEP120 ↻ ≫
SEC14L1 ↻ ≫
ADPRHL1 ↻ ≫
CAAP1 ↻ ≫
MTRNR2L8 ↻ ≫
PTCD1 ↻ ≫
CPSF4 ↻ ≫
CASC3 ↻ ≫
TSEN15 ↻ ≫
EDC4 ↻ ≫
SCAPER ↻ ≫
RRM1 ↻ ≫
SGTA ↻ ≫
TMEM167B ↻ ≫
UTP23 ↻ ≫
NDUFB7 ↻ ≫
ZNF280D ↻ ≫
PDE12 ↻ ≫
NUP133 ↻ ≫
EIF4A3 ↻ ≫
EZH1 ↻ ≫
PTPN4 ↻ ≫
SPTLC1 ↻ ≫
IQSEC3 ↻ ≫
DDX1 ↻ ≫
WDR74 ↻ ≫
FNTB ↻ ≫
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SCAP ↻ ≫
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PARK7 ↻ ≫
TDG ↻ ≫
STXBP3 ↻ ≫
RRP15 ↻ ≫
EXOSC9 ↻ ≫
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SMARCD2 ↻ ≫
SAMD4B ↻ ≫
STXBP4 ↻ ≫
COX11 ↻ ≫
SOS1 ↻ ≫
CUL2 ↻ ≫
NDUFAF6 ↻ ≫
LOC101928764 ↻ ≫
NDUFS7 ↻ ≫
AGGF1 ↻ ≫
HRH1 ↻ ≫
SNRPB ↻ ≫
TTLL12 ↻ ≫
ARMC1 ↻ ≫
HEATR1 ↻ ≫
POLR2C ↻ ≫
TRMT44 ↻ ≫
ACOX3 ↻ ≫
NCOA7 ↻ ≫
NCBP2AS2 ↻ ≫
NCBP2 ↻ ≫
TTLL11 ↻ ≫
ERCC5 ↻ ≫
SLMAP ↻ ≫
C9orf72 ↻ ≫
PRPF18 ↻ ≫
MED18 ↻ ≫
RC3H2 ↻ ≫
THAP4 ↻ ≫
ATG4B ↻ ≫
CDK12 ↻ ≫
SLC6A17 ↻ ≫
SREK1IP1 ↻ ≫
CWC27 ↻ ≫
TOMM22 ↻ ≫
MFAP3 ↻ ≫
FAM114A2 ↻ ≫
LIN54 ↻ ≫
MRPL58 ↻ ≫
HAGH ↻ ≫
FAHD1 ↻ ≫
RAD54L ↻ ≫
FANCI ↻ ≫
SSNA1 ↻ ≫
ANAPC2 ↻ ≫
GOSR2 ↻ ≫
DTD1 ↻ ≫
SPRYD4 ↻ ≫
OTUD6B ↻ ≫
FER ↻ ≫
ABT1 ↻ ≫
GRPEL2 ↻ ≫
CCNA2 ↻ ≫
ACVR1 ↻ ≫
ZNF862 ↻ ≫
TMEM208 ↻ ≫
LRRC29 ↻ ≫
FASTKD2 ↻ ≫
CCDC66 ↻ ≫
PPP6R1 ↻ ≫
CHMP7 ↻ ≫
RASAL2 ↻ ≫
RRP8 ↻ ≫
ILK ↻ ≫
NUTM1 ↻ ≫
NOP10 ↻ ≫
NOLC1 ↻ ≫
MBTPS2 ↻ ≫
PUS1 ↻ ≫
GAN ↻ ≫
HIBCH ↻ ≫
TTC32 ↻ ≫
POT1 ↻ ≫
RANBP6 ↻ ≫
PSMC1 ↻ ≫
ZNF197 ↻ ≫
SMIM8 ↻ ≫
TDP2 ↻ ≫
ACOT13 ↻ ≫
TPK1 ↻ ≫
RAB5IF ↻ ≫
MPHOSPH10 ↻ ≫
MCEE ↻ ≫
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ABCE1 ↻ ≫
TMEM132A ↻ ≫
USP37 ↻ ≫
CNOT9 ↻ ≫
SRP9 ↻ ≫
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BANP ↻ ≫
LMCD1 ↻ ≫
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COG2 ↻ ≫
CRBN ↻ ≫
RHOG ↻ ≫
STMP1 ↻ ≫
TRNAU1AP ↻ ≫
ZKSCAN4 ↻ ≫
TDRD7 ↻ ≫
AGFG1 ↻ ≫
ATP5MPL ↻ ≫
PLS1 ↻ ≫
ZNF23 ↻ ≫
DCAF8 ↻ ≫
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SEPSECS ↻ ≫
OGA ↻ ≫
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NOL9 ↻ ≫
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KSR2 ↻ ≫
TBC1D15 ↻ ≫
POLR2J ↻ ≫
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CUL4A ↻ ≫
PSMF1 ↻ ≫
PIGC ↻ ≫
UTP25 ↻ ≫
NSFL1C ↻ ≫
CA2 ↻ ≫
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LONP2 ↻ ≫
ABCC11 ↻ ≫
MRPL3 ↻ ≫
KLHL12 ↻ ≫
FAN1 ↻ ≫
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PLD3 ↻ ≫
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UGGT1 ↻ ≫
ARL14EPL ↻ ≫
MRPS33 ↻ ≫
SPRED2 ↻ ≫
THAP12 ↻ ≫
GVQW3 ↻ ≫
PGS1 ↻ ≫
CLEC16A ↻ ≫
ABRAXAS2 ↻ ≫
YTHDC1 ↻ ≫
BET1 ↻ ≫
RNF43 ↻ ≫
BOLA1 ↻ ≫
MKRN3 ↻ ≫
TTC14 ↻ ≫
PINX1 ↻ ≫
EXOSC6 ↻ ≫
STK38L ↻ ≫
MED4 ↻ ≫
MIA3 ↻ ≫
TRMT10C ↻ ≫
ATG5 ↻ ≫
RAB4A ↻ ≫
MTBP ↻ ≫
MRPL13 ↻ ≫
ILF2 ↻ ≫
MRPL10 ↻ ≫
LRRC46 ↻ ≫
NUP155 ↻ ≫
CPPED1 ↻ ≫
LTA4H ↻ ≫
TSSC4 ↻ ≫
RPL22 ↻ ≫
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GTF2H1 ↻ ≫
RMND1 ↻ ≫
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RFFL ↻ ≫
KRAS ↻ ≫
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MRM3 ↻ ≫
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VPS4A ↻ ≫
PPRC1 ↻ ≫
MAGEA2B ↻ ≫
MAGEA2 ↻ ≫
GNAL ↻ ≫
ATP6V1C1 ↻ ≫
CHMP1B ↻ ≫
CEP295 ↻ ≫
MKRN1 ↻ ≫
SNRPD3 ↻ ≫
GUCD1 ↻ ≫
SNRPD1 ↻ ≫
TMEM259 ↻ ≫
YARS1 ↻ ≫
S100PBP ↻ ≫
E2F4 ↻ ≫
TMA16 ↻ ≫
GTF2B ↻ ≫
PPA2 ↻ ≫
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ILF3 ↻ ≫
SLX1B ↻ ≫
SLX1A ↻ ≫
BOLA2B ↻ ≫
BOLA2 ↻ ≫
DFFA ↻ ≫
EFTUD2 ↻ ≫
CCDC103 ↻ ≫
RHBDD1 ↻ ≫
C16orf91 ↻ ≫
SUGCT ↻ ≫
MPLKIP ↻ ≫
PTP4A2 ↻ ≫
GSR ↻ ≫
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STAG1 ↻ ≫
TRAM1 ↻ ≫
POLG ↻ ≫
SF3B5 ↻ ≫
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SUPT5H ↻ ≫
VMP1 ↻ ≫
PTRH2 ↻ ≫
ADPGK ↻ ≫
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ZNF554 ↻ ≫
CCNT1 ↻ ≫
TRAPPC8 ↻ ≫
TOMM6 ↻ ≫
VWA5B2 ↻ ≫
ATG4C ↻ ≫
ZNF169 ↻ ≫
ZNF562 ↻ ≫
E2F6 ↻ ≫
STOML2 ↻ ≫
ALS2 ↻ ≫
PSMD12 ↻ ≫
ZNF148 ↻ ≫
ERLEC1 ↻ ≫
ASB3 ↻ ≫
MRPL40 ↻ ≫
HIRA ↻ ≫
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