ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for CBX5

Query protein: CBX5
Cell class: Bone
Sort key: SRX6680395 | HT-1080
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs CBX5's Colocalization partners

◢ CBX5: Average

◣ SRX6680395: HT-1080

◢ SRX6680401: HT-1080

◢ CBX5: STRING

HT-1080
 SRX6680395
CBX5
↻ ≫
HT-1080
 SRX6680401
CBX5
↻ ≫
SU-DHL-1
 SRX4394544
STAT3
↻ ≫
TC-71
 SRX4155874
CTCFL
↻ ≫
U2OS
 ERX2734536
LIG4
↻ ≫
Chondrocytes
 SRX7587159
FOXO1
↻ ≫
U2OS
 SRX7223845
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX7223843
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX7223842
CTCF
↻ ≫
TC-32
 SRX4155865
CTCFL
↻ ≫
U2OS
 SRX3638910
RELA
↻ ≫
TC-32
 SRX4155866
CTCFL
↻ ≫
TC-71
 SRX4155873
CTCFL
↻ ≫
U2OS
 SRX2378773
NELFE
↻ ≫
Chondrocytes
 SRX7587158
FOXO1
↻ ≫
U2OS
 ERX2734534
TP53BP1
↻ ≫
U2OS
 ERX2734533
TP53BP1
↻ ≫
U2OS
 ERX2734532
TP53BP1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380669
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380668
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380653
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380652
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380651
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380650
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380649
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380648
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380647
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380646
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380645
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX8380644
ESR1
↻ ≫
Chondrocytes
 SRX7587157
FOXO1
↻ ≫
U2OS
 SRX7223844
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX7223841
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX7223840
CTCF
↻ ≫
SKMNC
 SRX718122
WDR5
↻ ≫
SKMNC
 SRX718117
FLI1
↻ ≫
U2OS
 SRX7050993
PPP1R10
↻ ≫
U2OS
 SRX7050992
PPP1R10
↻ ≫
U2OS
 SRX690824
HSF1
↻ ≫
U2OS
 SRX690823
HSF1
↻ ≫
HT-1080
 SRX6680397
CTCF
↻ ≫
HT-1080
 SRX6680391
CTCF
↻ ≫
MG-63
 SRX5975315
CDK12
↻ ≫
MG-63
 SRX5975310
CDK12
↻ ≫
143B
 SRX5975305
CDK12
↻ ≫
143B
 SRX5975300
CDK12
↻ ≫
U2OS
 SRX5702148
PPP1R10
↻ ≫
U2OS
 SRX5702147
PPP1R10
↻ ≫
U2OS
 SRX5702146
PPP1R10
↻ ≫
A-673
 SRX5620954
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX5620953
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX5620952
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX5620951
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX5620950
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX5620949
FLI1
↻ ≫
U2OS
 SRX5062485
SUPT5H
↻ ≫
U2OS
 SRX5062484
SUPT5H
↻ ≫
U2OS
 SRX5062476
SUPT5H
↻ ≫
U2OS
 SRX5062475
SUPT5H
↻ ≫
HT-1080
 SRX5001397
CTCF
↻ ≫
HT-1080
 SRX5001396
CTCF
↻ ≫
HT-1080
 SRX5001395
CTCF
↻ ≫
HT-1080
 SRX5001394
CTCF
↻ ≫
A-673
 SRX4680620
MYBL2
↻ ≫
SU-DHL-1
 SRX4394546
CEBPB
↻ ≫
SU-DHL-1
 SRX4394545
CEBPB
↻ ≫
SU-DHL-1
 SRX4394543
STAT3
↻ ≫
U2OS
 SRX4169276
SUPT5H
↻ ≫
U2OS
 SRX4169275
SUPT5H
↻ ≫
U2OS
 SRX4169274
SUPT5H
↻ ≫
TC-71
 SRX4155880
SMC1A
↻ ≫
TC-71
 SRX4155879
SMC1A
↻ ≫
TC-32
 SRX4155872
SMC1A
↻ ≫
TC-32
 SRX4155871
SMC1A
↻ ≫
U2OS
 SRX4107936
CUL4A
↻ ≫
U2OS
 SRX4107934
DTL
↻ ≫
U2OS
 SRX3797281
ZNF768
↻ ≫
U2OS
 SRX3797280
ZNF768
↻ ≫
U2OS
 SRX3721452
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX3721451
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX3721450
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX3638911
RELA
↻ ≫
U2OS
 SRX3638909
RELA
↻ ≫
U2OS
 SRX3638908
RELA
↻ ≫
U2OS
 SRX3638907
RELA
↻ ≫
Saos-2
 SRX361198
TP53
↻ ≫
A-673
 SRX3591009
MEIS1
↻ ≫
U2OS
 SRX351403
ZBTB17
↻ ≫
U2OS
 SRX351402
ZBTB17
↻ ≫
U2OS
 SRX351401
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX351400
MYC
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436567
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436566
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436565
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436564
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436563
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436562
SSRP1
↻ ≫
HT-1080
 SRX3436561
SSRP1
↻ ≫
A-673
 SRX3394534
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX3394533
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX3394532
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX3394525
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX3394524
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX3394523
FLI1
↻ ≫
U2OS
 SRX3235585
FANCD2
↻ ≫
U2OS
 SRX3235584
FANCD2
↻ ≫
U2OS
 SRX316959
ZMYND11
↻ ≫
U2OS
 SRX316958
ZMYND11
↻ ≫
U2OS
 SRX316957
ZMYND11
↻ ≫
Chondrosarcoma
 SRX2990554
GLI2
↻ ≫
Chondrosarcoma
 SRX2990553
GLI1
↻ ≫
Chondrocytes
 SRX2941476
PBXIP1
↻ ≫
Chondrocytes
 SRX2941475
PBXIP1
↻ ≫
U2OS
 SRX2940750
TP53
↻ ≫
A-673
 SRX2913028
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX2913027
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX2913026
FLI1
↻ ≫
A-673
 SRX2913025
FLI1
↻ ≫
HOS
 SRX2842450
FOSL1
↻ ≫
HOS
 SRX2842449
FOS
↻ ≫
MG-63
 SRX2842448
FOSL1
↻ ≫
MG-63
 SRX2842447
FOS
↻ ≫
MG-63
 SRX2842446
FOSL1
↻ ≫
MG-63
 SRX2842445
FOS
↻ ≫
143B
 SRX2842444
FOSL1
↻ ≫
143B
 SRX2842443
FOS
↻ ≫
MNNG
 SRX2842442
FOSL1
↻ ≫
MNNG
 SRX2842441
FOS
↻ ≫
U2OS
 SRX275506
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX275504
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX275502
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX275500
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX2652451
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652450
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652449
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652448
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652447
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652446
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652445
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX2652444
ZBTB48
↻ ≫
U2OS
 SRX256883
NR3C1
↻ ≫
U2OS
 SRX256880
NR3C1
↻ ≫
U2OS
 SRX256879
NR3C1
↻ ≫
U2OS
 SRX256867
NR3C1
↻ ≫
HT-1080
 SRX246954
ERCC2
↻ ≫
HT-1080
 SRX246953
ERCC3
↻ ≫
U2OS
 SRX2400577
RAD51
↻ ≫
U2OS
 SRX2400576
RAD51
↻ ≫
U2OS
 SRX2400575
RAD51
↻ ≫
U2OS
 SRX2400574
RAD51
↻ ≫
U2OS
 SRX2400573
RAD51
↻ ≫
U2OS
 SRX2378771
NELFE
↻ ≫
U2OS
 SRX235055
CRY1
↻ ≫
U2OS
 SRX235054
CLOCK
↻ ≫
U2OS
 SRX235053
ARNTL
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX2268292
CHD1
↻ ≫
U2OS
 SRX2236973
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX2188691
BRCA1
↻ ≫
U2OS
 SRX2188690
BRCA1
↻ ≫
EWS502
 SRX2188679
BRCA1
↻ ≫
EWS502
 SRX2188678
BRCA1
↻ ≫
TC-32
 SRX2188673
BRCA1
↻ ≫
TC-32
 SRX2188672
BRCA1
↻ ≫
HT-1080
 SRX2143793
MEN1
↻ ≫
HT-1080
 SRX2143792
MYC
↻ ≫
SJSA-1
 SRX2060925
TP53
↻ ≫
SJSA-1
 SRX2060924
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX1995013
HIF1A
↻ ≫
U2OS
 SRX1995012
HIF1A
↻ ≫
U2OS
 SRX1995011
HIF1A
↻ ≫
U2OS
 SRX1995010
HIF1A
↻ ≫
U2OS
 SRX1995009
ARNTL
↻ ≫
U2OS
 SRX1995008
ARNTL
↻ ≫
U2OS
 SRX1995007
ARNTL
↻ ≫
U2OS
 SRX1995006
ARNTL
↻ ≫
HT-1080
 SRX1961296
VRK1
↻ ≫
U2OS
 SRX188793
SIRT3
↻ ≫
U2OS
 SRX188792
SIRT3
↻ ≫
U2OS
 SRX188790
SIRT3
↻ ≫
U2OS
 SRX188788
SIRT3
↻ ≫
Osteobl
 SRX186710
EP300
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823818
STAT3
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823817
STAT3
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823816
TEAD1
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823815
TEAD1
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823814
JUND
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823813
JUND
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823812
FOSL2
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823811
FOSL2
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823810
CEBPB
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823809
CEBPB
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823802
BRD4
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823801
BRD4
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823800
BRD4
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823799
BRD4
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823798
BRD4
↻ ≫
Osteoblasts
 SRX1823797
BRD4
↻ ≫
U2OS
 SRX1722157
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1722156
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1552473
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1552472
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1550252
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1550251
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1550250
MYC
↻ ≫
U2OS
 SRX1550249
MYC
↻ ≫
Saos-2
 SRX1533883
CBFB
↻ ≫
Saos-2
 SRX1533882
RUNX2
↻ ≫
U2OS
 SRX150666
TRIM28
↻ ≫
U2OS
 SRX150537
SETDB1
↻ ≫
U2OS
 SRX149221
FOXM1
↻ ≫
U2OS
 SRX149220
FOXM1
↻ ≫
U2OS
 SRX1393088
CLOCK
↻ ≫
U2OS
 SRX1393087
CLOCK
↻ ≫
U2OS
 SRX1393086
ARNTL
↻ ≫
U2OS
 SRX1393085
ARNTL
↻ ≫
U2OS
 SRX1304828
MED26
↻ ≫
U2OS
 SRX1304827
MED26
↻ ≫
U2OS
 SRX1304817
EP400
↻ ≫
U2OS
 SRX1304816
EP400
↻ ≫
U2OS
 SRX1304815
EP400
↻ ≫
U2OS
 SRX1034772
HIF1A
↻ ≫
U2OS
 SRX1034771
ARNTL
↻ ≫
Osteobl
 SRX067535
CTCF
↻ ≫
U2OS
 SRX065554
TRIM28
↻ ≫
U2OS
 SRX036641
NCOA1
↻ ≫
U2OS
 SRX036640
NCOA1
↻ ≫
U2OS
 SRX036638
NCOA1
↻ ≫
U2OS
 SRX036637
NCOA1
↻ ≫
U2OS
 SRX036636
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX036635
ESR1
↻ ≫
U2OS
 SRX020769
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020768
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020767
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020766
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020765
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020764
TP53
↻ ≫
U2OS
 SRX020507
ESR2
↻ ≫
U2OS
 SRX020506
ESR2
↻ ≫
Saos-2
 SRX016980
TP53
↻ ≫
Saos-2
 SRX016979
TP53
↻ ≫
Saos-2
 SRX016978
TP73
↻ ≫
Saos-2
 SRX016977
TP73
↻ ≫
Saos-2
 SRX016976
TP73
↻ ≫
Saos-2
 SRX016975
TP73
↻ ≫
U2OS
 ERX2734535
LIG4
↻ ≫
U2OS
 ERX1981983
BRD3
↻ ≫
U2OS
 ERX1981982
BRD3
↻ ≫
U2OS
 ERX1981981
BRD3
↻ ≫
U2OS
 ERX1831867
CTCF
↻ ≫
Saos-2
 ERX181469
TP53
↻ ≫
Saos-2
 ERX181468
TP53
↻ ≫
Saos-2
 ERX181467
TP53
↻ ≫
Saos-2
 ERX181466
TP53
↻ ≫
Saos-2
 ERX181465
TP53
↻ ≫
U2OS
 ERX177106
RAD51
↻ ≫
U2OS
 ERX177105
RAD51
↻ ≫
U2OS
 ERX177103
XRCC4
↻ ≫
U2OS
 ERX177102
XRCC4
↻ ≫
U2OS
 ERX1025941
FOXJ3
↻ ≫