ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Gonad
Sort key: SRX3584198 | Epididymis
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX3584196: Epididymis

◢ SRX3584197: Epididymis

◣ SRX3584198: Epididymis

◢ SRX3584199: Epididymis

◢ RUNX1: STRING

Epididymis
 SRX3584198
RUNX1
Epididymis
 SRX3584199
RUNX1
A2780
 SRX5673030
TP53
A2780
 SRX5673029
TP53
Epididymis
 SRX3584197
RUNX1
Epididymis
 SRX3584196
RUNX1
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068571
SMARCC1
SK-OV-3
 SRX4240288
ESR1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473669
SMARCA4
OVCAR-5
 SRX530920
YAP1
SK-OV-3
 SRX4240291
ESR1
SK-OV-3
 SRX4240290
ESR1
KGN
 SRX6957482
SMAD4
KGN
 SRX6957478
SMAD4
RMG-I
 SRX4704621
ARID1A
RMG-I
 SRX3241380
ARID1A
RMG-I
 SRX3241379
ARID1A
Testis
 SRX2966972
PAX5
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068578
KMT2D
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068577
KMT2D
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068576
KMT2D
RMG-I
 SRX4704629
SMARCB1
RMG-I
 SRX4704628
SMARCB1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473692
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473691
SMARCA4
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473687
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473685
SMARCA4
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473682
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473680
SMARCA4
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473678
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473676
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473672
SMARCC1
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473671
SMARCA4
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473693
ARID2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473686
ARID2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473683
ARID2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473673
ARID2
Epididymis
 SRX3584195
AR
Epididymis
 SRX3584194
AR
Epididymis
 SRX3584193
AR
Epididymis
 SRX3584192
AR
OVCAR-3
 SRX8803194
MYC
A2780
 SRX7565922
CTCF
A2780
 SRX7565921
CTCF
KGN
 SRX6957483
SMAD2
KGN
 SRX6957481
FOXL2
KGN
 SRX6957479
SMAD2
KGN
 SRX6957477
FOXL2
KGN
 SRX6957431
FOXL2
KGN
 SRX6957430
FOXL2
KGN
 SRX6957429
FOXL2
Tcam-2
 SRX5771674
SOX17
Tcam-2
 SRX5771672
SOX17
Tcam-2
 SRX5771670
SOX17
N2102Ep
 SRX5771668
SOX2
N2102Ep
 SRX5771666
SOX2
N2102Ep
 SRX5771664
SOX2
A2780
 SRX5673034
EGR1
A2780
 SRX5673033
EGR1
A2780
 SRX5673032
ISL1
A2780
 SRX5673031
ISL1
SVOG-3e
 SRX5342377
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342376
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342375
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342374
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342373
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342372
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342369
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342368
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342367
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342366
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342365
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342364
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342363
FOXL2
SVOG-3e
 SRX5342362
FOXL2
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068575
KMT2C
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068574
KMT2C
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068573
KMT2C
Small cell ovary carcinoma
 SRX5068572
DPF2
RMG-I
 SRX4704623
NCAPH2
RMG-I
 SRX4704622
NCAPH2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473695
SS18
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473694
DPF2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473689
DPF2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473688
SS18
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473684
DPF2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473681
SS18
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473679
DPF2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473677
DPF2
Small cell ovary carcinoma
 SRX4473674
SS18
SK-OV-3
 SRX4240295
CTBP1
SK-OV-3
 SRX4240294
CTBP1
SK-OV-3
 SRX4240292
CTBP1
Epididymis
 SRX3584203
CEBPB
Epididymis
 SRX3584202
CEBPB
Epididymis
 SRX3584201
CEBPB
Epididymis
 SRX3584200
CEBPB
OVCAR-8
 SRX3033232
ETS1
HEYA8
 SRX3033231
ETS1
Testis
 SRX2966973
PRDM1
Testis
 SRX2966969
POU5F1
Testis
 SRX2966968
POU5F1
A-1847
 SRX2610698
EZH2
A-1847
 SRX2610695
EZH2
SK-OV-3
 SRX2012084
CTCF
JHOS-4
 SRX1678214
PAX8
OVSAHO
 SRX1678212
PAX8
KURAMOCHI
 SRX1678210
PAX8
OVCAR-3
 SRX1560785
BRD4
OVCAR-3
 SRX1560784
BRD4
Caput epididymis
 SRX1503375
HNF1A
Caput epididymis
 SRX1503373
HNF1A
PEO1
 SRX1099628
GRHL2
OvCA 429
 SRX1099627
GRHL2
OVCAR-3
 SRX1099626
GRHL2
OVCAR-8
 SRX1091822
CTCFL
OVCAR-8
 SRX1091821
CTCF